BECN1 - BECN1

BECN1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2P1L, 2PON, 3DVU, 4DDP, 4MI8
Identifikátory
Aliasy	BECN1, ATG6, VPS30, beclin1, beclin 1
Externí ID	OMIM: 604378 MGI: 1891828 HomoloGene: 2794 Genové karty: BECN1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	42,833,350 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	101,302,286 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba fosfatidylinositol 3-kinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba GTPázy; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • vazba protein kinázy; • aktivita homodimerizace proteinu;
Buněčná složka	• endosomová membrána; • cytoplazma; • mitochondriální membrány; • trans-Golgiho síť; • Golgiho aparát; • cytosol; • buněčné jádro; • autofagozom; • pre-autofagozomální struktura; • membrána; • dendrit; • endoplazmatické retikulum; • komplex fosfatidylinositol 3-kinázy, třída III; • membrána endoplazmatického retikula; • komplex fosfatidylinositol 3-kinázy, třída III, typ II; • cytoplazmatický váček; • endozom; • vnější složka membrány; • komplex fosfatidylinositol 3-kinázy, třída III, typ I; • fagocytární váček; • mitochondrie; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• negativní regulace buněčné proliferace; • reakce na hypoxii; • buněčná odpověď na iont hliníku; • reakce na vitamin E.; • organizace lysozomů; • buněčný cyklus; • pozitivní regulace signalizace fosfatidylinositol 3-kinázy; • buněčná odpověď na hladovění glukózy; • buněčná obranná odpověď; • cytokineze; • buněčná odpověď na stimul epidermálního růstového faktoru; • buněčné dělení; • receptorový katabolický proces; • autofagie jádra; • buněčná odpověď na hladovění dusíkem; • GO: virový proces 0022415; • transport pozdního endosomu do vakuoly; • apoptotický proces; • transport cytoplazmy do vakuoly cestou Cvt; • endocytóza; • pohlcení apoptotické buňky; • pozitivní regulace připojení mitotických vřetenových mikrotubulů na kinetochore; • amyloid-beta metabolický proces; • vývoj neuronů; • obranná reakce na virus; • reakce na jiný organismus; • kongres mitotické metafázové desky; • reakce na drogu; • GO: 0048552 regulace katalytické aktivity; • negativní regulace metabolického procesu reaktivních forem kyslíku; • regulace cytokineze; • negativní regulace apoptotického procesu; • negativní regulace buněčné smrti; • autofagozomální sestava; • makroautofagie; • stárnutí; • reakce na iont železa (II); • reakce na iont olova; • deubikvitinace bílkovin; • reakce na hladinu živin; • buněčná odpověď na hladovění aminokyselin; • buněčná odpověď na peroxid vodíku; • buněčná odpověď na iont mědi; • negativní regulace organizace lysozomů; • pozitivní regulace sestavy autofagozomu; • autofagie mitochondrií; • mitofagie; • autofagie; • pozitivní regulace autofagie; • reakce na mitochondriální depolarizaci; • transport raného endosomu k pozdnímu endosomu; • negativní regulace autofagie; • pozitivní regulace hypertrofie srdečního svalu; • negativní regulace sestavy autofagozomu; • pozitivní regulace vnitřní apoptotické signální dráhy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8678
	56208
	ENSG00000126581
	ENSMUSG00000035086
	Q14457
	O88597
	NM_001313998; NM_001313999; NM_001314000; NM_003766
	NM_019584; NM_001359819; NM_001359820; NM_001359821
	NP_001300927; NP_001300928; NP_001300929; NP_003757
	NP_062530; NP_001346748; NP_001346749; NP_001346750
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Beclin-1 je protein že u lidí je kódován BECN1 gen.^[5]^[6] Beclin-1 je savec ortolog genu 6 souvisejícího s kvasinkovou autofagií (Atg6) a BEC-1 v C. elegans hlístice.^[7] Tento protein interaguje s oběma BCL-2 nebo PI3k třída III, která hraje klíčovou roli v regulaci obou autofagie a buněčná smrt.

Role v nemoci

Beclin-1 hraje důležitou roli v tumorigeneze, a neurodegenerace, který je zapojen do autofagický programovaná buněčná smrt.^[8] Rakovina vaječníků s upregulovanou autofagie má méně agresivní chování a lépe reaguje na chemoterapii.^[9]

Schizofrenie je spojen s nízkými hladinami Beclin-1 v hipokampu postižených, což způsobuje snížení autofagie což má za následek zvýšenou smrt neuronálních buněk.^[10]

Interakce

Bylo prokázáno, že BECN1 komunikovat s:

Modulátory

Trehalóza: Trehalóza snižuje poměr p62 / Beclin-1 a zvyšuje se autofagie v čelní kůře ICR myší, pravděpodobně zvýšením Beclin-1.^[13]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000126581 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035086 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Liang XH, Kleeman LK, Jiang HH, Gordon G, Goldman JE, Berry G a kol. (Listopad 1998). „Ochrana před smrtelnou encefalitidou viru Sindbis beclinem, novým proteinem interagujícím s Bcl-2“. Journal of Virology. 72 (11): 8586–96. doi:10.1128 / JVI.72.11.8586-8596.1998. PMC 110269. PMID 9765397.
^ "Entrez Gene: BECN1 beclin 1 (coiled-coil, myosin-like BCL2 interagující protein)".
^ Takacs-Vellai K, Vellai T, Puoti A, Passannante M, Wicky C, Streit A a kol. (Srpen 2005). „Inaktivace autofagického genu bec-1 spouští apoptotickou buněčnou smrt u C. elegans“. Aktuální biologie. 15 (16): 1513–7. doi:10.1016 / j.cub.2005.07.035. PMID 16111945. S2CID 7404414.
^ Zhong Y, Wang QJ, Li X, Yan Y, Backer JM, Chait BT a kol. (Duben 2009). "Výrazná regulace autofagické aktivity Atg14L a Rubicon spojená s komplexem 1-fosfatidylinositol-3-kinázy Beclin". Přírodní buněčná biologie. 11 (4): 468–76. doi:10.1038 / ncb1854. PMC 2664389. PMID 19270693.
^ ^A ^b Valente G, Morani F, Nicotra G, Fusco N, Peracchio C, Titone R a kol. (2014). "Exprese a klinický význam autofagických proteinů BECLIN 1 a LC3 u rakoviny vaječníků". BioMed Research International. 2014: 462658. doi:10.1155/2014/462658. PMC 4127242. PMID 25136588.
^ Merenlender-Wagner A, Malishkevich A, Shemer Z, Udawela M, Gibbons A, Scarr E a kol. (Únor 2015). „Autofagie má klíčovou roli v patofyziologii schizofrenie“. Molekulární psychiatrie. 20 (1): 126–32. doi:10,1038 / mp.2013,174. PMC 4320293. PMID 24365867. Shrnutí ležel – MediLexicon International Ltd..
^ Erlich S, Mizrachy L, Segev O, Lindenboim L, Zmira O, Adi-Harel S a kol. (2007). „Diferenciální interakce mezi členy rodiny Beclin 1 a Bcl-2“. Autofagie. 3 (6): 561–8. doi:10,4161 / auto. 4713. PMID 17643073.
^ Yue Z, Horton A, Bravin M, DeJager PL, Selimi F, Heintz N (srpen 2002). "Nový proteinový komplex spojující delta 2 glutamátový receptor a autofagii: důsledky pro neurodegeneraci u pytlíků". Neuron. 35 (5): 921–33. doi:10.1016 / S0896-6273 (02) 00861-9. PMID 12372286. S2CID 10534933.
^ Kara NZ, Toker L, Agam G, Anderson GW, Belmaker RH, Einat H (září 2013). "Trehalóza vyvolala u myší podobné účinky jako antidepresivum a zvýšení autofagie". Psychofarmakologie. 229 (2): 367–75. doi:10.1007 / s00213-013-3119-4. PMID 23644913. S2CID 17641899.

Další čtení

Funderburk SF, Wang QJ, Yue Z (červen 2010). „Komplex Beclin 1-VPS34 - na křižovatce autofagie a dále“. Trendy v buněčné biologii. 20 (6): 355–62. doi:10.1016 / j.tcb.2010.03.002. PMC 3781210. PMID 20356743.
Rommens JM, Durocher F, McArthur J, Tonin P, LeBlanc JF, Allen T a kol. (Srpen 1995). "Generování transkripční mapy na HSD17B lokusu centromerickém k BRCA1 v 17q21". Genomika. 28 (3): 530–42. doi:10.1006 / geno.1995.1185. PMID 7490091.
Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Aita VM, Liang XH, Murty VV, Pincus DL, Yu W, Cayanis E a kol. (Červenec 1999). "Klonování a genomová organizace beclinu 1, kandidátského tumor supresorového genu na chromozomu 17q21". Genomika. 59 (1): 59–65. doi:10.1006 / geno.1999.5851. PMID 10395800.
Liang XH, Jackson S, Seaman M, Brown K, Kempkes B, Hibshoosh H, Levine B (prosinec 1999). "Indukce autofagie a inhibice tumorigeneze beclinem 1". Příroda. 402 (6762): 672–6. Bibcode:1999 Natur.402..672L. doi:10.1038/45257. PMID 10604474. S2CID 4423132.
Kihara A, Kabeya Y, Ohsumi Y, Yoshimori T (duben 2001). „Komplex beclin-fosfatidylinositol 3-kinázy funguje v trans-Golgiho síti“. Zprávy EMBO. 2 (4): 330–5. doi:10.1093 / embo-reports / kve061. PMC 1083858. PMID 11306555.
Liang XH, Yu J, Brown K, Levine B (duben 2001). „Beclin 1 obsahuje nukleární exportní signál bohatý na leucin, který je vyžadován pro jeho autofagii a funkci potlačující nádory“. Výzkum rakoviny. 61 (8): 3443–9. PMID 11309306.
Weinmann AS, Bartley SM, Zhang T, Zhang MQ, Farnham PJ (říjen 2001). „Použití imunoprecipitace chromatinu ke klonování nových cílových promotorů E2F“. Molekulární a buněčná biologie. 21 (20): 6820–32. doi:10.1128 / MCB.21.20.6820-6832.2001. PMC 99859. PMID 11564866.
Yue Z, Horton A, Bravin M, DeJager PL, Selimi F, Heintz N (srpen 2002). "Nový proteinový komplex spojující delta 2 glutamátový receptor a autofagii: důsledky pro neurodegeneraci u pytlíků". Neuron. 35 (5): 921–33. doi:10.1016 / S0896-6273 (02) 00861-9. PMID 12372286. S2CID 10534933.
Song H, Xia SL, Liao C, Li YL, Wang YF, Li TP, Zhao MJ (únor 2004). "Geny kódující Pir51, Beclin 1, RbAp48 a aldolázu b jsou v lidském primárním hepatocelulárním karcinomu regulovány nahoru nebo dolů". World Journal of Gastroenterology. 10 (4): 509–13. doi:10,3748 / wjg.v10.i4,509. PMC 4716970. PMID 14966907.
Scarlatti F, Bauvy C, Ventruti A, Sala G, Cluzeaud F, Vandewalle A a kol. (Duben 2004). „Makroautofagie zprostředkovaná ceramidem zahrnuje inhibici proteinkinázy B a regulaci vzestupu beclinu 1“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (18): 18384–91. doi:10,1074 / jbc.M313561200. PMID 14970205.
Furuya D, Tsuji N, Yagihashi A, Watanabe N (červenec 2005). „Beclin 1 zvýšil apoptózu vyvolanou cis-diamminedichloroplatinou zvýšením aktivity kaspázy-9“. Experimentální výzkum buněk. 307 (1): 26–40. doi:10.1016 / j.yexcr.2005.02.023. PMID 15922724.
Kruse KB, Brodsky JL, McCracken AA (leden 2006). „Charakterizace genu ERAD jako VPS30 / ATG6 odhaluje dvě alternativní a funkčně odlišné cesty kontroly kvality proteinu: jednu pro rozpustnou Z variantu inhibitoru lidské alfa-1 proteinázy (A1PiZ) a druhou pro agregáty A1PiZ“. Molekulární biologie buňky. 17 (1): 203–12. doi:10,1091 / mbc.E04-09-0779. PMC 1345659. PMID 16267277.
Zeng X, Overmeyer JH, Maltese WA (leden 2006). „Funkční specificita savčího komplexu 3-kinázy Beclin-Vps34 PI v makroautofagii versus endocytóza a obchodování s lysozomálními enzymy“. Journal of Cell Science. 119 (Pt 2): 259–70. doi:10.1242 / jcs.02735. PMID 16390869.
Shibata M, Lu T, Furuya T, Degterev A, Mizushima N, Yoshimori T a kol. (Květen 2006). "Regulace intracelulární akumulace mutantního Huntingtinu pomocí Beclinu 1". The Journal of Biological Chemistry. 281 (20): 14474–85. doi:10,1074 / jbc.M600364200. PMID 16522639.
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF a kol. (Květen 2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
Daniel F, Legrand A, Pessayre D, Vadrot N, Descatoire V, Bernuau D (květen 2006). „Částečné umlčení Beclinu 1 zhoršuje apoptózu indukovanou doxorubicinem a Fas v buňkách HepG2“. World Journal of Gastroenterology. 12 (18): 2895–900. doi:10,3748 / wjg.v12.i18.2895. PMC 4087807. PMID 16718815.

externí odkazy

Člověk BECN1 umístění genomu a BECN1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q14457 (Beclin-1) u PDBe-KB.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000126581 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035086 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9765397-5] A ^b Liang XH, Kleeman LK, Jiang HH, Gordon G, Goldman JE, Berry G a kol. (Listopad 1998). „Ochrana před smrtelnou encefalitidou viru Sindbis beclinem, novým proteinem interagujícím s Bcl-2“. Journal of Virology. 72 (11): 8586–96. doi:10.1128 / JVI.72.11.8586-8596.1998. PMC 110269. PMID 9765397.

[entrez-6] "Entrez Gene: BECN1 beclin 1 (coiled-coil, myosin-like BCL2 interagující protein)".

[pmid16111945-7] Takacs-Vellai K, Vellai T, Puoti A, Passannante M, Wicky C, Streit A a kol. (Srpen 2005). „Inaktivace autofagického genu bec-1 spouští apoptotickou buněčnou smrt u C. elegans“. Aktuální biologie. 15 (16): 1513–7. doi:10.1016 / j.cub.2005.07.035. PMID 16111945. S2CID 7404414.

[pmid19270693-8] Zhong Y, Wang QJ, Li X, Yan Y, Backer JM, Chait BT a kol. (Duben 2009). "Výrazná regulace autofagické aktivity Atg14L a Rubicon spojená s komplexem 1-fosfatidylinositol-3-kinázy Beclin". Přírodní buněčná biologie. 11 (4): 468–76. doi:10.1038 / ncb1854. PMC 2664389. PMID 19270693.

[Valente_2014-9] A ^b Valente G, Morani F, Nicotra G, Fusco N, Peracchio C, Titone R a kol. (2014). "Exprese a klinický význam autofagických proteinů BECLIN 1 a LC3 u rakoviny vaječníků". BioMed Research International. 2014: 462658. doi:10.1155/2014/462658. PMC 4127242. PMID 25136588.

[pmid24365867-10] Merenlender-Wagner A, Malishkevich A, Shemer Z, Udawela M, Gibbons A, Scarr E a kol. (Únor 2015). „Autofagie má klíčovou roli v patofyziologii schizofrenie“. Molekulární psychiatrie. 20 (1): 126–32. doi:10,1038 / mp.2013,174. PMC 4320293. PMID 24365867. Shrnutí ležel – MediLexicon International Ltd..

[pmid17643073-11] Erlich S, Mizrachy L, Segev O, Lindenboim L, Zmira O, Adi-Harel S a kol. (2007). „Diferenciální interakce mezi členy rodiny Beclin 1 a Bcl-2“. Autofagie. 3 (6): 561–8. doi:10,4161 / auto. 4713. PMID 17643073.

[pmid12372286-12] Yue Z, Horton A, Bravin M, DeJager PL, Selimi F, Heintz N (srpen 2002). "Nový proteinový komplex spojující delta 2 glutamátový receptor a autofagii: důsledky pro neurodegeneraci u pytlíků". Neuron. 35 (5): 921–33. doi:10.1016 / S0896-6273 (02) 00861-9. PMID 12372286. S2CID 10534933.

[13] Kara NZ, Toker L, Agam G, Anderson GW, Belmaker RH, Einat H (září 2013). "Trehalóza vyvolala u myší podobné účinky jako antidepresivum a zvýšení autofagie". Psychofarmakologie. 229 (2): 367–75. doi:10.1007 / s00213-013-3119-4. PMID 23644913. S2CID 17641899.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]