Zobellia galactanivorans - Zobellia galactanivorans
| Zobellia galactanivorans | |
|---|---|
Vědecká klasifikace  | |
| Doména: | Bakterie |
| Kmen: | Bacteroidetes |
| Třída: | Flavobakterie |
| Objednat: | Flavobacteriales |
| Rodina: | Flavobacteriaceae |
| Rod: | Zobellia |
| Druh: | Z. galactanivorans |
| Binomické jméno | |
| Zobellia galactanivorans Barbeyron a kol., 2001 | |
Zobellia galactanivorans je gramnegativní mořská bakterie izolován od povrchu červené řasy pobřeží Francie. Z. galactanivorans tvoří žluté kolonie s a bacil nebo diplobacillus morfologie. Kromě toho je mezofilní a může se zhoršovat karageny a agary - oba se nacházejí v buněčné stěně červených řas.[1] Z. galactanivorans obsahuje gen porB, který kóduje enzym β-porfyranáza-B.[2]
Funkce β-porfyranázy-B
β-porfyranáza-B je a katalytický enzym že hydrolyzuje the β-D-galaktopyranóza (1→4) α-L-galaktopyranóza-6-sulfát propojit porfyr.[3]
Srovnání β-porfyranázy-B a β-porfyranázy-A
K dispozici je 35% sekvenční podobnost mezi β-porfyranázou-B a β-porfyranáza-A. [3] Dále ortology mezi Z. galactanivorans a Bacteroides plebeius-1698, kmen Bacteroides plebeius, obsahují podobnost sekvence 48% - 69%.[3] Homologní geny mezi ostatními Bacteroides druhy mají pouze 30% podobnost sekvence.[3] Navíc, porfyranáza geny v obou Z. galactanivorans a B. plebeius jsou umístěny v podobných objednávkách podél jejich chromozóm, nebo jsou syntenický.
Reference
- ^ Barbeyron T, L'Haridon S, Corre E, Kloareg B, Potin P (květen 2001). „Zobellia galactanovorans gen. Nov., Sp. Nov., Mořský druh Flavobacteriaceae izolovaný z červené řasy a klasifikace [Cytophaga] uliginosa (ZoBell a Upham 1944) Reichenbach 1989 jako Zobellia uliginosa gen. nov., hřeben. listopad". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 51 (Pt 3): 985–97. doi:10.1099/00207713-51-3-985. PMID 11411725.
- ^ Hehemann JH, Correc G, Thomas F, Bernard T, Barbeyron T, Jam M, Helbert W, Michel G, Czjzek M (srpen 2012). „Biochemická a strukturní charakterizace komplexního systému agarolytických enzymů z mořské bakterie Zobellia galactanivorans". The Journal of Biological Chemistry. 287 (36): 30571–84. doi:10.1074 / jbc.M112.377184. PMC 3436304. PMID 22778272.
- ^ A b C d Hehemann JH, Correc G, Barbeyron T, Helbert W, Czjzek M, Michel G (duben 2010). „Přenos enzymů aktivních ze sacharidů z mořských bakterií na japonskou střevní mikroflóru“. Příroda. 464 (7290): 908–12. Bibcode:2010Natur.464..908H. doi:10.1038 / nature08937. PMID 20376150.