Brom sousedící homologická doména obsahující 1 - Bromo adjacent homology domain containing 1

BAHD1
Identifikátory
AliasyBAHD1, brom sousedící homologická doména obsahující 1
Externí IDOMIM: 613880 MGI: 2139371 HomoloGene: 8976 Genové karty: BAHD1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 15 (lidský)
Chr.Chromozom 15 (lidský)[1]
Chromozom 15 (lidský)
Genomické umístění pro BAHD1
Genomické umístění pro BAHD1
Kapela15q15.1Start40,439,721 bp[1]
Konec40,468,236 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

22893

228536

Ensembl

ENSG00000140320

ENSMUSG00000040007

UniProt

Q8TBE0

Q497V6

RefSeq (mRNA)

NM_001301132
NM_014952

NM_001045523

RefSeq (protein)

NP_001288061
NP_055767

n / a

Místo (UCSC)Chr 15: 40,44 - 40,47 MbChr 2: 118,9 - 118,92 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Brom sousedící homologická doména obsahující 1 (BAHD1) je protein že u lidí je kódován BAHD1 gen. BAHD1 je zapojen do heterochromatin tvorba a transkripční represe. [5]

Objev

BAHD1 byl nejprve klonován z cDNA knihovny lidského mozku a kódující sekvence byla pojmenována KIAA0945.[6] Bierne a kolegové dále objevili funkci BAHD1 v regulaci struktury chromatinu a genové exprese.[7]

Funkce

BAHD1 působí jako ko-represor interakcí se sadou proteinů, které podporují zhutňování chromatinu a regulují transkripci.[7][8] Tandemově afinitní čištění proteinového komplexu spojeného s BAHD1 v lidských buňkách HEK293 identifikovalo proteiny MIER (MIER1, MIER2, MIER3), histon-deacetyláza HDAC1 a HDAC2, histon H3K9 methyltransferáza EHMT2, heterochromatinový protein 1 (HP1 alfa, HP1 beta, HP1 gamma), MBD1, TRIM28 a CDYL jako partneři BAHD1.[8] Nadměrná exprese BAHD1 v buňkách HEK293 indukuje kondenzaci chromatinu ve velkém měřítku [7] a metylace DNA na autosomech.[9] C-terminál Doména BAH BAHD1 funguje jako čtečka epigenetické známky H3K27me3.[10] Ektopicky exprimovaný BAHD1 kolokalizuje s heterochromatickým neaktivním X chromozom (Xi).[7][9]

Studie na zvířatech

Ablace z Bahd1 Gen u myší mění vývoj placenty a vede k hypocholesterolemii, hypoglykémii a snížení tělesného tuku.[8] Bahd1-haplodeficience u myší snižuje účinnost infekce bakteriálním patogenem Listeria monocytogenes.[11]

Klinický význam

Během infekce lidských epiteliálních buněk patogenem Listeria monocytogenes, BAHD1 potlačuje geny stimulované interferonem.[11] V určitých stadiích infekce, a Listeria nukleomodulin „LntA“ působí jako inhibitor BAHD1 a aktivuje geny stimulované interferonem.[11][12] Gen BAHD1 je downregulován v tlustém střevě myšího modelu ulcerózní kolitida.[13]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000140320 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040007 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ „Entrez Gene: BAHD1“. Citováno 2016-10-22.
  6. ^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 26 (6): 63–70. doi:10.1093 / dnares / 6.1.63. PMID  10231032.
  7. ^ A b C d Bierne H, Tham TN, Batsche E, Dumay A, Leguillou M, Kernéis-Golsteyn S, Regnault B, Seeler JS, Muchardt C, Feunteun J, Cossart P (2009). „Lidský BAHD1 podporuje umlčení heterochromatického genu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 106 (33): 13826–31. Bibcode:2009PNAS..10613826B. doi:10.1073 / pnas.0901259106. PMC  2728979. PMID  19666599.
  8. ^ A b C Lakisic G, Lebreton A, Pourpre R, Wendling O, Libertini E, Radford EJ, Le Guillou M, Champy MF, Wattenhofer-Donzé M, Soubigou G, Ait-Si-Ali S, Feunteun J, Sorg T, Coppée JY, Ferguson -Smith AC, Cossart P, Bierne H (2016). „Role komplexu BAHD1 potlačujícího chromatin ve vývoji placenty a regulaci metabolismu steroidů“. PLOS Genet. 12 (3): e1005898. doi:10.1371 / journal.pgen.1005898. PMC  4777444. PMID  26938916.
  9. ^ A b Libertini E, Lebreton A, Lakisic G, Dillies MA, Beck S, Coppée JY, Cossart P, Bierne H (2015). „Nadměrná exprese heterochromatinizačního faktoru BAHD1 v buňkách HEK293 rozdílně přetváří methylome DNA na autosomech a X chromozomu“. Přední Genet. 1. prosince; 6: 339 (eCollection 2015): e1005898. doi:10.3389 / fgene.2015.00339. PMC  4664705. PMID  26648976.
  10. ^ Zhao D, Zhang X, Guan H, Xiong X, Shi X, Deng H, Li H (2016). „Doménou BAH BAHD1 je čtečka histonů H3K27me3“. Proteinová buňka. 7 (3): 222–6. doi:10.1007 / s13238-016-0243-z. PMC  4791424. PMID  26850261.
  11. ^ A b C Lebreton A, Lakisic G, Job V, Fritsch L, Tham TN, Camejo A, Matteï PJ, Regnault B, Nahori MA, Cabanes D, Gautreau A, Ait-Si-Ali S, Dessen A, Cossart P, Bierne H (2011) ). „Bakteriální protein cílí na komplex BAHD1 chromatinu ke stimulaci reakce interferonu typu III“ (PDF). Věda. 331 (6022): 1319–21. Bibcode:2011Sci ... 331.1319L. doi:10.1126 / science.1200120. PMID  21252314. S2CID  35405265.
  12. ^ Lebreton A, Job V, Ragon M, Le Monnier A, Dessen A, Cossart P, Bierne H (2014). "Strukturální základ pro inhibici chromatinového represoru BAHD1 bakteriálním nukleomodulinem LntA". mBio. 21 (5 (1): e00775-13): e00775-13. doi:10,1 128 / mBio.00775-13. PMC  3903274. PMID  24449750.
  13. ^ Zhu H, Wan X, Li J, Han L, Bo X, Chen W, Lu C, Shen Z, Xu C, Chen L, Yu C, Xu G (2015). „Výpočetní predikce a validace BAHD1 jako nové molekuly pro ulcerózní kolitidu“. Sci Rep. 17. července (5: 12227): 12227. Bibcode:2015NatSR ... 512227Z. doi:10.1038 / srep12227. PMC  4505333. PMID  26183847.

Další čtení