Benedikt Kessler - Benedikt Kessler

Benedikt Kessler
Benedikt Kessler.jpg
Akademické pozadí
VzděláváníB.A., Biochemistry
Ph.D., imunologie
Alma materŠvýcarský federální technologický institut
Ludwigův institut pro výzkum rakoviny
Akademická práce
InstituceUniversity of Oxford

Benedikt Kessler je švýcarský vědecký pracovník a akademik. Je profesorem biochemie a Hmotnostní spektrometrie v Target Discovery Institute, University of Oxford.[1]

Kesslerův výzkum byl zaměřen na ubikvitin a proteáza biologie. Některé z jeho prací se zabývaly definováním molekulárních podpisů v procesech lidských onemocnění a zrychlením objevování cílů v translační výzkum.[2][3] Je držitelem jednoho patentu.[4]

Kessler je členem Britská společnost pro hmotnostní spektrometrii Britská společnost buněčné biologie a Americká asociace pro výzkum rakoviny.[5]

Vzdělávání

Kessler získal titul B.A. v biochemii od Švýcarský federální technologický institut v roce 1992. Poté se připojil Ludwigův institut pro výzkum rakoviny kde získal titul Ph.D. v imunologii. Postdoktorské vzdělání dokončil v Harvardská lékařská škola v laboratoři Hidde Ploegh kde studoval roli proteolýza při zpracování a prezentaci antigenu.[6][7]

Kariéra

V roce 2001 nastoupil Kessler na Harvard Medical School jako instruktor patologie. V roce 2004 opustil Harvard a přestěhoval se do Spojené království, kde nastoupil na Oxfordskou univerzitu jako vedoucí výzkumné skupiny.[7] Později začal učit na univerzitě v Oxfordu a v roce 2014 se stal řádným profesorem biochemie a hromadné spektrometrie biologických věd.[1]

Kessler byl součástí aliance DUB, skupiny, která pracuje na vývoji nových léků proti deubikvitylační enzymy (DUB). V současné době je členem Inovativní technologie umožňující síť (ITEN), vědeckého konsorcia, které zkoumá DUB jako cíle v oblasti rakoviny koordinované Pfizer.[8]

Výzkum a práce

Kessler studuje antigeny třídy I hlavního histokompatibilního komplexu (MHC) Na bázi HPLC analýza od roku 1993 a přístupy ke studiu dráhy ubikvitin-proteazomu založené na hmotnostní spektrometrii od roku 2000. V roce 2005 založil vlastní skupinu na University of Oxford, Nuffield Department of Medicine (NDM) se zaměřením na biologii ubikvitinu a proteázy, biologická hmotnostní spektrometrie a proteomika. V roce 2013 Kessler přesunul svoji laboratoř do Target Discovery Institute (TDI).

Kessler přispěl vysvětlením působení nových klinických léků (Velcade, Karfilzomib, Kyprolis) pro léčbu Mnohočetný myelom pacienti,[9] a objev potenciálně klinicky využitelných cílů rakoviny v ubikvitinovém systému, zejména deubikvitylačních enzymů (DUB).[10][11] Skupina Kessler také pomohla odhalit molekulární podpisy spojené s panelem lidských nemocí prostřednictvím klinických studií proteomiky.[12][13]

Laboratoř Kessler v současné době vyvíjí chemoproteomické metody pro profilování aktivních enzymů zpracovávajících ubikvitin, zejména deubikvititujících enzymů (DUB) a dynamického ubikvitomu.[14] Byly vyvinuty sondy zaměřené na aktivní místo založené na ubikvitinu, které umožnily profilování aktivního buněčného obsahu rodiny enzymů DUB.[15] Tento přístup byl také použit k prokázání zapojení otubainu 1 (OTUB1 ) v infekci[16] a rakovina prostaty,[17] role USP4[18] a USP47[19] v mechanismech opravy DNA a charakterizaci USP7 inhibitory[20] jako nová potenciální terapeutická činidla u mnohočetného myelomu.[11][21]

Ceny a vyznamenání

  • Cenu Cesara Rouxe za výzkum na Lékařské fakultě University v Lausanne
  • Human Frontier Science Program Organisation dlouhodobé přátelství
  • Postdoktorandské stipendium Roche Research Foundation
  • Příjemce ceny Senior Research Award pro Nadaci pro výzkum mnohočetného myelomu (MMRF)
  • Člen Britské společnosti pro hmotnostní spektrometrii a Britské společnosti pro buněčnou biologii
  • Člen Americké asociace pro výzkum rakoviny (AACR)
  • Člen studijní sekce NIH v letech 2003 a 2004: Bio-válka a infekční nemoci
  • Wellcome Trust VIP Award 2005
  • Cena MRC New Investigator Award 2006-2009

Vybrané publikace

  • Hemelaar, J., Galardy, P. J., Borodovsky, A., Kessler, B. M., Ploegh, H. L., & Ovaa, H. (2004). Chemická funkční funkční proteomika: nástroje pro profilování aktivity založené na mechanismu pro ubikvitin a specifické proteázy podobné ubikvitinu. Journal of proteome research, 3 (2), 268-276.
  • Altun, M., Galardy, P. J., Shringarpure, R., Hideshima, T., LeBlanc, R., Anderson, K. C.,. . . Kessler, B. M. (2005). Účinky PS-341 na aktivitu a složení proteazomů v buňkách mnohočetného myelomu. Cancer research, 65 (17), 7896-7901.
  • Edelmann, M. J., Kramer, H. B., Altun, M., & Kessler, B. M. (2010). Posttranslační modifikace deubikvitinačního enzymu otubain 1 moduluje aktivní hladiny RhoA a náchylnost k invazi Yersinia. Časopis FEBS, 277 (11), 2515-2530.
  • Kramer, H. B., Simmons, A., Gasper-Smith, N., Borrow, P., Lavender, K. J., Qin, L.,. . . Haynes, B.F. (2010). Zvýšení intaktních a proteolytických fragmentů proteinů akutní fáze představuje nejranější systémovou antivirovou odpověď při infekci HIV-1. PLoS Pathog, 6 (5).
  • Parsons, J. L., Dianova, I. I., Khoronenkova, S. V., Edelmann, M. J., Kessler, B. M., & Dianov, G. L. (2011). USP47 je deubikvitylační enzym, který reguluje bazální excizní opravu řízením ustálených hladin DNA polymerázy β. Molecular cell, 41 (5), 609-615.
  • Altun, M., Kramer, H. B., Willems, L. I., McDermott, J. L., Leach, C. A., Goldenberg, S. J.,. . . Kogan, E. (2011). Chemická proteomika založená na aktivitě urychluje vývoj inhibitorů pro deubikvitylační enzymy. Chemistry & biology, 18 (11), 1401-1412.
  • Chauhan, D., Tian, ​​Z., Nicholson, B., Kumar, K. G. S., Zhou, B., Carrasco, R.,. . . Kodrasov, M. P. (2012). Inhibitor ubikvitin specifické proteázy-7 s malou molekulou indukuje apoptózu v buňkách mnohočetného myelomu a překonává rezistenci na bortezomib. Cancer cell, 22 (3), 345-358.
  • Konietnzy, R., Wijnhoven, P., Blackford, A. N., Kessler, B., Travers, J., Nishi, R., & Jackson, S. P. (2015). USP4 auto-deubiquitylation podporuje homologní rekombinaci. Molecular Cell, 60 (3), 362-373.
  • Iglesias-Gato, D., Chuan, Y.-C., Jiang, N., Svensson, C., Bao, J., Shang, Z.,. . . Flores-Morales, A. (2015). Erratum: De ubikvitinační enzym OTUB1 podporuje invazi buněk rakoviny prostaty in vitro a tumorigenezi in vivo. Molecular rakovina, 14, 88.
  • Huang, H., van Dullemen, L., Akhtar, M., Lo Faro, M. L., Yu, Z., Valli, A.,. . . Kessler, B. (2018). Proteo-metabolomika odhaluje kompenzaci mezi ischemickými a neporaněnými kontralaterálními ledvinami po reperfuzi. Vědecké zprávy, 8.
  • Salah, E., Zhang, P., Charles, P., Mathea, S., Damianou, A., Fischer, R.,. . . Scott, H. (2019). Komplexní krajina aktivních deubikvitinačních enzymů vytvořená pomocí pokročilé chemoproteomiky. Frontiers in Chemistry, 7.

Reference

  1. ^ A b „Benedikt Kessler“.
  2. ^ „Benedikt Kessler - Google Scholar“.
  3. ^ Wang, E. W .; Kessler, B. M .; Borodovsky, A .; Cravatt, B. F .; Bogyo, M .; Ploegh, H.L .; Glas, R. (2000). „Integrace dráhy ubikvitin-proteazom s aktivitou cytosolické oligopeptidázy“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (18): 9990–9995. Bibcode:2000PNAS ... 97,9990 W.. doi:10.1073 / pnas.180328897. PMC  27648. PMID  10954757.
  4. ^ „Polosyntetické místně zaměřené sondy na bázi proteinu pro identifikaci a inhibici aktivních míst a jejich metody“.
  5. ^ „Benedikt M Kessler“.
  6. ^ Kessler, Benedikt M .; Glas, Rickard; Ploegh, Hidde L. (2002). „Zpracování antigenu MHC třídy I regulováno cytosolickou proteolýzou - zkratky, které mění generování peptidů“. Molekulární imunologie. 39 (3–4): 171–179. doi:10.1016 / S0161-5890 (02) 00100-1. PMID  12200049.
  7. ^ A b „Profesor Benedikt Kessler“.
  8. ^ „Pfizer zavádí nový model partnerství pro akademický výzkum v rané fázi“.
  9. ^ Altun, Mikael; Galardy, Paul J .; Shringarpure, Reshma; Hideshima, Teru; Leblanc, Richard; Anderson, Kenneth C .; Ploegh, Hidde L .; Kessler, Benedikt M. (2005). „Účinky PS-341 na aktivitu a složení proteazomů v buňkách mnohočetného myelomu“. Výzkum rakoviny. 65 (17): 7896–7901. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-0506. PMID  16140960.
  10. ^ Altun, M .; Walter, T. S .; Kramer, H. B .; Herr, P .; Iphöfer, A .; Boström, J .; David, Y .; Komsany, A .; Ternette, N .; Navon, A .; Stuart, D. I .; Ren, J .; Kessler, B. M. (2015). „Struktura lidského Otubain2-ubikvitinu poskytuje pohled na specifičnost štěpení poly-ubikvitinových vazeb“. PLOS One. 10 (1): e0115344. Bibcode:2015PLoSO..1015344A. doi:10.1371 / journal.pone.0115344. PMC  4295869. PMID  25590432.
  11. ^ A b „Malý inhibitor molekul proteázy specifické pro ubikvitin-7 indukuje apoptózu v buňkách mnohočetného myelomu a překonává rezistenci na bortezomib“.
  12. ^ Kramer, Holger B .; Lavender, Kerry J .; Qin, Li; Stacey, Andrea R .; Liu, Michael K. P .; Di Gleria, Katalin; Simmons, Alison; Gasper-Smith, Nancy; Haynes, Barton F .; McMichael, Andrew J .; Půjčit, Persefona; Kessler, Benedikt M. (2010). „Zvýšení neporušených a proteolytických fragmentů proteinů akutní fáze představuje nejranější systémovou antivirovou odpověď při infekci HIV-1“. PLOS patogeny. 6 (5): e1000893. doi:10.1371 / journal.ppat.1000893. PMC  2865525. PMID  20463814.
  13. ^ Huang, Honglei; Van Dullemen, Leon F. A .; Akhtar, Mohammed Z .; Faro, Maria-Letizia Lo; Yu, Zhanru; Valli, Alessandro; Dona, Anthony; Thézénas, Marie-Laëtitia; Charles, Philip D .; Fischer, Roman; Kaisar, Maria; Leuvenink, Henri G. D .; Ploeg, Rutger J .; Kessler, Benedikt M. (2018). „Proteo-metabolomika odhaluje kompenzaci mezi ischemickými a neporaněnými kontralaterálními ledvinami po reperfuzi“. Vědecké zprávy. 8: 8539. Bibcode:2018NatSR ... 8.8539H. doi:10.1038 / s41598-018-26804-8. PMID  29867102.
  14. ^ Pinto-Fernández, Adán; Davis, Simon; Schofield, Abigail B .; Scott, Hannah C .; Zhang, Ping; Salah, Eidarus; Mathea, Sebastian; Charles, Philip D .; Damianou, Andreas; Bond, Gareth; Fischer, Roman; Kessler, Benedikt M. (2019). „Komplexní krajina aktivních deubikvitinačních enzymů vytvořená pomocí pokročilé chemoproteomiky“. Hranice v chemii. 7: 592. Bibcode:2019FrCh .... 7..592P. doi:10.3389 / fchem.2019.00592. PMID  31555637.
  15. ^ „Funkční proteomika založená na chemii odhaluje nové členy rodiny deubikvitinačních enzymů“.
  16. ^ Edelmann, M. J .; Kramer, H. B .; Altun, M .; Kessler, B. M. (2010). „Posttranslační modifikace deubikvitinačního enzymu otubain 1 moduluje aktivní hladiny RhoA a náchylnost k invazi Yersinia“. FEBS Journal. 277 (11): 2515–30. doi:10.1111 / j.1742-4658.2010.07665.x. PMID  20553488.
  17. ^ Iglesias-Gato, Diego; Chuan, Yin-Choy; Jiang, Ning; Svensson, Charlotte; Bao, Jing; Paul, Indranil; Egevad, Lars; Kessler, Benedikt M .; Wikström, Pernilla; Niu, Yuanjie; Flores-Morales, Amilcar (2015). „Dekubikvitinující enzym OTUB1 podporuje invazi buněk rakoviny prostaty in vitro a tumorigenezi in vivo“. Molekulární rakovina. 14: 8. doi:10.1186 / s12943-014-0280-2. PMID  25623341.
  18. ^ „Automatická deubikvitylace USP4 podporuje homologní rekombinaci“.
  19. ^ Parsons, Jason L .; Dianova, Irina I .; Khoronenkova, Svetlana V .; Edelmann, Mariola J .; Kessler, Benedikt M .; Dianov, Grigory L. (2011). „USP47 je deubikvitylační enzym, který reguluje opravu základní excize kontrolou hladin DNA polymerázy β v ustáleném stavu“. Molekulární buňka. 41 (5): 609–615. doi:10.1016 / j.molcel.2011.02.016. PMID  21362556.
  20. ^ Altun, Mikael; Kramer, Holger B .; Willems, Lianne I .; McDermott, Jeffrey L .; Leach, Craig A .; Goldenberg, Seth J .; Kumar, K.G. Suresh; Konietzny, Rebecca; Fischer, Roman; Kogan, Edward; MacKeen, Mukram M .; McGouran, Joanna; Khoronenkova, Svetlana V .; Parsons, Jason L .; Dianov, Grigory L .; Nicholson, Benjamin; Kessler, Benedikt M. (2011). „Chemická proteomika založená na aktivitě urychluje vývoj inhibitorů pro deubikvitylační enzymy“. Chemie a biologie. 18 (11): 1401–1412. doi:10.1016 / j.chembiol.2011.08.018. PMID  22118674.
  21. ^ Turnbull, Andrew P .; Ioannidis, Stephanos; Krajewski, Wojciech W .; Pinto-Fernandez, Adan; Heride, Claire; Martin, Agnes C.L .; Tonkin, Louise M .; Townsend, Elizabeth C .; Buker, Shane M .; Lancia, David R .; Caravella, Justin A .; Toms, Angela V .; Charlton, Thomas M .; Lahdenranta, Johanna; Wilker, Erik; Následuje, Bruce C .; Evans, Nicola J .; Stead, Lucy; Alli, Cristina; Zarayskiy, Vladislav V .; Talbot, Adam C .; Buckmelter, Alexandre J .; Wang, Minghua; McKinnon, Crystal L .; Saab, Fabienne; McGouran, Joanna F .; Století, Hannah; Gersch, Malte; Pittman, Marc S .; et al. (2017). "Molekulární základ inhibice USP7 selektivními inhibitory s malými molekulami" (PDF). Příroda. 550 (7677): 481–486. Bibcode:2017 Natur.550..481T. doi:10.1038 / příroda24451. PMID  29045389.

externí odkazy