Amfipatické lipidové motivy senzoru balení - Amphipathic lipid packing sensor motifs

Amfipatický Senzor pro balení lipidů (ALPS) motivy byly poprvé identifikovány v roce 2005 v ARFGAP1[1][2] a byly zkontrolovány.[3][4]

Amfipatické lipidové balení Senzorové motivy proteinů se spojují s (adsorbovat do) zakřivené lipidové dvojvrstvy.[5]

Zakřivení a fosfolipid dvouvrstvá, například do a liposom, způsobuje narušení balení lipidů na straně dvojvrstvy, která má větší povrch (například na vnější straně liposomu). Méně „objednané“ nebo „volnější“ balení lipidů rozpoznávají motivy ALPS.

Motivy ALPS jsou 20 až 40 aminokyselina dlouhé porce bílkoviny které mají důležité soubory typů aminokyselinových zbytků. Objemný hydrofobní aminokyselinové zbytky, jako např Fenylalanin, Leucin, a Tryptofan jsou přítomny každé 3 nebo 4 pozice, s mnoha polární ale nenabité aminokyselinové zbytky jako např Glycin, Serine a Threonin mezi. ALPS je v řešení nestrukturovaný, ale složí se jako alfa šroubovice pokud jsou spojeny s membránovou dvojvrstvou, tak, že hydrofobní zbytky se vloží mezi volně zabalené lipidy a polární zbytky směřují k vodný cytoplazma.

Reference

  1. ^ Bigay J, Casella JF, Drin G, Mesmin B, Antonny B (červenec 2005). „ArfGAP1 reaguje na zakřivení membrány složením motivu senzoru těsnění lipidů“. Časopis EMBO. 24 (13): 2244–53. doi:10.1038 / sj.emboj.7600714. PMC  1173154. PMID  15944734.
  2. ^ Drin G, Casella JF, Gautier R, Boehmer T, Schwartz TU, Antonny B (únor 2007). "Obecný amfipatický alfa-šroubovicový motiv pro snímání zakřivení membrány". Přírodní strukturní a molekulární biologie. 14 (2): 138–46. doi:10.1038 / nsmb1194. PMID  17220896. S2CID  11377393.
  3. ^ Bradshaw RA, Stahl PD (2015). Encyclopedia of Cell Biology (1. vyd.). Cambridge MA: Academic Press. p. 206. ISBN  978-0123944474.
  4. ^ Vanni S, Vamparys L, Gautier R, Drin G, Etchebest C, Fuchs PF, Antonny B (únor 2013). „Motivy senzoru balení amfipatického lipidu: zkoumání defektů dvouvrstvy hydrofobními zbytky“. Biofyzikální deník. 104 (3): 575–84. Bibcode:2013BpJ ... 104..575V. doi:10.1016 / j.bpj.2012.11.3837. PMC  3566459. PMID  23442908.
  5. ^ Horchani H, de Saint-Jean M, Barelli H, Antonny B (2014). „Interakce motivu membránového senzoru Spo20 s kyselinou fosfatidovou a jinými aniontovými lipidy a vliv prostředí membrány“. PLOS ONE. 9 (11): e113484. Bibcode:2014PLoSO ... 9k3484H. doi:10.1371 / journal.pone.0113484. PMC  4245137. PMID  25426975.