AIM2 - AIM2

AIM2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3RN2, 3RN5, 3VD8, 4O7Q
Identifikátory
Aliasy	AIM2, PYHIN4, nepřítomný v melanomu 2
Externí ID	OMIM: 604578 MGI: 2686159 HomoloGene: 83226 Genové karty: AIM2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	159,147,096 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	173,466,040 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • dvouřetězcová vazba DNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Komplex inflammasomu AIM2; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • mitochondrie; • cytosol;
Biologický proces	• pozitivní regulace aktivity endopeptidázy cysteinového typu; • pyroptóza; • buněčná odpověď na interferon-beta; • proces imunitního systému; • signální dráha zprostředkovaná faktorem nekrózy nádorů; • buněčná odpověď na lék; • pozitivní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • imunitní odpověď; • pozitivní regulace produkce interleukinu-1 beta; • pozitivní regulace oligomerizace proteinů; • aktivace vrozené imunitní odpovědi; • zánětlivá reakce; • negativní regulace aktivity transkripčního faktoru NF-kappaB; • pozitivní regulace obranné reakce na virus hostitelem; • apoptotický proces; • vrozený imunitní systém;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9447
	383619
	ENSG00000163568
	ENSMUSG00000037860
	O14862
	Q91VJ1
	NM_004833; NM_001348247
	NM_001013779
	NP_004824; NP_001335176
	NP_001013801
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Interferonem indukovatelný protein AIM2 také známý jako chybí u melanomu 2 nebo jednoduše AIM2 je protein že u lidí je kódován AIM2 gen.^[5]^[6] Nedávný výzkum ukázal, že AIM2 je součástí inflammasome a přispívá k obraně proti bakteriálním a virovým DNA.^[7]

Struktura

AIM2 je protein o 343 aminokyselinách s a N-terminál DAPIN (nebo pyrin ) doména (aminokyseliny 1-87) a a C-terminál Doména HIN-200 (aminokyseliny 138-337), o které je známo, že má dva záhyby vázající oligonukleotidy.^[8]

Funkce

AIM2 je členem Ifi202 /IFI16 rodina. Hraje domnělou roli při tumorigenní reverzi a může kontrolovat proliferace buněk. Interferon-gama indukuje expresi AIM2.^[6]

Ačkoli zde nebyla provedena prakticky žádná biochemie, model založený na experimentech na bázi buněk nebo in vivo vedl k aktuálnímu modelu, jak AIM2 spouští inflammasom. C-koncová HIN doména váže dvouvláknové DNA (virový, bakteriální nebo dokonce hostitelský) a působí jako cytosolický dsDNA senzor. To vede k oligomerizaci komplexu inflammasomu. N-koncová pyrinová doména AIM2 interaguje s pyrinovou doménou jiného proteinu ASC (nebo protein podobný Speck podobný Apcktosis obsahující doménu aktivace a náboru kaspázy). ASC také obsahuje a CARD doména (doména aktivace a náboru kaspázy), která rekrutuje prokaspázu-1 do komplexu. To vede k autoaktivaci kaspáza-1, enzym, který zpracovává prozánětlivé látky cytokiny (IL-1b a IL-18 ).^[7]Inflammasom AIM2 je aktivován farmakologickým narušením integrity jaderného obalu.^[9]

Klinický význam

Zvýšené hladiny exprese AIM2 se nacházejí v kožních buňkách od lidí s psoriáza.^[10] v systémový lupus erythematodes lysozomová dysfunkce umožňuje DNA získat přístup k cytosolu a aktivovat AIM2, což vede ke zvýšené produkci interferonu typu 1.^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163568 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037860 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ DeYoung KL, Ray ME, Su YA, Anzick SL, Johnstone RW, Trapani JA, Meltzer PS, Trent JM (srpen 1997). „Klonování nového člena rodiny genů indukovatelných lidským interferonem spojené s kontrolou tumorigenicity v modelu lidského melanomu“. Onkogen. 15 (4): 453–7. doi:10.1038 / sj.onc.1201206. PMID 9242382.
^ ^A ^b „Entrez Gene: AIM2 chybí u melanomu 2“.
^ ^A ^b Schroder K, Tschopp J (březen 2010). "Inflammasomy". Buňka. 140 (6): 821–32. doi:10.1016 / j.cell.2010.01.040. PMID 20303873.
^ Fernandes-Alnemri T, Yu JW, Datta P, Wu J, Alnemri ES (březen 2009). „AIM2 aktivuje inflammasom a buněčnou smrt v reakci na cytoplazmatickou DNA“. Příroda. 458 (7237): 509–13. doi:10.1038 / nature07710. PMC 2862225. PMID 19158676.
^ Di Micco A, Frera G, Lugrin J, Jamilloux Y, Hsu ET, Tardivel A, De Gassart A, Zaffalon L, Bujisic B, Siegert S, Quadroni M, Broz P, Henry T, Hrycyna CA, Martinon F (srpen 2016) . „Inflammasom AIM2 je aktivován farmakologickým narušením integrity jaderného obalu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 113 (32): E4671-80. doi:10.1073 / pnas.1602419113. PMC 4987819. PMID 27462105.
^ Dombrowski Y, Peric M, Koglin S, Kammerbauer C, Göss C, Anz D, Simanski M, Gläser R, Harder J, Hornung V, Gallo RL, Ruzicka T, Besch R, Schauber J (květen 2011). „Cytosolická DNA spouští aktivaci inflammasomu v keratinocytech u psoriatických lézí“. Science Translational Medicine. 3 (82): 82ra38. doi:10.1126 / scitranslmed.32002001. PMC 3235683. PMID 21562230.
^ Monteith AJ, Kang S, Scott E, Hillman K, Rajfur Z, Jacobson K, Costello MJ, Vilen BJ (duben 2016). „Vady lysozomálního zrání usnadňují aktivaci vrozených senzorů u systémového lupus erythematodes“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 113 (15): E2142-51. doi:10.1073 / pnas.1513943113. PMC 4839468. PMID 27035940.

externí odkazy

Člověk AIM2 umístění genomu a AIM2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Landolfo S, Gariglio M, Gribaudo G, Lembo D (1999). „Geny Ifi 200: objevující se rodina IFN-indukovatelných genů“. Biochimie. 80 (8–9): 721–8. doi:10.1016 / S0300-9084 (99) 80025-X. PMID 9865494.
Woerner SM, Kloor M, Schwitalle Y, Youmans H, von Knebel Doeberitz M, Gebert J, Dihlmann S (2007). „Předpokládaný nádorový supresor AIM2 je často ovlivňován různými genetickými změnami v mikrosatelitních nestabilních rakovinách tlustého střeva“. Geny Chromozomy Rakovina. 46 (12): 1080–9. doi:10,1002 / gcc.20493. PMID 17726700.
Chen IF, Ou-Yang F, Hung JY, Liu JC, Wang H, Wang SC, Hou MF, Hortobagyi GN, Hung MC (2006). „AIM2 potlačuje proliferaci lidských buněk rakoviny prsu in vitro a růst nádorů prsu u myšího modelu“. Mol. Cancer Ther. 5 (1): 1–7. doi:10.1158 / 1535-7163.MCT-05-0310. PMID 16432157.
Cresswell KS, Clarke CJ, Jackson JT, Darcy PK, Trapani JA, Johnstone RW (2005). „Biochemické a růstové regulační aktivity člena rodiny HIN-200 a domnělého tumor supresorového proteinu, AIM2“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 326 (2): 417–24. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.11.048. PMID 15582594.
Liu G, Yu JS, Zeng G, Yin D, Xie D, Black KL, Ying H (2004). „AIM-2: nový nádorový antigen je exprimován a prezentován lidskými gliomovými buňkami“. J. Immunother. 27 (3): 220–6. doi:10.1097/00002371-200405000-00006. PMID 15076139.
Choubey D, Walter S, Geng Y, Xin H (2000). „Cytoplazmatická lokalizace interferonem indukovatelného proteinu, který je kódován genem AIM2 (chybí v melanomu) z rodiny 200 genů“. FEBS Lett. 474 (1): 38–42. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01571-4. PMID 10828447.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163568 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037860 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9242382-5] DeYoung KL, Ray ME, Su YA, Anzick SL, Johnstone RW, Trapani JA, Meltzer PS, Trent JM (srpen 1997). „Klonování nového člena rodiny genů indukovatelných lidským interferonem spojené s kontrolou tumorigenicity v modelu lidského melanomu“. Onkogen. 15 (4): 453–7. doi:10.1038 / sj.onc.1201206. PMID 9242382.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: AIM2 chybí u melanomu 2“.

[pmid20303873-7] A ^b Schroder K, Tschopp J (březen 2010). "Inflammasomy". Buňka. 140 (6): 821–32. doi:10.1016 / j.cell.2010.01.040. PMID 20303873.

[pmid19158676-8] Fernandes-Alnemri T, Yu JW, Datta P, Wu J, Alnemri ES (březen 2009). „AIM2 aktivuje inflammasom a buněčnou smrt v reakci na cytoplazmatickou DNA“. Příroda. 458 (7237): 509–13. doi:10.1038 / nature07710. PMC 2862225. PMID 19158676.

[9] Di Micco A, Frera G, Lugrin J, Jamilloux Y, Hsu ET, Tardivel A, De Gassart A, Zaffalon L, Bujisic B, Siegert S, Quadroni M, Broz P, Henry T, Hrycyna CA, Martinon F (srpen 2016) . „Inflammasom AIM2 je aktivován farmakologickým narušením integrity jaderného obalu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 113 (32): E4671-80. doi:10.1073 / pnas.1602419113. PMC 4987819. PMID 27462105.

[pmid21562230-10] Dombrowski Y, Peric M, Koglin S, Kammerbauer C, Göss C, Anz D, Simanski M, Gläser R, Harder J, Hornung V, Gallo RL, Ruzicka T, Besch R, Schauber J (květen 2011). „Cytosolická DNA spouští aktivaci inflammasomu v keratinocytech u psoriatických lézí“. Science Translational Medicine. 3 (82): 82ra38. doi:10.1126 / scitranslmed.32002001. PMC 3235683. PMID 21562230.

[11] Monteith AJ, Kang S, Scott E, Hillman K, Rajfur Z, Jacobson K, Costello MJ, Vilen BJ (duben 2016). „Vady lysozomálního zrání usnadňují aktivaci vrozených senzorů u systémového lupus erythematodes“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 113 (15): E2142-51. doi:10.1073 / pnas.1513943113. PMC 4839468. PMID 27035940.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]