CRMP1 - CRMP1 - Wikipedia

CRMP1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4B3Z
Identifikátory
Aliasy	CRMP1, CRMP-1, DPYSL1, DRP-1, DRP1, ULIP-3, protein mediátoru odpovědi na kolapsin 1
Externí ID	OMIM: 602462 MGI: 107793 HomoloGene: 20347 Genové karty: CRMP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	5,893,086 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	37,292,133 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy; • aktivita hydrolázy, působící na vazby uhlík-dusík (ale ne peptid); • vazba filaminu;
Buněčná složka	• vřeteno; • cytoskelet; • organizační centrum mikrotubulů; • cytoplazma; • cytosol; • střední část těla; • centrosome; • buněčné jádro;
Biologický proces	• vývoj neuronů; • metabolický proces složený z nukleobáze; • organizace mikrotubulů cytoskeletu; • vývoj nervového systému; • axonové vedení; • negativní regulace vazby aktinových vláken; • negativní regulace vývoje projekce neuronů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1400
	12933
	ENSG00000072832
	ENSMUSG00000029121
	Q14194
	P97427
	NM_001313; NM_001014809; NM_001288661; NM_001288662
	NM_001136058; NM_007765
	NP_001014809; NP_001275590; NP_001275591; NP_001304
	NP_001129530; NP_031791
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein mediátoru odezvy na kolapsin 1, kódováno CRMP1 gen, je člověk protein z Rodina CRMP.^[5]

Tento gen kóduje člena rodiny cytosolický fosfoproteiny vyjádřeno výlučně v nervový systém. Kódovaný protein je považován za součást semaforin signální transdukční dráha zapojená do indukované semafory růstový kužel kolaps během neurální vývoj. Alternativní sestřih má za následek více variant přepisu.^[5]

CRMP1 zprostředkovává navinout signalizace v kortikální neuronální migraci.^[6] Myši s nedostatkem CRMP1 vykazují poškození dlouhodobé potenciace a narušený prostorový učení se a Paměť.^[7]

Gen CRMP1 se překrývá s jiným nazývaným genem EVC.^[8]

Interakce

Bylo prokázáno, že CRMP1 komunikovat s DPYSL2.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000072832 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029121 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CRMP1 collapsin response mediator protein 1“.
^ Yamashita N, Uchida Y, Ohshima T, Hirai S, Nakamura F, Taniguchi M, Mikoshiba K, Honnorat J, Kolattukudy P, Thomasset N, Takei K, Takahashi T, Goshima Y (prosinec 2006). „Protein mediátoru odezvy na kolapsin 1 zprostředkovává signalizaci reelinu při migraci kortikálních neuronů“. J. Neurosci. 26 (51): 13357–62. doi:10.1523 / JNEUROSCI.4276-06.2006. PMC 6674993. PMID 17182786.
^ Su KY, Chien WL, Fu WM, Yu IS, Huang HP, Huang PH, Lin SR, Shih JY, Lin YL, Hsueh YP, Yang PC, Lin SW (březen 2007). „Myši s nedostatkem mediátoru odezvy na kolapsin-1 vykazují narušenou dlouhodobou potenciaci a zhoršené prostorové učení a paměť“. J. Neurosci. 27 (10): 2513–24. doi:10.1523 / JNEUROSCI.4497-06.2007. PMC 6672508. PMID 17344389.
^ Ruiz-Perez VL, Ide SE, Strom TM, Lorenz B, Wilson D, Woods K, King L, Francomano C, Freisinger P, Spranger S, Marino B, Dallapiccola B, Wright M, Meitinger T, Polymeropoulos MH, Goodship J ( Březen 2000). "Mutace v novém genu u syndromu Ellis-van Creveld a Weyersovy akrodentní dysostózy". Nat. Genet. 24 (3): 283–6. doi:10.1038/73508. PMID 10700184. S2CID 1391136.
^ Leung, Thomas; Ng Yvonne; Cheong Albert; Ng Chong Han; Tan Ivan; Hall Christine; Lim Louis (prosinec 2002). „Vazebný protein p80 ROKalpha je nová sestřihová varianta CRMP-1, která se asociuje s CRMP-2 a moduluje neuronální morfologii indukovanou RhoA“. FEBS Lett. 532 (3): 445–9. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03736-5. ISSN 0014-5793. PMID 12482610. S2CID 45499981.

externí odkazy

Člověk CRMP1 umístění genomu a CRMP1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Shih JY, Lee YC, Yang SC a kol. (2003). „Protein-1 zprostředkující odezvu na kolapsin: nový gen potlačující invazi“. Clin. Exp. Metastáza. 20 (1): 69–76. doi:10.1023 / A: 1022598604565. PMID 12650609. S2CID 25005489.
Hamajima N, Matsuda K, Sakata S a kol. (1997). "Nová genová rodina definovaná lidskou dihydropyrimidinázou a třemi příbuznými proteiny s rozdílnou distribucí ve tkáních". Gen. 180 (1–2): 157–63. doi:10.1016 / S0378-1119 (96) 00445-3. PMID 8973361.
Torres R, Polymeropoulos MH (1999). "Genomická organizace a lokalizace lidského genu CRMP-1". DNA Res. 5 (6): 393–5. doi:10.1093 / dnares / 5.6.393. PMID 10048489.
Shih JY, Yang SC, Hong TM a kol. (2001). „Protein-1 mediátoru odpovědi na kolapsin a invaze a metastázy rakovinných buněk“. J. Natl. Cancer Inst. 93 (18): 1392–400. doi:10.1093 / jnci / 93.18.1392. PMID 11562390.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Leung T, Ng Y, Cheong A a kol. (2003). „Vazebný protein p80 ROKalpha je nová sestřihová varianta CRMP-1, která se asociuje s CRMP-2 a moduluje neuronální morfologii indukovanou RhoA“. FEBS Lett. 532 (3): 445–9. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03736-5. PMID 12482610. S2CID 45499981.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Chang CC, Shih JY, Jeng YM a kol. (2004). „Růstový faktor pojivové tkáně a jeho role při invazi a metastázování adenokarcinomu plic“. J. Natl. Cancer Inst. 96 (5): 364–75. doi:10.1093 / jnci / djh059. PMID 14996858.
Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA a kol. (2005). „Fosfoproteomická analýza vyvíjejícího se myšího mozku“. Mol. Buňka. Proteomika. 3 (11): 1093–101. doi:10,1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID 15345747.
Goehler H, Lalowski M, Stelzl U a kol. (2004). „Síť proteinových interakcí spojuje GIT1, zesilovač agregace huntingtinu, s Huntingtonovou chorobou“. Mol. Buňka. 15 (6): 853–65. doi:10.1016 / j.molcel.2004.09.016. PMID 15383276.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Sivakumaran TA, Lesperance MM (2005). "Analýza haplotypu a vazebné nerovnováhy genů CRMP1 a EVC". Int. J. Mol. Med. 14 (5): 903–7. doi:10,3892 / ijmm. 14.5.903. PMID 15492864.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M a kol. (2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
Cole AR, Causeret F, Yadirgi G a kol. (2006). „Výrazné aktivující kinázy přispívají k diferenciální regulaci proteinů mediátoru reakce na kolapsin glykogensyntázou kinázou-in in vivo“. J. Biol. Chem. 281 (24): 16591–8. doi:10,1074 / jbc.M513344200. PMC 1805471. PMID 16611631.
Weidemann W, Stelzl U, Lisewski U a kol. (2007). „Protein mediátoru odezvy na kolapsin 1 (CRMP-1) a protein zinek-prstu promyelocytární leukémie (PLZF) se vážou na UDP-N-acetylglukosamin 2-epimerázu / N-acetylmannosamin kinázu (GNE), klíčový enzym biosyntézy kyseliny sialové.“ FEBS Lett. 580 (28–29): 6649–54. doi:10.1016 / j.febslet.2006.11.015. PMID 17118363. S2CID 25369336.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000072832 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029121 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: CRMP1 collapsin response mediator protein 1“.

[pmid17182786-6] Yamashita N, Uchida Y, Ohshima T, Hirai S, Nakamura F, Taniguchi M, Mikoshiba K, Honnorat J, Kolattukudy P, Thomasset N, Takei K, Takahashi T, Goshima Y (prosinec 2006). „Protein mediátoru odezvy na kolapsin 1 zprostředkovává signalizaci reelinu při migraci kortikálních neuronů“. J. Neurosci. 26 (51): 13357–62. doi:10.1523 / JNEUROSCI.4276-06.2006. PMC 6674993. PMID 17182786.

[pmid17344389-7] Su KY, Chien WL, Fu WM, Yu IS, Huang HP, Huang PH, Lin SR, Shih JY, Lin YL, Hsueh YP, Yang PC, Lin SW (březen 2007). „Myši s nedostatkem mediátoru odezvy na kolapsin-1 vykazují narušenou dlouhodobou potenciaci a zhoršené prostorové učení a paměť“. J. Neurosci. 27 (10): 2513–24. doi:10.1523 / JNEUROSCI.4497-06.2007. PMC 6672508. PMID 17344389.

[pmid10700184-8] Ruiz-Perez VL, Ide SE, Strom TM, Lorenz B, Wilson D, Woods K, King L, Francomano C, Freisinger P, Spranger S, Marino B, Dallapiccola B, Wright M, Meitinger T, Polymeropoulos MH, Goodship J ( Březen 2000). "Mutace v novém genu u syndromu Ellis-van Creveld a Weyersovy akrodentní dysostózy". Nat. Genet. 24 (3): 283–6. doi:10.1038/73508. PMID 10700184. S2CID 1391136.

[pmid12482610-9] Leung, Thomas; Ng Yvonne; Cheong Albert; Ng Chong Han; Tan Ivan; Hall Christine; Lim Louis (prosinec 2002). „Vazebný protein p80 ROKalpha je nová sestřihová varianta CRMP-1, která se asociuje s CRMP-2 a moduluje neuronální morfologii indukovanou RhoA“. FEBS Lett. 532 (3): 445–9. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03736-5. ISSN 0014-5793. PMID 12482610. S2CID 45499981.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]