CNOT7 - CNOT7

CNOT7
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2D5R, 4GMJ
Identifikátory
Aliasy	CNOT7, CAF1, Caf1a, hCAF-1, CAF-1, CCR4-NOT transkripční komplexní podjednotka 7
Externí ID	OMIM: 604913 MGI: 1298230 HomoloGene: 49011 Genové karty: CNOT7
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	17,246,878 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	40,515,847 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita nukleázy; • vazba nukleové kyseliny; • aktivita exoribonukleázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita 3'-5'-exoribonukleázy; • aktivita převodníku signálu; • poly (A) specifická aktivita ribonukleázy; • aktivita exonukleázy; • Vazba RNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • aktivita hydrolázy; • vazba kovových iontů; • vazba transkripčního faktoru; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • Komplex CCR4-NOT; • cytosol; • membrána; • jaderné těleso; • P-tělo; • cytoplazma; • jaderná skvrna; • CCR4-NOT základní komplex; • tělo PML hostitelské buňky;
Biologický proces	• negativní regulace buněčné proliferace; • negativní regulace genové exprese; • exonukleolytický nukleární transkribovaný katabolický proces mRNA zapojený do rozpadu závislého na deadenylaci; • Deadenylation-dependentní dekapování nukleární transkribované mRNA; • hydrolýza fosfodiesterové vazby nukleové kyseliny; • sestava těla zpracování cytoplazmatické mRNA; • pozitivní regulace jaderně transkribovaného katabolického procesu mRNA, rozpad závislý na deadenylaci; • regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • pozitivní regulace zkrácení ocasu mRNA poly (A) transkripce nukleární energie; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace katabolického procesu mRNA; • umlčení genů miRNA; • regulace překladu; • zkrácení ocasu nukleární transkribované mRNA poly (A); • signální transdukce; • umlčování genů pomocí RNA; • transkripce, chráněná DNA; • Hydrolýza RNA fosfodiesterovou vazbou, exonukleolytická; • Odpověď na poškození DNA, transdukce signálu mediátorem třídy p53 vedoucí k zastavení buněčného cyklu; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace fosforylace tyrosinu STAT proteinu; • pozitivní regulace replikace virového genomu; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • obranná reakce na virus; • negativní regulace signální dráhy zprostředkované interferonem typu I.; • metabolický proces sacharidů; • negativní regulace překladu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	29883
	18983
	ENSG00000198791
	ENSMUSG00000031601
	Q9UIV1
	Q60809
NM_013354; NM_054026; NM_001322087; NM_001322088; NM_001322089;
	NM_001322090; NM_001322091; NM_001322092; NM_001322093; NM_001322094; NM_001322095; NM_001322096; NM_001322097; NM_001322098; NM_001322099; NM_001322100
	NM_001271542; NM_001271543; NM_011135; NM_001361938; NM_001361939
NP_001309016; NP_001309017; NP_001309018; NP_001309019; NP_001309020;
	NP_001309021; NP_001309022; NP_001309023; NP_001309024; NP_001309025; NP_001309026; NP_001309027; NP_001309028; NP_001309029; NP_037486; NP_473367
	NP_001258471; NP_001258472; NP_035265; NP_001348867; NP_001348868
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

CCR4-NOT transkripční komplexní podjednotka 7 je protein že u lidí je kódován CNOT7 gen.^[5]^[6]^[7]^[8] Je to podjednotka CCR4-ne Deadenylase komplex.

Funkce

Protein kódovaný tímto genem se váže na antiproliferativní protein, translokační protein B-buněk 1, který negativně reguluje buněčnou proliferaci. Vazba dvou proteinů, která je řízena fosforylací antiproliferačního proteinu, způsobuje signální události v buněčném dělení, které vedou ke změnám v buněčné proliferaci spojené s kontaktem buňka-buňka. Protein má myší i kvasinkové ortology. Alternativní sestřih tohoto genu vede ke dvěma variantám transkriptu kódujícím různé izoformy.^[8]

Interakce

CNOT7 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198791 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031601 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL, Gentz R, Collart MA, Timmers HT (březen 2000). "Izolace a charakterizace lidských ortologů kvasinkových komplexů CCR4-NOT". Nucleic Acids Res. 28 (3): 809–17. doi:10.1093 / nar / 28.3.809. PMC 102560. PMID 10637334.
^ Adams MD, Dubnick M, Kerlavage AR, Moreno R, Kelley JM, Utterback TR, Nagle JW, Fields C, Venter JC (březen 1992). "Sekvenční identifikace 2 375 genů lidského mozku". Příroda. 355 (6361): 632–4. doi:10.1038 / 355632a0. PMID 1538749. S2CID 4234345.
^ Robin-Lespinasse Y, Sentis S, Kolytcheff C, Rostan MC, Corbo L, Le Romancer M (únor 2007). „hCAF1, nový regulátor methylace argininu závislé na PRMT1“. J. Cell Sci. 120 (Pt 4): 638–47. doi:10.1242 / jcs.03357. PMID 17264152.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CNOT7 CCR4-NOT transkripční komplex, podjednotka 7“.
^ Bogdan JA, Adams-Burton C, Pedicord DL, Sukovich DA, Benfield PA, Corjay MH, Stoltenborg JK, Dicker IB (prosinec 1998). „Lidský uhlíkový katabolitový represorový protein (CCR4) - asociační faktor 1: klonování, exprese a charakterizace jeho interakce s translokačním proteinem B-buněk BTG1“. Biochem. J. 336 (2): 471–81. doi:10.1042 / bj3360471. PMC 1219893. PMID 9820826.
^ Prévôt D, Morel AP, Voeltzel T, Rostan MC, Rimokh R, Magaud JP, Corbo L (březen 2001). „Vztahy antiproliferativních proteinů BTG1 a BTG2 s CAF1, lidským homologem složky kvasinkového transkripčního komplexu CCR4: účast na signální dráze alfa receptoru estrogenu“. J. Biol. Chem. 276 (13): 9640–8. doi:10,1074 / jbc.M008201200. PMID 11136725.
^ ^A ^b Funakoshi Y, Doi Y, Hosoda N, Uchida N, Osawa M, Shimada I, Tsujimoto M, Suzuki T, Katada T, Hoshino S (prosinec 2007). "Mechanismus mRNA deadenylace: důkazy molekulární souhry mezi faktorem ukončení translace eRF3 a mRNA deadenylasami". Genes Dev. 21 (23): 3135–48. doi:10.1101 / gad.1597707. PMC 2081979. PMID 18056425.
^ ^A ^b Ikematsu N, Yoshida Y, Kawamura-Tsuzuku J, Ohsugi M, Onda M, Hirai M, Fujimoto J, Yamamoto T (prosinec 1999). „Tob2, nový antiproliferativní člen rodiny Tob / BTG1, se asociuje se složkou transkripčního regulačního komplexu CCR4 schopného vázat cyklin-dependentní kinázy“. Onkogen. 18 (52): 7432–41. doi:10.1038 / sj.onc.1203193. PMID 10602502.

Další čtení

Draper MP, Salvadore C, Denis CL (1995). „Identifikace myšího proteinu, jehož homolog v Saccharomyces cerevisiae je součástí regulačního komplexu transkripce CCR4“. Mol. Buňka. Biol. 15 (7): 3487–95. doi:10.1128 / MCB.15.7.3487. PMC 230585. PMID 7791755.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Hillier LD, Lennon G, Becker M, Bonaldo MF, Chiapelli B, Chissoe S, Dietrich N, DuBuque T, Favello A, Gish W, Hawkins M, Hultman M, Kucaba T, Lacy M, Le M, Le N, Mardis E Moore B, Morris M, Parsons J, Prange C, Rifkin L, Rohlfing T, Schellenberg K, Bento Soares M, Tan F, Thierry-Meg J, Trevaskis E, Underwood K, Wohldman P, Waterston R, Wilson R, Marra M (1996). „Generování a analýza 280 000 lidských sekvenčních značek“. Genome Res. 6 (9): 807–28. doi:10,1101 / gr. 6.807. PMID 8889549.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Rouault JP, Prévôt D, Berthet C, Birot AM, Billaud M, Magaud JP, Corbo L (1998). „Interakce genových produktů BTG1 a p53 regulovaných BTG2 s mCaf1, myší homolog složky kvasinkového transkripčního regulačního komplexu CCR4“. J. Biol. Chem. 273 (35): 22563–9. doi:10.1074 / jbc.273.35.22563. PMID 9712883.
Bogdan JA, Adams-Burton C, Pedicord DL, Sukovich DA, Benfield PA, Corjay MH, Stoltenborg JK, Dicker IB (1998). „Lidský uhlíkový katabolitový represorový protein (CCR4) - asociační faktor 1: klonování, exprese a charakterizace jeho interakce s translokačním proteinem B-buněk BTG1“. Biochem. J. 336 (2): 471–81. doi:10.1042 / bj3360471. PMC 1219893. PMID 9820826.
Ikematsu N, Yoshida Y, Kawamura-Tsuzuku J, Ohsugi M, Onda M, Hirai M, Fujimoto J, Yamamoto T (1999). „Tob2, nový antiproliferativní člen rodiny Tob / BTG1, se asociuje se složkou transkripčního regulačního komplexu CCR4 schopného vázat cyklin-dependentní kinázy“. Onkogen. 18 (52): 7432–41. doi:10.1038 / sj.onc.1203193. PMID 10602502.
Prévôt D, Morel AP, Voeltzel T, Rostan MC, Rimokh R, Magaud JP, Corbo L (2001). „Vztahy antiproliferativních proteinů BTG1 a BTG2 s CAF1, lidským homologem složky kvasinkového transkripčního komplexu CCR4: účast na signální dráze alfa receptoru estrogenu“. J. Biol. Chem. 276 (13): 9640–8. doi:10,1074 / jbc.M008201200. PMID 11136725.
Yoshida Y, Hosoda E, Nakamura T, Yamamoto T (2001). „Sdružení ANA, člena antiproliferativních proteinů rodiny Tob, s komponentou Caf1 transkripčního regulačního komplexu CCR4“. Jpn. J. Cancer Res. 92 (6): 592–6. doi:10.1111 / j.1349-7006.2001.tb01135.x. PMC 5926753. PMID 11429045.
Flanagan J, Healey S, Young J, Whitehall V, Chenevix-Trench G (2003). „Analýza regulátoru transkripce, CNOT7, jako kandidátního supresorového genu chromozomu 8 u kolorektálního karcinomu“. Int. J. Cancer. 106 (4): 505–9. doi:10.1002 / ijc.11264. PMID 12845644. S2CID 25191544.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.

externí odkazy

Člověk CNOT7 umístění genomu a CNOT7 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9UIV1 (CCR4-NOT transkripční komplexní podjednotka 7) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198791 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031601 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10637334-5] Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL, Gentz R, Collart MA, Timmers HT (březen 2000). "Izolace a charakterizace lidských ortologů kvasinkových komplexů CCR4-NOT". Nucleic Acids Res. 28 (3): 809–17. doi:10.1093 / nar / 28.3.809. PMC 102560. PMID 10637334.

[pmid1538749-6] Adams MD, Dubnick M, Kerlavage AR, Moreno R, Kelley JM, Utterback TR, Nagle JW, Fields C, Venter JC (březen 1992). "Sekvenční identifikace 2 375 genů lidského mozku". Příroda. 355 (6361): 632–4. doi:10.1038 / 355632a0. PMID 1538749. S2CID 4234345.

[pmid17264152-7] Robin-Lespinasse Y, Sentis S, Kolytcheff C, Rostan MC, Corbo L, Le Romancer M (únor 2007). „hCAF1, nový regulátor methylace argininu závislé na PRMT1“. J. Cell Sci. 120 (Pt 4): 638–47. doi:10.1242 / jcs.03357. PMID 17264152.

[entrez-8] A ^b „Entrez Gene: CNOT7 CCR4-NOT transkripční komplex, podjednotka 7“.

[pmid9820826-9] Bogdan JA, Adams-Burton C, Pedicord DL, Sukovich DA, Benfield PA, Corjay MH, Stoltenborg JK, Dicker IB (prosinec 1998). „Lidský uhlíkový katabolitový represorový protein (CCR4) - asociační faktor 1: klonování, exprese a charakterizace jeho interakce s translokačním proteinem B-buněk BTG1“. Biochem. J. 336 (2): 471–81. doi:10.1042 / bj3360471. PMC 1219893. PMID 9820826.

[pmid11136725-10] Prévôt D, Morel AP, Voeltzel T, Rostan MC, Rimokh R, Magaud JP, Corbo L (březen 2001). „Vztahy antiproliferativních proteinů BTG1 a BTG2 s CAF1, lidským homologem složky kvasinkového transkripčního komplexu CCR4: účast na signální dráze alfa receptoru estrogenu“. J. Biol. Chem. 276 (13): 9640–8. doi:10,1074 / jbc.M008201200. PMID 11136725.

[pmid18056425-11] A ^b Funakoshi Y, Doi Y, Hosoda N, Uchida N, Osawa M, Shimada I, Tsujimoto M, Suzuki T, Katada T, Hoshino S (prosinec 2007). "Mechanismus mRNA deadenylace: důkazy molekulární souhry mezi faktorem ukončení translace eRF3 a mRNA deadenylasami". Genes Dev. 21 (23): 3135–48. doi:10.1101 / gad.1597707. PMC 2081979. PMID 18056425.

[pmid10602502-12] A ^b Ikematsu N, Yoshida Y, Kawamura-Tsuzuku J, Ohsugi M, Onda M, Hirai M, Fujimoto J, Yamamoto T (prosinec 1999). „Tob2, nový antiproliferativní člen rodiny Tob / BTG1, se asociuje se složkou transkripčního regulačního komplexu CCR4 schopného vázat cyklin-dependentní kinázy“. Onkogen. 18 (52): 7432–41. doi:10.1038 / sj.onc.1203193. PMID 10602502.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]