Bradyrhizobium japonicum - Bradyrhizobium japonicum

Bradyrhizobium japonicum
Bradyrhizobium japonicum USDA 110 na TY agaru.JPG
Bradyrhizobium japonicum kmen USDA 110 na an agarový talíř
Vědecká klasifikace
Království:
Bakterie
Kmen:
Proteobakterie
Třída:
Alphaproteobacteria
Objednat:
Rhizobiales
Rodina:
Bradyrhizobiaceae
Rod:
Bradyrhizobium
Druh:
B. japonicum
Binomické jméno
Bradyrhizobium japonicum
Synonyma

Rhizobium japonicum Buchanan 1926
Rhizobacterium japonicum Kirchner 1896[1]

Bradyrhizobium japonicum je druh lusk -kořenový nodulační, mikrosymbiotikum fixace dusíkem bakterie. Tento druh je jedním z mnoha Gramnegativní, ve tvaru tyče bakterie běžně označované jako rhizobia.[Citace je zapotřebí ] V rámci této široké klasifikace, která má tři skupiny, taxonomie studie využívající Sekvenování DNA naznačte to B. japonicum patří uvnitř homologie skupina II.[2]

Použití

Zemědělství

B. japonicum se přidává do luštěnin pro zlepšení výtěžek sklizně,[3] zejména v oblastech, kde bakterie není původní (např. Arkansas půdy).[4] Často naočkovat je dodržovat na semena před výsadbou pomocí roztoku cukru.[5]

Výzkum

Kmen B. japonicum, USDA110, se používá a modelový organismus od roku 1957.[Citace je zapotřebí ] Je široce používán ke studiu molekulární genetika, fyziologie rostlin, a ekologie rostlin díky své relativně vynikající symbiotické aktivaci fixace dusíku s sója (tj. ve srovnání s jinými druhy rhizobia). Celý genom byl sekvenován v roce 2002 a odhalil, že tento druh má jediný kruhový chromozom s 9 105 828 základní páry.[6]

Metabolismus

B. japonicum je schopen degradovat katechin s tvorbou kyselina floroglucinolkarboxylová, dále dekarboxylováno na phloroglucinol, který je dehydroxylován na resorcinol a hydroxychinol.[Citace je zapotřebí ]

B. japonicum vlastnit nosRZDFYLX gen, který napomáhá denitrifikaci a má dvě katalytické podjednotky - Cu-a a Cu-z (s několika zbytky histidinu). Spravuje expresní kaskádu, která dokáže snímat gradienty kyslíku, nazývanou „FixJ-FixK2-FixK1“. FixJ pozitivně reguluje FixK2, který aktivuje geny dýchání dusíku, stejně jako FixK1. Mutanti FixK1 nejsou schopni dýchat z dusíku kvůli vadné katatylické podjednotce mědi (Cu-z) v nosRZDFYLX.[7]

Genetická transformace

Přirozená genetická transformace v bakteriích je sexuální proces zahrnující přenos DNA z jedné buňky do druhé prostřednictvím intervenujícího média a integraci dárcovské sekvence do genomu příjemce pomocí homologní rekombinace. B. japonicum buňky jsou schopné podstoupit transformaci.[8] Stávají se kompetentní pro absorpci DNA během pozdní fáze logu.

Reference

  1. ^ „do Bradyrhizobium gen. nov., rodu pomalu rostoucích bakterií kořenových uzlin z luštěnin“. Int. J. Syst. Bacteriol. 32: 136–139. 1982. doi:10.1099/00207713-32-1-136.
  2. ^ A. B. Hollis, W. E. Kloos a G. E. Elkan (1981). "DNA: studie hybridizace DNA DNA Rhizobium japonicum a příbuzné Rhizobiaceae ". Journal of General Microbiology. 123: 215–222. doi:10.1099/00221287-123-2-215.
  3. ^ Purcell, Larry C .; Salmeron, Montserrat; Ashlock, Lanny (2013). „Kapitola 5“ (PDF). Příručka k produkci sóji v Arkansasu - MP197. Little Rock, AR: Kooperativní rozšiřovací služba University of Arkansas. str. 5. Citováno 21. února 2016.
  4. ^ Purcell, Larry C .; Salmeron, Montserrat; Ashlock, Lanny (2000). „Kapitola 7“ (PDF). Příručka k produkci sóji v Arkansasu - MP197. Little Rock, AR: Kooperativní rozšiřovací služba University of Arkansas. s. 2–3. Citováno 21. února 2016.
  5. ^ Bennett, J. Michael; Emeritní rétorika; Hicks, Dale R .; Naeve, Seth L .; Bennett, Nancy Bush (2014). Sójová polní kniha v Minnesotě (PDF). St Paul, MN: Rozšíření University of Minnesota. str. 79. Archivovány od originál (PDF) dne 30. 09. 2013. Citováno 21. února 2016.
  6. ^ Kaneko, T; Nakamura, Y; Sato, S; Minamisawa, K; Uchiumi, T; Sasamoto, S; Watanabe, A; Idesawa, K; Iriguchi, M; Kawashima, K; Kohara, M; Matsumoto, M; Shimpo, S; Tsuruoka, H; Wada, T; Yamada, M; Tabata, S (2002). „Kompletní genomová sekvence symbiotické bakterie vázající dusík Bradyrhizobium japonicum USDA110 ". Výzkum DNA. 9 (6): 189–197. doi:10.1093 / dnares / 9.6.189. PMID  12597275.
  7. ^ D. Nellen-Anthamatten, P. Rossi; et al. (1998). „Bradyrhizobium japonicum, FixK2, rozhodující distributor regulační kaskády závislé na FixLJ pro kontrolu genů indukovatelných nízkými hladinami kyslíku“. [Journal of Bacteriology]. 180 (19): 5251–5255.
  8. ^ Raina JL, Modi VV (1972). "Vazba a transformace deoxyribonukleátů v Rhizobium japonicum". J. Bacteriol. 111 (2): 356–60. PMC  251290. PMID  4538250.

externí odkazy