Chordin-like 1 - Chordin-like 1

CHRDL1
Identifikátory
Aliasy	CHRDL1, chordin like 1, CHL, MGC1, MGCN, NRLN1, VOPT, dA141H5.1, chordin like 1
Externí ID	OMIM: 300350 MGI: 1933172 HomoloGene: 12834 Genové karty: CHRDL1
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	110,795,819 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	143,394,262 bp
Ortology
	91851
	83453
	ENSG00000101938
	ENSMUSG00000031283
	Q9BU40
	Q920C1
	NM_001143981; NM_001143982; NM_001143983; NM_145234
	NM_001114385; NM_031258; NM_001358592
NP_001137453; NP_001137454; NP_001137455; NP_660277; NP_001354133;
	NP_001354134; NP_001354135; NP_001354136; NP_001354137; NP_001354138
	NP_001107857; NP_112548; NP_001345521
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Chordin-like 1 je protein že u lidí je kódován CHRDL1 gen.^[5] Chordin-Like 1 (CHRDL1) je strukturní glykoprotein, který sedí na chromozomu X a specificky kóduje venotropin, který je antagonistickým proteinem vůči kostnímu morfogennímu proteinu 4.^[6]

Funkce

Tento gen kóduje antagonistu kostní morfogenetický protein 4. Kódovaný protein může hrát roli v topografické retinotektální projekci a v regulaci sítnice angiogeneze v reakci na hypoxie. Alternativně sestříhané byly popsány varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[5]

CHRDL1 hraje důležitou roli v procesech, jako je diferenciace embryonálních buněk, osteogeneze, neurogeneze, potlačení nádorů a metastáz a tvorba sítnice.^[7]^[8] Nejvyšší exprese tohoto genu se nachází v segmentu předního oka a sítnici, stejně jako v mozečku a neokortexu.^[6] V neokortexu vrcholí v době zrání synapsí, aby byla umožněna správná synaptická tvorba.^[9] Proto je tento gen důležitý pro správnou tvorbu centrálního nervového systému a očí.

Klinický význam

Mutace v CHRDL1 jsou spojeny s Neuhäuserův syndrom, X-vázaná megalocornea a centrální tloušťka rohovky.^[10]

Mutace v tomto genu mohou mít různé účinky na výše uvedené procesy. Jedním z možných výsledků mutace CHRDL1 je nesyndromová megalocornea vázaná na X (XMC), která je výsledkem mutace genu typu missense, nonsense nebo frameshift.^[6] XMC je zvětšení předních segmentů oka, které může vést k dalším problémům, jako je katarakta a glaukom.^[6] Dalším možným výsledkem je karcinogenní tvorba. Protože CHRDL1 je supresor nádoru a metastáz, může mutace v tomto genu vést k tvorbě nádorových buněk.^[8] Nejvýznamnější účinek, který by mutace mohla mít, je na synaptickou stabilizaci. Vzhledem k tomu, že gen omezuje synaptickou plasticitu, může mutace způsobit problémy se správným zráním synapsí, což vede k řadě neurologických poruch.^[9] V současné době existuje knockoutový model pro tento gen, který ukazuje, že narušení může způsobit změněné synaptické události a snížené synaptické GluA2 AMPAR vedoucí ke snížené plasticitě.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101938 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031283 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: Chordin-like 1“. Citováno 2014-08-06.
^ ^A ^b ^C ^d Pfirrmann T, Emmerich D, Ruokonen P, Quandt D, Buchen R, Fischer-Zirnsak B a kol. (Červen 2015). "Molekulární mechanismus CHRDL1 zprostředkované X-vázané megalocornea u lidí a v modelu Xenopus". Lidská molekulární genetika. 24 (11): 3119–32. doi:10,1093 / hmg / ddv063. PMID 25712132.
^ Liu T, Li B, Zheng XF, Jiang SD, Zhou ZZ, Xu WN a kol. (2019). „Chordin-Like 1 zlepšuje osteogenezi mezenchymálních kmenových buněk kostní dřeně zlepšením dráhy BMP4-SMAD“. Hranice v endokrinologii. 10: 360. doi:10.3389 / fendo.2019.00360. PMC 6582276. PMID 31249554.
^ ^A ^b Pei YF, Zhang YJ, Lei Y, Wu WD, Ma TH, Liu XQ (duben 2017). „Hypermethylace promotoru CHRDL1 indukuje proliferaci a metastázy aktivací Akt a Erk u rakoviny žaludku“. Cílový cíl. 8 (14): 23155–23166. doi:10.18632 / oncotarget.15513. PMC 5410293. PMID 28423564.
^ ^A ^b ^C Blanco-Suarez E, Liu TF, Kopelevich A, Allen NJ (prosinec 2018). "Astrocyty vylučovaný chordin-like 1 řídí synapse zrání a omezuje plasticitu zvýšením synaptických receptorů GluA2 AMPA". Neuron. 100 (5): 1116–1132.e13. doi:10.1016 / j.neuron.2018.09.043. PMC 6382071. PMID 30344043.
^ Davidson AE, Cheong SS, Hysi PG, Venturini C, Plagnol V, Ruddle JB a kol. (2014). „Sdružení mutací a variant CHRDL1 s X-vázanou megalocornea, Neuhäuserovým syndromem a centrální tloušťkou rohovky“. PLOS ONE. 9 (8): e104163. Bibcode:2014PLoSO ... 9j4163D. doi:10.1371 / journal.pone.0104163. PMC 4122416. PMID 25093588.

Další čtení

Sakuta H, Suzuki R, Takahashi H, Kato A, Shintani T, Yamamoto TS a kol. (Červenec 2001). „Ventroptin: antagonista BMP-4 vyjádřený ve dvojitém gradientu v sítnici“. Věda. 293 (5527): 111–5. doi:10.1126 / science.1058379. PMID 11441185.
Webb TR, Matarin M, Gardner JC, Kelberman D, Hassan H, Ang W a kol. (Únor 2012). „Megalocornea vázaná na X způsobená mutacemi v CHRDL1 identifikuje zásadní roli ventroptinu ve vývoji předního segmentu“. American Journal of Human Genetics. 90 (2): 247–59. doi:10.1016 / j.ajhg.2011.12.019. PMC 3276677. PMID 22284829.
Kane R, Godson C, O'Brien C (červen 2008). „Chordin-like 1, antagonista kostního morfogenetického proteinu-4, je upregulován hypoxií v lidských retinálních pericytech a hraje roli v regulaci angiogeneze“. Molekulární vidění. 14: 1138–48. PMC 2435163. PMID 18587495.
Fernandes H, Dechering K, van Someren E, Steeghs I, Apotheker M, Mentink A a kol. (2010). "Vliv chordin-like 1 na MC3T3-E1 a lidské mezenchymální kmenové buňky". Buňky Tkáňové orgány. 191 (6): 443–52. doi:10.1159/000281825. PMID 20130390.
Consortium pro koronární arteriální onemocnění (C4D) (březen 2011). „Celomanomová asociační studie u Evropanů a Jihoasijců identifikovala pět nových lokusů pro onemocnění koronárních tepen“. Genetika přírody. 43 (4): 339–44. doi:10,1038 / ng.782. PMID 21378988.
Larman BW, Karolak MJ, Adams DC, Oxburgh L (květen 2009). „Chordin-like 1 a zkroucená gastrulace 1 regulují signalizaci BMP po poranění ledvin“. Časopis Americké nefrologické společnosti. 20 (5): 1020–31. doi:10.1681 / ASN.2008070768. PMC 2678041. PMID 19357253.
Coffinier C, Tran U, Larraín J, De Robertis EM (leden 2001). „Neuralin-1 je nová molekula související s Chordinem exprimovaná v myší neurální desce“. Mechanismy rozvoje. 100 (1): 119–22. doi:10.1016 / s0925-4773 (00) 00507-4. PMID 11118896.
Gazzerro E, Canalis E (červen 2006). "Kostní morfogenetické proteiny a jejich antagonisté". Recenze v sekci Endokrinní a metabolické poruchy. 7 (1–2): 51–65. doi:10.1007 / s11154-006-9000-6. PMID 17029022.
Chen D, Zhao M, Mundy GR (prosinec 2004). "Kostní morfogenetické proteiny". Faktory růstu. 22 (4): 233–41. doi:10.1080/08977190412331279890. PMID 15621726.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na člověka X chromozom a / nebo související protein je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101938 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031283 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: Chordin-like 1“. Citováno 2014-08-06.

[:0-6] A ^b ^C ^d Pfirrmann T, Emmerich D, Ruokonen P, Quandt D, Buchen R, Fischer-Zirnsak B a kol. (Červen 2015). "Molekulární mechanismus CHRDL1 zprostředkované X-vázané megalocornea u lidí a v modelu Xenopus". Lidská molekulární genetika. 24 (11): 3119–32. doi:10,1093 / hmg / ddv063. PMID 25712132.

[7] Liu T, Li B, Zheng XF, Jiang SD, Zhou ZZ, Xu WN a kol. (2019). „Chordin-Like 1 zlepšuje osteogenezi mezenchymálních kmenových buněk kostní dřeně zlepšením dráhy BMP4-SMAD“. Hranice v endokrinologii. 10: 360. doi:10.3389 / fendo.2019.00360. PMC 6582276. PMID 31249554.

[:1-8] A ^b Pei YF, Zhang YJ, Lei Y, Wu WD, Ma TH, Liu XQ (duben 2017). „Hypermethylace promotoru CHRDL1 indukuje proliferaci a metastázy aktivací Akt a Erk u rakoviny žaludku“. Cílový cíl. 8 (14): 23155–23166. doi:10.18632 / oncotarget.15513. PMC 5410293. PMID 28423564.

[:2-9] A ^b ^C Blanco-Suarez E, Liu TF, Kopelevich A, Allen NJ (prosinec 2018). "Astrocyty vylučovaný chordin-like 1 řídí synapse zrání a omezuje plasticitu zvýšením synaptických receptorů GluA2 AMPA". Neuron. 100 (5): 1116–1132.e13. doi:10.1016 / j.neuron.2018.09.043. PMC 6382071. PMID 30344043.

[pmid25093588-10] Davidson AE, Cheong SS, Hysi PG, Venturini C, Plagnol V, Ruddle JB a kol. (2014). „Sdružení mutací a variant CHRDL1 s X-vázanou megalocornea, Neuhäuserovým syndromem a centrální tloušťkou rohovky“. PLOS ONE. 9 (8): e104163. Bibcode:2014PLoSO ... 9j4163D. doi:10.1371 / journal.pone.0104163. PMC 4122416. PMID 25093588.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]