ATP syntáza podjednotka C. - ATP synthase subunit C

2bl2.png
Sodík typu V ATPáza z Enterococcus hirae. Vypočtené hranice uhlovodíků lipidová dvojvrstva jsou zobrazeny červenými a modrými tečkami
Identifikátory
SymbolATP-synt_C
PfamPF00137
InterProIPR002379
STRÁNKAPDOC00526
SCOP21aty / Rozsah / SUPFAM
OPM nadčeleď5
OPM protein2bl2

ATPáza, podjednotka C komplexu Fo / Vo je hlavní transmembránová podjednotka typu V, typu A a typu F. ATP syntázy.  Podjednotka C. (také zvaný podjednotka 9 nebo proteolipid ve F-ATPázách nebo 16 kDa proteolipid ve V-ATPázách) byl nalezen v komplexu Fo nebo Vo F- a V-ATPáz. Podjednotky tvoří oligomerní c kroužek které tvoří Fo / Vo / Ao rotor, kde se skutečný počet podjednotek mezi konkrétními enzymy značně liší.[1]

ATPázy (nebo ATP syntázy) jsou membránově vázané enzymové komplexy / iontové transportéry, které kombinují syntézu ATP a / nebo hydrolýzu s transportem protonů přes membránu. ATPázy mohou využívat energii z protonového gradientu pomocí toku iontů přes membránu protonovým kanálem ATPázy k řízení syntézy ATP. Některé ATPázy pracují obráceně a využívají energii z hydrolýzy ATP k vytvoření protonového gradientu. Existují různé typy ATPáz, které se vyznačují funkcí (syntéza ATP a / nebo hydrolýza), strukturou (F-, V- a A-ATPázy obsahují rotační motory) a typem iontů, které transportují.[2][3]

Každá z F-ATPáz (nebo F1Fo ATPáz) a V-ATPáz (nebo V1Vo ATPáz) se skládá ze dvou spojených komplexů: komplex F1 nebo V1 obsahuje katalytické jádro, které syntetizuje / hydrolyzuje ATP, a komplex Fo nebo Vo, který tvoří membrána překlenující póry. Všechny F- a V-ATPázy obsahují rotační motory, jeden pro translokaci protonů přes membránu a druhý pro syntézu / hydrolýzu ATP.[4][5]

U F-ATPáz vede tok protonů kanálem ATPázy rotaci prstence podjednotky C, který je zase spojen s rotací komplexu gama podjednotky rotoru F1 kvůli trvalé vazbě mezi podjednotkami gama a epsilon F1 a C podjednotkový kruh Fo. Sekvenční protonace a deprotonace Asp61 podjednotky C je spojena s postupným pohybem rotoru.[6]

Ve V-ATPázách existují tři proteolipidové podjednotky (c, c 'a c'), které tvoří část proton-vodivých pórů, z nichž každá obsahuje zakopaný zbytek kyseliny glutamové, který je nezbytný pro transport protonů.[7][8]

V nedávné studii byla c-podjednotka označena jako kritická součást přechodového póru mitochondriální permeability.[9]

Podskupiny

Lidské proteiny obsahující tuto doménu

ATP5G1; ATP5G2; ATP5G3; ATP6V0B; ATP6V0C;

Viz také

Diarylchinolin

Reference

  1. ^ Kühlbrandt W, Davies KM (leden 2016). „Rotary ATPases: New Twist to an Ancient Machine“. Trendy v biochemických vědách. 41 (1): 106–116. doi:10.1016 / j.tibs.2015.10.006. PMID  26671611.
  2. ^ Muller V, Cross RL (2004). „Vývoj A-, F- a V-typu ATP syntáz a ATPáz: obrácení funkce a změny v H + / ATP vazebném poměru“. FEBS Lett. 576 (1): 1–4. doi:10.1016 / j.febslet.2004.08.065. PMID  15473999. S2CID  25800744.
  3. ^ Zhang X, Niwa H, Rappas M (2004). „Mechanismy ATPáz - multidisciplinární přístup“. Curr Protein Pept Sci. 5 (2): 89–105. doi:10.2174/1389203043486874. PMID  15078220.
  4. ^ Itoh H, Yoshida M, Yasuda R, Noji H, Kinosita K (2001). "Rozlišení odlišných rotačních dílčích kroků kinetickou analýzou F1-ATPázy v submilisekundách". Příroda. 410 (6831): 898–904. Bibcode:2001 Natur.410..898Y. doi:10.1038/35073513. PMID  11309608. S2CID  3274681.
  5. ^ Wilkens S, Zheng Y, Zhang Z (2005). "Strukturní model vakuolární ATPázy z transmisní elektronové mikroskopie". Mikron. 36 (2): 109–126. doi:10.1016 / j.micron.2004.10.002. PMID  15629643.
  6. ^ Fillingame RH, Angevine CM, Dmitriev OY (2003). "Mechanika spojování pohybů protonů s rotací c-kroužku v ATP syntáze". FEBS Lett. 555 (1): 29–34. doi:10.1016 / S0014-5793 (03) 01101-3. PMID  14630314. S2CID  38896804.
  7. ^ Inoue T, Forgac M (2005). „Zesíťování zprostředkované cysteinem naznačuje, že podjednotka C V-ATPázy je v těsné blízkosti podjednotek E a G domény V1 a podjednotky a domény V0“. J. Biol. Chem. 280 (30): 27896–27903. doi:10,1074 / jbc.M504890200. PMID  15951435.
  8. ^ Jones R, Findlay JB, Harrison M, Durose L, Song CF, Barratt E, Trinick J (2003). "Struktura a funkce vakuolární H + -ATPázy: přechod od modelů s nízkým rozlišením ke strukturám s vysokým rozlišením". J. Bioenerg. Biomembr. 35 (4): 337–345. doi:10.1023 / A: 1025728915565. PMID  14635779. S2CID  43788207.
  9. ^ Bonora, M; Bononi, A; De Marchi, E; Giorgi, C; Lebiedzinska, M; Marchi, S; Patergnani, S; Rimessi, A; Suski, JM; Wojtala, A; Wieckowski, MR; Kroemer, G; Galluzzi, L; Pinton, P (15. února 2013). "Role c podjednotky FO ATP syntázy v přechodu mitochondriální permeability". Buněčný cyklus. 12 (4): 674–83. doi:10,4161 / cc.23599. PMC  3594268. PMID  23343770.
Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR000454