WD protein obsahující opakování 77 - WD repeat-containing protein 77

WDR77
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4GQB, 4X60, 4X61, 4X63, 5 EMJ, 5EML, 5EMM, 5FA5, 5EMK, 5C9Z
Identifikátory
Aliasy	WDR77, MEP-50, MEP50, Nbla10071, p44, p44 / Mep50, HKMT1069, doména opakování WD 77
Externí ID	OMIM: 611734 MGI: 1917715 HomoloGene: 11466 Genové karty: WDR77
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	111,449,256 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	105,970,037 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba methyl-CpG; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita koaktivátoru transkripce nukleárního receptoru závislá na ligandu; • aktivita protein-arginin N-methyltransferázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • Golgiho aparát; • methylosom; • nukleoplazma; • buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • sekreční columnal luminární epiteliální buněčná diferenciace podílející se na vývoji prostaty žlázového acinu; • negativní regulace proliferace epiteliálních buněk podílející se na vývoji prostaty; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • negativní regulace buněčné proliferace; • peptidyl-arginin N-methylace; • pozitivní regulace transkripce templátované nukleovou kyselinou; • sestava spliceosomal snRNP;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	79084
	70465
	ENSG00000116455
	ENSMUSG00000000561
	Q9BQA1
	Q99J09
	NM_024102; NM_001317062; NM_001317063; NM_001317064
	NM_027432
	NP_001303991; NP_001303992; NP_001303993; NP_077007
	NP_081708
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Methylosomový protein 50 je protein že u lidí je kódován WDR77 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

Ukázalo se, že protein 77 obsahující protein WD komunikovat s CTDP1^[8] a Protein arginin methyltransferáza 5.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116455 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000561 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Friesen WJ, Wyce A, Paushkin S, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (březen 2002). „Nová WD opakovaná proteinová složka methylosomu váže proteiny Sm“. J Biol Chem. 277 (10): 8243–7. doi:10,1074 / jbc.M109984200. PMID 11756452.
^ Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (červen 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anal Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
^ „Entrez Gene: WDR77 WD opakovaná doména 77“.
^ Licciardo, Paolo; Amente Stefano; Ruggiero Luca; Monti Maria; Pucci Piero; Lania Luigi; Majello Barbara (únor 2003). „Fosfatáza FCP1 interaguje s RNA polymerázou II a s MEP50, složkou methylosomového komplexu zapojeného do sestavování snRNP“. Nucleic Acids Res. Anglie. 31 (3): 999–1005. doi:10.1093 / nar / gkg197. PMC 149217. PMID 12560496.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Yu W, Andersson B, Worley KC a kol. (1997). "Velké zřetězení cDNA sekvenování". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Licciardo P, Amente S, Ruggiero L a kol. (2003). „Fosfatáza FCP1 interaguje s RNA polymerázou II a s MEP50, složkou methylosomového komplexu zapojeného do sestavování snRNP“. Nucleic Acids Res. 31 (3): 999–1005. doi:10.1093 / nar / gkg197. PMC 149217. PMID 12560496.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Yamada S, Ohira M, Horie H a kol. (2004). „Profily exprese a diferenciální screening mezi hepatoblastomy a odpovídajícími normálními játry: identifikace vysoké exprese onkogenu PLK1 jako špatně prognostického indikátoru hepatoblastomů“. Onkogen. 23 (35): 5901–11. doi:10.1038 / sj.onc.1207782. PMID 15221005.
Jin J, Smith FD, Stark C a kol. (2004). "Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Amente S, Napolitano G, Licciardo P a kol. (2005). „Identifikace proteinů interagujících s RNAPII FCP1 fosfatázou: FCP1 tvoří komplex s argininmethyltransferázou PRMT5 a je substrátem pro methylaci zprostředkovanou PRMT5“. FEBS Lett. 579 (3): 683–9. doi:10.1016 / j.febslet.2004.12.045. PMID 15670829.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE a kol. (2006). „Sekvence DNA a biologická anotace lidského chromozomu 1“. Příroda. 441 (7091): 315–21. Bibcode:2006 Natur.441..315G. doi:10.1038 / nature04727. PMID 16710414.
Furuno K, Masatsugu T, Sonoda M a kol. (2006). „Sdružení skupiny Polycomb SUZ12 s proteinem WD-repeat MEP50, který se váže na histon H2A selektivně in vitro“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 345 (3): 1051–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.05.014. PMID 16712789.
Zhou L, Wu H, Lee P, Wang Z (2007). "Role androgenového receptoru kofaktoru p44 v růstu buněk epitelu prostaty". J. Mol. Endokrinol. 37 (2): 283–300. doi:10.1677 / jme.1.02062. PMID 17032745.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
Liang JJ, Wang Z, Chiriboga L a kol. (2007). „Exprese a funkce koaktivátoru androgenového receptoru p44 a proteinu arginin methyltransferázy 5 ve vyvíjejících se varlatách a testikulárních nádorech“. J. Urol. 177 (5): 1918–22. doi:10.1016 / j.juro.2007.01.017. PMID 17437848.

Rengasamy, M, Zhang, F, Vashisht, A, Song, WM a kol. (2017). „Komplex PRMT5 / WDR77 reguluje alternativní sestřih prostřednictvím ZNF326 u rakoviny prsu“. Nucleic Acids Res. 45 (19): 11106–11120. doi:10.1093 / nar / gkx727. PMID 28977470.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9BQA1 (Methylosome protein 50) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116455 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000561 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11756452-5] A ^b Friesen WJ, Wyce A, Paushkin S, Abel L, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (březen 2002). „Nová WD opakovaná proteinová složka methylosomu váže proteiny Sm“. J Biol Chem. 277 (10): 8243–7. doi:10,1074 / jbc.M109984200. PMID 11756452.

[pmid8619474-6] Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (červen 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anal Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.

[entrez-7] „Entrez Gene: WDR77 WD opakovaná doména 77“.

[pmid12560496-8] Licciardo, Paolo; Amente Stefano; Ruggiero Luca; Monti Maria; Pucci Piero; Lania Luigi; Majello Barbara (únor 2003). „Fosfatáza FCP1 interaguje s RNA polymerázou II a s MEP50, složkou methylosomového komplexu zapojeného do sestavování snRNP“. Nucleic Acids Res. Anglie. 31 (3): 999–1005. doi:10.1093 / nar / gkg197. PMC 149217. PMID 12560496.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]