ATP-dependentní Clp proteázový adaptační protein ClpS - ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS
| ClpS | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 clpns s fragmenty | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | ClpS | ||||||||
| Pfam | PF02617 | ||||||||
| InterPro | IPR003769 | ||||||||
| SCOP2 | 1mbx / Rozsah / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
ClpS je N-rozpoznáván v dráze pravidla N-end.[1] ClpS interaguje s proteinovými substráty, které mají na N-konci objemný hydrofobní zbytek (leucin, fenylalanin, tyrosin a tryptofan). Proteinový substrát je poté degradován proteázou ClpAP.[2][3]
V molekulární biologii se ATP-dependentní Clp proteázový adaptační protein ClpS je bakteriální protein. V bakteriální cytosol, ATP -závislý degradace bílkovin provádí několik různých garde -proteáza páry, včetně ClpAP. ClpS přímo ovlivňuje stroj ClpAP vazba do N-terminál doména z garde ClpA. Degradace substrátů ClpAP, oba označené SsrA bílkoviny a samotný ClpA je specificky inhibován ClpS. ClpS upravuje ClpA Podklad specificita, potenciálně přesměrující degradaci ClpAP na agregovanou bílkoviny.[4]
ClpS je malý alfa / beta protein, který se skládá ze tří alfa-šroubovice připojen ke třem antiparalelní beta-prameny.[5] Protein má kulovitý tvar se zakřivenou vrstvou tří antiparalelních alfa-šroubovice přes zkroucenou antiparalelní beta-list. Dimerizace ClpS může nastat přes jeho N-koncovou doménu. Za touto krátkou prodlouženou N-koncovou oblastí v ClpS následuje centrální sedmi-zbytkový beta-řetězec, který je v malém beta-listu lemován dvěma dalšími beta-řetězci.
Viz také
Reference
- ^ Varshavsky A (srpen 2011). „Cesta pravidla N-end a regulace proteolýzou“. Věda o bílkovinách. 20 (8): 1298–345. doi:10,1002 / pro.666. PMC 3189519. PMID 21633985.
- ^ Tasaki T, Sriram SM, Park KS, Kwon YT (10. dubna 2012). „Cesta pravidla N-end“. Roční přehled biochemie. 81: 261–89. doi:10,1146 / annurev-biochem-051710-093308. PMC 3610525. PMID 22524314.
- ^ Erbse A, Schmidt R, Bornemann T, Schneider-Mergener J, Mogk A, Zahn R a kol. (Únor 2006). „ClpS je základní součástí dráhy pravidel N-end v Escherichia coli“. Příroda. 439 (7077): 753–6. Bibcode:2006 Natur.439..753E. doi:10.1038 / nature04412. PMID 16467841. S2CID 4406838.
- ^ Dougan DA, Reid BG, Horwich AL, Bukau B (březen 2002). „ClpS, substrátový modulátor stroje ClpAP“. Molekulární buňka. 9 (3): 673–83. doi:10.1016 / S1097-2765 (02) 00485-9. PMID 11931773.
- ^ Zeth K, Ravelli RB, Paal K, Cusack S, Bukau B, Dougan DA (prosinec 2002). "Strukturní analýza adaptorového proteinu ClpS v komplexu s N-koncovou doménou ClpA". Přírodní strukturní biologie. 9 (12): 906–11. doi:10.1038 / nsb869. PMID 12426582. S2CID 28459237.