Brucella sRNA - Brucella sRNA - Wikipedia

Bakteriální malé RNA (sRNA) jsou důležitou třídou regulačních molekul v bakteriích, jako jsou Brucella. Často jsou vázány na chaperonový protein Hfq, který jim umožňuje interagovat s mRNA. v Brucella suis 1330 Sekvenování RNA identifikovalo nový seznam 33 sRNA a 62 Hfq asociovaných mRNA.[1] v Brucella melitensis pomocí bioinformatického a experimentálního přístupu bylo identifikováno osm nových genů sRNA. Bylo zjištěno, že u jednoho z nich BSR0602 moduluje intracelulární přežití B. melitensis.[2] V jiném velkém měřítku hluboké řazení ve studii bylo identifikováno 1321 sRNA B. melitensis.[3] BSR0441 sRNA byla dále zkoumána v této studii a bylo prokázáno, že hraje roli v intracelulárním přežití. sRNA BM-sr0117 z Brucella melitensis byl identifikován a bylo prokázáno, že je vázán a štěpen Bm-RNázou III.[4] AbcR a AbcR2 (ortology z SmrC15 a SmrC16) B. abortus.[5] Sedm nových sRNA bylo validováno a jejich interakce s domnělou cílovou sekvencí byla ověřena v B. abortus.[6]

RNA chaperon Hfq odkaz na Brucella virulence

Hfq protein reguluje virB operon což je nutné pro plnou virulenci bakterií. Může se vázat na 5 'nepřeloženou oblast virB transkripční regulátor BabR a zprostředkovává jeho účinky na babR výraz.[7]

Viz také

Reference

  1. ^ Saadeh, B; et al. (2015). "Celá transkriptomová identifikace Hfq-asociovaných RNA v Brucella suis pomocí hlubokého sekvenování". J. Bacteriol. 198 (3): 427–435. doi:10.1128 / JB.00711-15. PMC  4719455. PMID  26553849.
  2. ^ Wang, Y; et al. (2015). „Identifikace nové malé nekódující RNA modulující intracelulární přežití Brucella melitensis“. Přední. Microbiol. 6: 164. doi:10.3389 / fmicb.2015.00164. PMC  4365724. PMID  25852653.
  3. ^ Zhong, Zhijun; Xu, Xiaoyang; Li, Xinran; Liu, Shiwei; Lei, Shuangshuang; Yang, Mingjuan; Yu, Jiuxuan; Yuan, Jiuyun; Ke, Yuehua (01.01.2016). „Rozsáhlá identifikace malé nekódující RNA s řetězcově specifickým hlubokým sekvenováním a charakterizace nové sRNA související s virulencí u Brucella melitensis“. Vědecké zprávy. 6: 25123. doi:10.1038 / srep25123. ISSN  2045-2322. PMC  4845025. PMID  27112796.
  4. ^ Wu, CX; et al. (2016). "Charakterizace ribonukleázy III z Brucelly". Gen. 579 (2): 183–192. doi:10.1016 / j.gene.2015.12.068. PMID  26778206.
  5. ^ Caswell, Clayton C .; Gaines, Jennifer M .; Ciborowski, Pawel; Smith, Derek; Borchers, Christoph H .; Roux, Christelle M .; Sayood, Khalid; Dunman, Paul M .; Roop Ii, R. Martin (01.07.2012). „Identifikace dvou malých regulačních RNA spojených s virulencí u Brucella abortus 2308“. Molekulární mikrobiologie. 85 (2): 345–360. doi:10.1111 / j.1365-2958.2012.08117.x. ISSN  1365-2958. PMC  3391331. PMID  22690807.
  6. ^ Dong, Hao; Peng, Xiaowei; Wang, Ning; Wu, Qingmin (01.05.2014). „Identifikace nových sRNA v Brucella abortus 2308“. Mikrobiologické dopisy FEMS. 354 (2): 119–125. doi:10.1111/1574-6968.12433. ISSN  1574-6968. PMID  24673258.
  7. ^ Caswell, CC; Gaines, JM; Roop II, RM (2012). „RNA chaperon Hfq nezávisle koordinuje expresi sekrečního systému VirB typu IV a regulátoru typu LuxR BabR v Brucella abortus 2308". J. Bacteriol. 194 (1): 3–14. doi:10.1128 / JB.05623-11. PMC  3256608. PMID  22020650.