USP47 - USP47

USP47
Identifikátory
Aliasy	USP47, TRFP, ubikvitin specifická peptidáza 47
Externí ID	OMIM: 614460 MGI: 1922246 HomoloGene: 9929 Genové karty: USP47
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	11,959,323 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	112,111,661 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba domény WD40-repeat; • aktivita peptidázy; • aktivita hydrolázy; • aktivita peptidázy cysteinového typu; • thiol-závislá ubiquitin-specifická proteázová aktivita; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 1904 265 aktivita ubikvitinyl hydrolázy; • aktivita endopeptidázy cysteinového typu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • SCF ubikvitin ligasový komplex; • nukleoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • proteolýza; • negativní regulace apoptotického procesu; • buněčná odpověď na UV záření; • negativní regulace vnitřní apoptotické signální dráhy v reakci na poškození DNA; • Oprava DNA; • pozitivní regulace buněčného růstu; • monubiquitinated protein deubiquitination; • oprava základní excize; • negativní regulace přechodu G2 / M mitotického buněčného cyklu; • reakce na drogu; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace aktivity endopeptidázy cysteinového typu účastnící se apoptotického procesu; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • deubikvitinace bílkovin; • pozitivní regulace kanonické signální dráhy Wnt; • regulace stability proteinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	55031
	74996
	ENSG00000170242
	ENSMUSG00000059263
	Q96K76
	Q8BY87
	NM_001282659; NM_017944; NM_001330208
	NM_133758; NM_177249; NM_001357952
NP_001269588; NP_001317137; NP_060414; NP_001359020; NP_001359021;
	NP_001359022; NP_001359023; NP_001359024; NP_001359025; NP_001359026; NP_001359027; NP_001359028; NP_001359029; NP_001359030; NP_001359031; NP_001359032
	NP_598519; NP_796223; NP_001344881
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ubiquitin karboxyl-terminální hydroláza 47 je enzym že u lidí je kódován USP47 gen.^[5]^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000170242 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000059263 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Puente XS, Sanchez LM, celkově CM, Lopez-Otin C (červenec 2003). "Lidské a myší proteázy: komparativní genomický přístup". Nat Rev Genet. 4 (7): 544–58. doi:10.1038 / nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.
^ „Entrez Gene: USP47 ubikvitin specifická peptidáza 47“.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace cDNA knihovny obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Sato S, Tomomori-Sato C, Banks CA a kol. (2003). "Identifikace savčích podjednotek Mediator s podobnostmi s kvasinkami Mediator podjednotek Srb5, Srb6, Med11 a Rox3". J. Biol. Chem. 278 (17): 15123–7. doi:10,1074 / jbc.C300054200. PMID 12584197.
Sato S, Tomomori-Sato C, Banks CA a kol. (2004). „Savčí homolog transkripčního koaktivátoru intersexu Drosophila melanogaster je podjednotkou savčího mediátorového komplexu“. J. Biol. Chem. 278 (50): 49671–4. doi:10.1074 / jbc.C300444200. PMID 14576168.
Tomomori-Sato C, Sato S, Parmely TJ a kol. (2004). "Savčí podjednotka mediátoru, která sdílí vlastnosti s podjednotkou mediátoru Saccharomyces cerevisiae Cse2". J. Biol. Chem. 279 (7): 5846–51. doi:10,1074 / jbc.M312523200. PMID 14638676.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Quesada V, Díaz-Perales A, Gutiérrez-Fernández A, et al. (2004). „Klonování a enzymatická analýza 22 nových proteáz specifických pro lidský ubikvitin“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 314 (1): 54–62. doi:10.1016 / j.bbrc.2003.12.050. PMID 14715245.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA a kol. (2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000170242 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000059263 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12838346-5] Puente XS, Sanchez LM, celkově CM, Lopez-Otin C (červenec 2003). "Lidské a myší proteázy: komparativní genomický přístup". Nat Rev Genet. 4 (7): 544–58. doi:10.1038 / nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.

[entrez-6] „Entrez Gene: USP47 ubikvitin specifická peptidáza 47“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]