Brom sousedící homologická doména obsahující 1 - Bromo adjacent homology domain containing 1
Brom sousedící homologická doména obsahující 1 (BAHD1) je protein že u lidí je kódován BAHD1 gen. BAHD1 je zapojen do heterochromatin tvorba a transkripční represe. [5]
Objev
BAHD1 byl nejprve klonován z cDNA knihovny lidského mozku a kódující sekvence byla pojmenována KIAA0945.[6] Bierne a kolegové dále objevili funkci BAHD1 v regulaci struktury chromatinu a genové exprese.[7]
Funkce
BAHD1 působí jako ko-represor interakcí se sadou proteinů, které podporují zhutňování chromatinu a regulují transkripci.[7][8] Tandemově afinitní čištění proteinového komplexu spojeného s BAHD1 v lidských buňkách HEK293 identifikovalo proteiny MIER (MIER1, MIER2, MIER3), histon-deacetyláza HDAC1 a HDAC2, histon H3K9 methyltransferáza EHMT2, heterochromatinový protein 1 (HP1 alfa, HP1 beta, HP1 gamma), MBD1, TRIM28 a CDYL jako partneři BAHD1.[8] Nadměrná exprese BAHD1 v buňkách HEK293 indukuje kondenzaci chromatinu ve velkém měřítku [7] a metylace DNA na autosomech.[9] C-terminál Doména BAH BAHD1 funguje jako čtečka epigenetické známky H3K27me3.[10] Ektopicky exprimovaný BAHD1 kolokalizuje s heterochromatickým neaktivním X chromozom (Xi).[7][9]
Studie na zvířatech
Ablace z Bahd1 Gen u myší mění vývoj placenty a vede k hypocholesterolemii, hypoglykémii a snížení tělesného tuku.[8] Bahd1-haplodeficience u myší snižuje účinnost infekce bakteriálním patogenem Listeria monocytogenes.[11]
Klinický význam
Během infekce lidských epiteliálních buněk patogenem Listeria monocytogenes, BAHD1 potlačuje geny stimulované interferonem.[11] V určitých stadiích infekce, a Listeria nukleomodulin „LntA“ působí jako inhibitor BAHD1 a aktivuje geny stimulované interferonem.[11][12] Gen BAHD1 je downregulován v tlustém střevě myšího modelu ulcerózní kolitida.[13]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000140320 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040007 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Entrez Gene: BAHD1“. Citováno 2016-10-22.
- ^ Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 26 (6): 63–70. doi:10.1093 / dnares / 6.1.63. PMID 10231032.
- ^ A b C d Bierne H, Tham TN, Batsche E, Dumay A, Leguillou M, Kernéis-Golsteyn S, Regnault B, Seeler JS, Muchardt C, Feunteun J, Cossart P (2009). „Lidský BAHD1 podporuje umlčení heterochromatického genu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 106 (33): 13826–31. Bibcode:2009PNAS..10613826B. doi:10.1073 / pnas.0901259106. PMC 2728979. PMID 19666599.
- ^ A b C Lakisic G, Lebreton A, Pourpre R, Wendling O, Libertini E, Radford EJ, Le Guillou M, Champy MF, Wattenhofer-Donzé M, Soubigou G, Ait-Si-Ali S, Feunteun J, Sorg T, Coppée JY, Ferguson -Smith AC, Cossart P, Bierne H (2016). „Role komplexu BAHD1 potlačujícího chromatin ve vývoji placenty a regulaci metabolismu steroidů“. PLOS Genet. 12 (3): e1005898. doi:10.1371 / journal.pgen.1005898. PMC 4777444. PMID 26938916.
- ^ A b Libertini E, Lebreton A, Lakisic G, Dillies MA, Beck S, Coppée JY, Cossart P, Bierne H (2015). „Nadměrná exprese heterochromatinizačního faktoru BAHD1 v buňkách HEK293 rozdílně přetváří methylome DNA na autosomech a X chromozomu“. Přední Genet. 1. prosince; 6: 339 (eCollection 2015): e1005898. doi:10.3389 / fgene.2015.00339. PMC 4664705. PMID 26648976.
- ^ Zhao D, Zhang X, Guan H, Xiong X, Shi X, Deng H, Li H (2016). „Doménou BAH BAHD1 je čtečka histonů H3K27me3“. Proteinová buňka. 7 (3): 222–6. doi:10.1007 / s13238-016-0243-z. PMC 4791424. PMID 26850261.
- ^ A b C Lebreton A, Lakisic G, Job V, Fritsch L, Tham TN, Camejo A, Matteï PJ, Regnault B, Nahori MA, Cabanes D, Gautreau A, Ait-Si-Ali S, Dessen A, Cossart P, Bierne H (2011) ). „Bakteriální protein cílí na komplex BAHD1 chromatinu ke stimulaci reakce interferonu typu III“ (PDF). Věda. 331 (6022): 1319–21. Bibcode:2011Sci ... 331.1319L. doi:10.1126 / science.1200120. PMID 21252314. S2CID 35405265.
- ^ Lebreton A, Job V, Ragon M, Le Monnier A, Dessen A, Cossart P, Bierne H (2014). "Strukturální základ pro inhibici chromatinového represoru BAHD1 bakteriálním nukleomodulinem LntA". mBio. 21 (5 (1): e00775-13): e00775-13. doi:10,1 128 / mBio.00775-13. PMC 3903274. PMID 24449750.
- ^ Zhu H, Wan X, Li J, Han L, Bo X, Chen W, Lu C, Shen Z, Xu C, Chen L, Yu C, Xu G (2015). „Výpočetní predikce a validace BAHD1 jako nové molekuly pro ulcerózní kolitidu“. Sci Rep. 17. července (5: 12227): 12227. Bibcode:2015NatSR ... 512227Z. doi:10.1038 / srep12227. PMC 4505333. PMID 26183847.
Další čtení
- Talmud PJ, Drenos F, Shah S, Shah T, Palmen J, Verzilli C, Gaunt TR, Pallas J, Lovering R, Li K, Casas JP, Sofat R, Kumari M, Rodriguez S, Johnson T, Newhouse SJ, Dominiczak A , Samani NJ, Caulfield M, Sever P, Stanton A, Shields DC, Padmanabhan S, Melander O, Hastie C, Delles C, Ebrahim S, Marmot MG, Smith GD, Lawlor DA, Munroe PB, Day IN, Kivimaki M, Whittaker J, Humphries SE, Hingorani AD (2009). „Genově centrické asociační signály pro lipidy a apolipoproteiny identifikované prostřednictvím HumanCVD BeadChip“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 85 (5): 628–42. doi:10.1016 / j.ajhg.2009.10.014. PMC 2775832. PMID 19913121.
- Bailey SD, Xie C, Do R, Montpetit A, Diaz R, Mohan V, Keavney B, Yusuf S, Gerstein HC, Engert JC, Anand S (2010). „Variace na lokusu NFATC2 zvyšuje riziko edému vyvolaného thiazolidindionem ve studii Diabetes REduction Assessment ve studii Ramipril and Rosiglitazone Medication (DREAM)“. Péče o cukrovku. 33 (10): 2250–3. doi:10.2337 / dc10-0452. PMC 2945168. PMID 20628086.
![]() | Tento článek o gen na lidský chromozom 15 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |