ARGLU1 - ARGLU1

ARGLU1
Identifikátory
Aliasy	ARGLU1, bohaté na arginin a glutamát 1
Externí ID	OMIM: 614046 MGI: 2442985 HomoloGene: 9960 Genové karty: ARGLU1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 13 (lidský)
Konec	106,568,137 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	8,690,521 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • kadherinová vazba;
Buněčná složka	• mitochondrie; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	55082
	234023
	ENSG00000134884
	ENSMUSG00000040459
	Q9NWB6
	Q3UL36
	NM_018011
	NM_176849
	NP_060481
	NP_789819
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Proteiny bohaté na arginin a glutamát 1 je protein že u lidí je kódován ARGLU1 gen nachází se na 13q33.3.^[5]

Proteinový produkt tohoto genu byl navržen jako a MED1 -interaktivní protein potřebný pro estrogen -závislý genová transkripce a rakovina prsu růst buněk.^[6]

Gen ARGLU1 exprimuje alespoň tři odlišné izoformy RNA sestřihu - plně sestřiženou izoformu kódující protein, izoformu obsahující zadržený intron, který je zadržen v jádru, a izoformu obsahující alternativní exon, který cílí na transkript pro nesmysl zprostředkovaný rozpad. ARGLU1 dále obsahuje dlouhou, vysoce evolučně konzervovanou sekvenci známou jako Ultrakonzervovaný prvek (UCE) to je uvnitř zadrženého intronu a překrývá alternativní exon. ^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000134884 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040459 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: ARGLU1 bohatý na arginin a glutamát 1“.
^ Zhang D, Jiang P, Xu Q, Zhang X (květen 2011). „Arginin a glutamát bohatý 1 (ARGLU1) interaguje s mediátorovou podjednotkou 1 (MED1) a je nezbytný pro transkripci genů zprostředkovanou estrogenovým receptorem a růst buněk rakoviny prsu“. J. Biol. Chem. 286 (20): 17746–54. doi:10.1074 / jbc.M110.206029. PMC 3093850. PMID 21454576.
^ Pirnie SP, Osman A, Zhu Y, Carmichael GG (duben 2017). „Prvek Ultraconserved Element (UCE) řídí homeostatické sestřih mRNA ARGLU1“. Nucleic Acids Res. 45 (6): 3473–3486. doi:10.1093 / nar / gkw1140. PMC 5389617. PMID 27899669.

externí odkazy

Člověk ARGLU1 umístění genomu a ARGLU1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000134884 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040459 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: ARGLU1 bohatý na arginin a glutamát 1“.

[pmid21454576-6] Zhang D, Jiang P, Xu Q, Zhang X (květen 2011). „Arginin a glutamát bohatý 1 (ARGLU1) interaguje s mediátorovou podjednotkou 1 (MED1) a je nezbytný pro transkripci genů zprostředkovanou estrogenovým receptorem a růst buněk rakoviny prsu“. J. Biol. Chem. 286 (20): 17746–54. doi:10.1074 / jbc.M110.206029. PMC 3093850. PMID 21454576.

[pmid27899669-7] Pirnie SP, Osman A, Zhu Y, Carmichael GG (duben 2017). „Prvek Ultraconserved Element (UCE) řídí homeostatické sestřih mRNA ARGLU1“. Nucleic Acids Res. 45 (6): 3473–3486. doi:10.1093 / nar / gkw1140. PMC 5389617. PMID 27899669.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]