ARFGEF2 - ARFGEF2

ARFGEF2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3L8N, 3SWV
Identifikátory
Aliasy	ARFGEF2, BIG2, PVNH2, dJ1164I10.1, ADP ribosylační faktor guanin nukleotidový výměnný faktor 2
Externí ID	OMIM: 605371 MGI: 2139354 HomoloGene: 111880 Genové karty: ARFGEF2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	49,036,693 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	166,898,052 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita faktoru výměny guanyl-nukleotidů; • Vazba na receptor GABA; • Aktivita výměnného faktoru ARF guanyl-nukleotid; • vazba myosinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba regulační podjednotky proteinkinázy A.;
Buněčná složka	• cytoplazma; • recyklace endosomu; • cytosol; • endozom; • Golgiho aparát; • buněčná projekce; • membrána; • Golgiho membrána; • dendritická páteř; • synapse; • organizační centrum mikrotubulů; • buněčné spojení; • trans-Golgiho síť; • dendrit; • symetrická synapse; • asymetrická synapse; • perinukleární oblast cytoplazmy; • cytoskelet; • cytoplazmatický váček; • axonemální mikrotubul;
Biologický proces	• organizace endomembránového systému; • GO: 0007243 transdukce intracelulárního signálu; • regulace přenosu signálu proteinu ARF; • organizace endosomu; • recyklace receptorů; • pozitivní regulace produkce faktoru nekrózy nádorů; • transport bílkovin; • Transport Golgiho plazmatickou membránou; • exocytóza; • doprava; • regulace molekulární funkce; • transport zprostředkovaný vezikuly;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10564
	99371
	ENSG00000124198
	ENSMUSG00000074582
	Q9Y6D5
	A2A5R2
	NM_006420
	NM_001085495
	NP_006411
	NP_001078964
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Brefeldin A-inhibovaný guaninový nukleotidový výměnný protein 2 je protein že u lidí je kódován ARFGEF2 gen.^[5]^[6]

Funkce

Faktory ADP-ribosylace (ARF) hrají důležitou roli při intracelulárním vezikulárním obchodování. Protein kódovaný tímto genem se podílí na aktivaci ARF urychlením nahrazení vázaného GDP GTP a podílí se na Golgi doprava. Obsahuje doménu Sec7, která může být zodpovědná za svou aktivitu výměny guanin-nukleotidy a také za inhibici brefeldinu A.^[6]

Interakce

ARFGEF2 bylo prokázáno komunikovat s ARFGEF1,^[7] PRKAR1A^[8] a PRKAR2A.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124198 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000074582 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Togawa A, Morinaga N, Ogasawara M, Moss J, Vaughan M (duben 1999). "Čištění a klonování brefeldin A-inhibovaného guaninového nukleotidového výměnného proteinu pro ADP-ribosylační faktory". The Journal of Biological Chemistry. 274 (18): 12308–15. doi:10.1074 / jbc.274.18.12308. PMID 10212200.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ARFGEF2 ADP-ribosylační faktor guaninový nukleotidový výměnný faktor 2 (brefeldin A-inhibovaný)“.
^ Yamaji R, Adamik R, Takeda K, Togawa A, Pacheco-Rodriguez G, Ferrans VJ, Moss J, Vaughan M (březen 2000). "Identifikace a lokalizace dvou brefeldinem A inhibovaných guaninových nukleotidových výměnných proteinů pro ADP-ribosylační faktory v makromolekulárním komplexu". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (6): 2567–72. doi:10.1073 / pnas.97.6.2567. PMC 15969. PMID 10716990.
^ ^A ^b Li H, Adamik R, Pacheco-Rodriguez G, Moss J, Vaughan M (únor 2003). „Domény kotvící bílkoviny A (AKAP) v proteinu 2 pro výměnu guaninových nukleotidů (BIG2) s inhibicí brefeldinu A“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (4): 1627–32. doi:10.1073 / pnas.0337678100. PMC 149883. PMID 12571360.

externí odkazy

Člověk ARFGEF2 umístění genomu a ARFGEF2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Yamaji R, Adamik R, Takeda K, Togawa A, Pacheco-Rodriguez G, Ferrans VJ, Moss J, Vaughan M (březen 2000). "Identifikace a lokalizace dvou brefeldinem A inhibovaných guaninových nukleotidových výměnných proteinů pro ADP-ribosylační faktory v makromolekulárním komplexu". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (6): 2567–72. doi:10.1073 / pnas.97.6.2567. PMC 15969. PMID 10716990.
Kamei Y, Takeda Y, Teramoto K, Tsutsumi O, Taketani Y, Watanabe K (říjen 2000). „Lidský NB-2 molekul podskupiny kontaktinu: chromozomální lokalizace genu (CNTN5) a odlišný vzor exprese od ostatních členů podskupiny“. Genomika. 69 (1): 113–9. doi:10.1006 / geno.2000.6310. PMID 11013081.
Pacheco-Rodriguez G, Moss J, Vaughan M (2002). „BIG1 a BIG2: brefeldin A-inhiboval guaninové nukleotidové výměnné proteiny pro ADP-ribosylační faktory“. Metody v enzymologii. 345: 397–404. doi:10.1016 / S0076-6879 (02) 45032-X. ISBN 9780121822460. PMID 11665623.
Shinotsuka C, Yoshida Y, Kawamoto K, Takatsu H, Nakayama K (březen 2002). „Nadexprese ADP-ribosylačního faktoru-guaninového nukleotidového výměnného faktoru, BIG2, odpojí disociaci povlaku adaptorového proteinu-1 indukovanou brefeldinem A a membránovou tubulaci“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (11): 9468–73. doi:10,1074 / jbc.M112427200. PMID 11777925.
Shinotsuka C, Waguri S, Wakasugi M, Uchiyama Y, Nakayama K (červen 2002). „Dominantně negativní mutant BIG2, ARF-guaninový nukleotidový výměnný faktor, specificky ovlivňuje přenos membrány ze sítě trans-Golgi prostřednictvím inhibice membránové asociace AP-1 a GGA obalových proteinů“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 294 (2): 254–60. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 00456-4. PMID 12051703.
Li H, Adamik R, Pacheco-Rodriguez G, Moss J, Vaughan M (únor 2003). „Domény kotvící bílkoviny A (AKAP) v proteinu 2 pro výměnu guaninových nukleotidů (BIG2) s inhibicí brefeldinu A“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (4): 1627–32. doi:10.1073 / pnas.0337678100. PMC 149883. PMID 12571360.
Sheen VL, Ganesh VS, Topcu M, Sebire G, Bodell A, Hill RS, Grant PE, Shugart YY, Imitola J, Khoury SJ, Guerrini R, Walsh CA (leden 2004). „Mutace v ARFGEF2 implikují obchodování vezikul v šíření a migraci nervových progenitorů v lidské mozkové kůře“. Genetika přírody. 36 (1): 69–76. doi:10.1038 / ng1276. PMID 14647276.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (červenec 2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Výzkum genomu. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (srpen 2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Xu KF, Shen X, Li H, Pacheco-Rodriguez G, Moss J, Vaughan M (únor 2005). „Interakce BIG2, proteinu pro výměnu guaninových nukleotidů s inhibicí brefeldinu A, s proteinem exocyst Exo70“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 102 (8): 2784–9. doi:10.1073 / pnas.0409871102. PMC 549493. PMID 15705715.
Lu J, Tiao G, Folkerth R, Hecht J, Walsh C, Sheen V (leden 2006). „Překrývající se exprese ARFGEF2 a filaminu A v neuroependymální výstelce postranních komor: pohled na příčinu periventrikulární heterotopie“. The Journal of Comparative Neurology. 494 (3): 476–84. doi:10.1002 / kně.20806. PMID 16320251. S2CID 16527134.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Islam A, Shen X, Hiroi T, Moss J, Vaughan M, Levine SJ (březen 2007). „Brefeldin A-inhibovaný guaninový nukleotidový výměnný protein, BIG2, reguluje konstitutivní uvolňování TNFR1 exosomových vezikul“. The Journal of Biological Chemistry. 282 (13): 9591–9. doi:10,1074 / jbc.M607122200. PMID 17276987.
Kuroda F, Moss J, Vaughan M (únor 2007). „Regulace aktivity proteinu 1 (BIG1) a BIG2-inhibovaného guaninovým nukleotidovým výměníkem prostřednictvím PKA a proteinové fosfatázy 1gamma“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 104 (9): 3201–6. doi:10.1073 / pnas.0611696104. PMC 1805514. PMID 17360629.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124198 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000074582 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10212200-5] Togawa A, Morinaga N, Ogasawara M, Moss J, Vaughan M (duben 1999). "Čištění a klonování brefeldin A-inhibovaného guaninového nukleotidového výměnného proteinu pro ADP-ribosylační faktory". The Journal of Biological Chemistry. 274 (18): 12308–15. doi:10.1074 / jbc.274.18.12308. PMID 10212200.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: ARFGEF2 ADP-ribosylační faktor guaninový nukleotidový výměnný faktor 2 (brefeldin A-inhibovaný)“.

[pmid10716990-7] Yamaji R, Adamik R, Takeda K, Togawa A, Pacheco-Rodriguez G, Ferrans VJ, Moss J, Vaughan M (březen 2000). "Identifikace a lokalizace dvou brefeldinem A inhibovaných guaninových nukleotidových výměnných proteinů pro ADP-ribosylační faktory v makromolekulárním komplexu". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (6): 2567–72. doi:10.1073 / pnas.97.6.2567. PMC 15969. PMID 10716990.

[pmid12571360-8] A ^b Li H, Adamik R, Pacheco-Rodriguez G, Moss J, Vaughan M (únor 2003). „Domény kotvící bílkoviny A (AKAP) v proteinu 2 pro výměnu guaninových nukleotidů (BIG2) s inhibicí brefeldinu A“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 100 (4): 1627–32. doi:10.1073 / pnas.0337678100. PMC 149883. PMID 12571360.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]