USP4 - USP4
Ubiquitin specifická proteáza 4 (USP4) je enzym který štěpí ubikvitin z řady proteinových substrátů.[5] Před standardizací nomenklatury byl USP4 znám jako UNP a byl jedním z prvních deubikvitinačních enzymů identifikovaných u savců.[6] U myší a člověka je protein USP4 kódován genem obsahujícím 22 exony.[7][8][9]
Tento protein je členem cysteinová peptidáza rodina C19. Jako deubikvitinační enzym je neobvyklé mít schopnost štěpit ubikvitin-prolin vazby.[10] Tato vlastnost může odrážet strukturní flexibilitu v aktivním místě enzymu a může vysvětlovat jeho schopnost štěpit ubikvitinové řetězce různých vazeb. USP4 má substráty důležité funkce v řadě buněčných signálních drah, včetně NF-kB, TGF-p, Wnt / p-katenin, p53, a spliceosome cesty. Mezi další substráty patří receptor adenosinu A2A a Ro52 (TRIM21 ) protein.
USP4 je nukleocytoplazmatický Shuttling protein, který nese funkční signál jaderné lokalizace (NLS) 766QPQKKKK772 a a jaderný exportní signál (NES) 133VEVYLLELKL142.[11] Tyto signály iniciují translokaci USP4 do jádra z cytoplazmy a naopak. Podíl cytoplazmatického na jaderném souboru USP4 se liší v závislosti na typu buňky, fázi buněčného cyklu a úrovni exprese proteinu.[11]
Interakce
USP4 bylo prokázáno komunikovat s tumor supresorem pRb protein a proteiny související s kapsou p107 a p130.[12]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000114316 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032612 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Gray D (2012). „Kapitola 462“. V Rawlings & Salvesen (ed.). Příručka proteolytických enzymů (3. vyd.). Elsevier. ISBN 9780123822192.
- ^ Gupta K, Copeland NG, Gilbert DJ, Jenkins NA, Gray DA (srpen 1993). "Unp, myší gen příbuzný tre onkogenu". Onkogen. 8 (8): 2307–10. PMID 8336951.
- ^ Di Fruscio M, Gilchrist CA, Baker RT, Gray DA (květen 1998). „Genomická struktura Unp, myšího genu kódujícího proteázu specifickou pro ubikvitin“. Biochim. Biophys. Acta. 1398 (1): 9–17. doi:10.1016 / s0167-4781 (98) 00035-9. PMID 9602026.
- ^ Puente XS, Sanchez LM, celkově CM, Lopez-Otin C (červenec 2003). "Lidské a myší proteázy: komparativní genomický přístup". Nat Rev Genet. 4 (7): 544–558. doi:10.1038 / nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.
- ^ „Entrez Gene: USP4 ubikvitinová specifická peptidáza 4 (protoonkogen)“.
- ^ Gilchrist CA, Gray DA, Baker RT (prosinec 1997). „Proteáza specifická pro ubikvitin, která účinně štěpí vazbu ubikvitin-prolin“. J. Biol. Chem. 272 (51): 32280–5. doi:10.1074 / jbc.272.51.32280. PMID 9405433.
- ^ A b Soboleva, Tatiana A .; Jans, David A .; Johnson-Saliba, Melanie; Baker, Rohan T. (2004-10-18). „Nuclear-Cytoplasmic Shuttling of the Oncogenic Mouse UNP / USP4 Deubiquitylating Enzyme“. Journal of Biological Chemistry. 280 (1): 745–752. doi:10,1074 / jbc.m401394200. ISSN 0021-9258. PMID 15494318.
- ^ Blanchette, Paola; Gilchrist, Catherine A; Baker, Rohan T; Gray, Douglas A (září 2001). „Sdružení UNP, proteázy specifické pro ubikvitin, s kapsovými proteiny pRb, p107 a p130“. Onkogen. 20 (39): 5533–5537. doi:10.1038 / sj.onc.1204823. ISSN 0950-9232. PMID 11571651.
Další čtení
- D'Andrea A, Pellman D (1999). „Deubikvitinační enzymy: nová třída biologických regulátorů“. Krit. Biochem. Mol. Biol. 33 (5): 337–352. doi:10.1080/10409239891204251. PMID 9827704.
- Gray DA, Inazawa J, Gupta K a kol. (1995). "Zvýšená exprese Unph, protoonkogenu na 3p21.3, v lidských plicních nádorech". Onkogen. 10 (11): 2179–83. PMID 7784062.
- Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–174. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Gupta K, Chevrette M, Gray DA (1994). „Protononkogen Unp kóduje jaderný protein“. Onkogen. 9 (6): 1729–31. PMID 8183569.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–156. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Di Donato F, Chan EK, Askanase AD a kol. (2001). "Interakce mezi 52 kDa SSA / Ro a deubikvitinačním enzymem UnpEL: klíč k fungování". Int. J. Biochem. Cell Biol. 33 (9): 924–934. doi:10.1016 / S1357-2725 (01) 00055-3. PMID 11461834.
- Blanchette P, Gilchrist CA, Baker RT, Gray DA (2001). „Sdružení UNP, proteázy specifické pro ubikvitin, s kapsovými proteiny pRb, p107 a p130“. Onkogen. 20 (39): 5533–5537. doi:10.1038 / sj.onc.1204823. PMID 11571651.
- DeSalle LM, Latres E, Lin D a kol. (2001). „Dekubikvitinační enzym Unp interaguje s proteinem retinoblastomu“. Onkogen. 20 (39): 5538–5542. doi:10.1038 / sj.onc.1204824. PMID 11571652.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–16903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Wada K, Tanji K, Kamitani T (2006). „Onkogenní protein UnpEL / Usp4 deubikvitinuje Ro52 svou isopeptidázovou aktivitou“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 339 (3): 731–736. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.11.076. PMID 16316627.
- Wada K, Kamitani T (2006). Msgstr "UnpEL / Usp4 je ubikvitinován Ro52 a deubikvitinován sám". Biochem. Biophys. Res. Commun. 342 (1): 253–258. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.01.144. PMID 16472766.
externí odkazy
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q13107 (Ubiquitin karboxyl-terminální hydroláza 4) na PDBe-KB.
Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |