Addgene - Addgene
 | Zdá se, že hlavní přispěvatel do tohoto článku má úzké spojení s jeho předmětem. (Prosinec 2015) (Zjistěte, jak a kdy odstranit tuto zprávu šablony) |
 | |
| Založený | 2004 |
|---|---|
| Zakladatel | Benjie Chen Kenneth Fan Melina Fan |
| Typ | Nezisková organizace, Centrum biologických zdrojů |
| Umístění | |
| Služby | Plazmidové úložiště |
Addgene je nezisková organizace plazmid úložiště. Addgene usnadňuje výměnu genetického materiálu mezi laboratořemi tím, že nabízí plazmidy a související klonovací data neziskovým laboratořím po celém světě. Addgene poskytuje bezplatnou online databázi plazmových klonovacích informací a odkazů, včetně populárních seznamů běžně používaných vektorových páteřních řetězců lentiviral plazmidy a molekulární klonování protokoly.
Dějiny
Addgene založili v roce 2004 Melina Fan, Kenneth Fan a Benjie Chen.[1][2]
Operace
Sídlo společnosti Addgene se nachází v Watertown, Massachusetts.
Addgene přijímá plazmidy od výzkumníků k distribuci a archivaci. Společnost Addgene získává výnosy a licenční poplatky pomocí bezplatného depozitáře pro komerční prodej a je selektivní dle libosti při prodeji získaných depozitních plazmidů 501 (c) 3 neziskovým organizacím za průmyslovou cenu za účelem zisku pro svou domnělou neziskovou činnost.
Organizace kryje provozní náklady na údržbu a zlepšování sběru účtováním nominálního poplatku vědcům požadujícím plazmidy.[3]
Plazmidové úložiště
Od roku 2014 úložiště Addgene obsahovalo 30 000 plazmidů uložených v 1700 laboratořích.[4] Jeho plazmidová sbírka obsahuje plazmidy používané pro funkce, jako je genomové inženýrství (včetně CRISPRS), genová exprese, shRNA knockdown, dodání viru zprostředkovaného genu, detekce miRNA a promotérská činnost. Sbírka plazmidů zahrnuje:
- Genomové inženýrství
- CRISPR
- Transkripční aktivátorová efektorová nukleáza (TALEN) sady
- Nukleáza se zinkovým prstem soupravy
- Prázdné páteře
- Druhově specifický výraz
- Epitopové značky
- Fúzní proteiny
- Volitelné značky
- Fluorescenční značka
- Virové vektory
- cDNA výraz
- exprese shRNA
Nástroje a vodítka
Nástroje molekulární biologie
Vektorová databáze —Aktualizovaný seznam více než 4 000 páteřních vektorů, včetně příslušných informací o klonování a podmínek bakteriálního růstu.
Sekvenční analyzátor —Softwarový nástroj Addgene pro vytváření plazmidových map ze sekvencí s anotovanými rysy a restrikčními místy.
Reference molekulární biologie —Skupina odkazů na činidla pro molekulární biologii, jako jsou primery, restrikční enzymy a koncentrace antibiotik.
Průvodce plazmovým klonováním
Molekulární klonovací vodítka —Odkazy, které vědcům pomohou navrhnout experimenty s klonováním plazmidů, včetně tutoriálů o digesci restrikčními enzymy a klonování na základě PCR.
Molekulární klonovací protokoly —Specifické protokoly pro různé techniky klonování plazmidů, jako je izolace bakteriálních kolonií, čištění DNA pomocí Gelová elektroforéza a bakteriální transformace.
Spolupráce
Addgene spolupracuje s ústavy a konsorcii na přípravě plazmidových sbírek pro konkrétní účely. Mezi příklady těchto spoluprácí patří speciální sbírky z Konsorcium pro strukturální genomiku Konsorcium pro zinkový prst, Konsorcium pro migraci buněk, KLF sběr a Nadace Michaela J. Foxe.[5] Plazmidy jsou k dispozici akademickým i průmyslovým laboratořím.
Vkladatelé
Mezi pozoruhodné vkladatele patří:[Citace je zapotřebí ]
- 12 nositelů Nobelovy ceny; John Gurdon, Shinya Yamanaka, Bruce Beutler, Mario Capecchi, Andrew Fire, Richard Axel, Eric Wieschaus, Phillip Sharp, Robert Lefkowitz, Martin Chalfie, Roger Tsien a Johann Deisenhofer.
- 8 průlomových cen pro vítěze biologických věd; Cori Bargmann, David Botstein, Lewis C. Cantley, Hans Clevers, Titia de Lange, Bert Vogelstein, Robert Weinberg a Shinya Yamanaka.
Smlouvy o elektronickém převodu materiálu
Addgene vyžaduje Dohody o převodu materiálu (MTA) pro všechny materiály přenášené prostřednictvím Addgene k ochraně duševního vlastnictví plazmidových depozitářů. Addgene vyvinul jeden z prvních elektronických systémů pro zpracování MTA.[6] Použitím standardní smlouvy o převodu biologického materiálu (Universal Biological Material Transfer Agreement - UBMTA) a implementací elektronických podpisů urychluje elektronický systém Addgene MTA (eMTA) proces schvalování objednávek plazmidů.
Ocenění
Addgene získal ocenění za inovace a výzkum, včetně ceny Mass Nonprofit Network Award za vynikající výsledky v oblasti inovací,[7][8] Program ocenění Cambridge Award 2014 Award for Research & Development Laboratories,[9] Finalista ceny Mass Technology Leadership Award 2012.[10]
Reference
- ^ Scudellari, Megan (2012). „Snadné sdílení“. Vědec. Citováno 21. listopadu 2012.
- ^ Ventilátor, M; Tsai, J; Chen, B; Fan, K; LaBaer, J (25. března 2005). "Centrální úložiště pro publikované plazmidy". Věda. 307 (5717): 1877. doi:10.1126 / science.307.5717.1877a. PMID 15790830.
- ^ Kamens, J (2012). „Máte nějaké plazmidy?“ (PDF). Laboratorní časy. str. 58–59. Citováno 21. listopadu 2012.
- ^ Baker, Monya. „Úložiště sdílejí klíčové výzkumné nástroje“. Nature.com. Citováno 8. května 2014.
- ^ Resende, Patricia (3. října 2012). „Addgene spolupracuje s Nadací Michaela J. Foxe“. Mass High Tech. Archivovány od originál dne 9. října 2012. Citováno 21. listopadu 2012.
- ^ Herscovitch, Melanie; Perkins, Eric; Baltus, Andy; Fan, Melina (10. dubna 2012). "Addgene poskytuje otevřené fórum pro sdílení plazmidů". Přírodní biotechnologie. 30 (4): 316–317. doi:10,1038 / nbt.2177. PMID 22491276.
- ^ „masová nezisková síť nominuje addgene na cenu excelence“ (PDF). Citováno 9. května 2014.
- ^ „masová nezisková, nezisková cena 2013 za vynikající výsledky v oblasti inovací finalistů“. Archivovány od originál dne 02.09.2013. Citováno 9. května 2014.
- ^ „udělování uznání cambridge“. Citováno 9. května 2014.
- ^ „Mass Tech oznamuje finalistu“. Citováno 9. května 2014.