ZCCHC6 - ZCCHC6

TUT7
Identifikátory
Aliasy	TUT7, PAPD6, zinkový prst typu CCHC obsahující 6, TENT3B, ZCCHC6, terminální uridylyl transferáza 7
Externí ID	OMIM: 613467 MGI: 2387179 HomoloGene: 51941 Genové karty: TUT7
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	86,354,454 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	59,823,147 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • aktivita nukleotidyltransferázy; • vazba iontů zinku; • vazba kovových iontů; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA; • Aktivita RNA uridylyltransferázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • miRNA vazba; • aktivita uridylyltransferázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • nukleoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• histonová mRNA katabolický proces; • Zpracování RNA na 3'-konci; • zkrácení ocasu nukleární transkribované mRNA poly (A); • zrání oocytů; • negativní regulace transpozice, zprostředkovaná RNA; • metabolický proces miRNA; • zpracování pre-miRNA; • RNA 3 'uridylace; • katabolický proces mRNA závislý na polyuridylaci;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	79670
	214290
	ENSG00000083223
	ENSMUSG00000035248
	Q5VYS8
	Q5BLK4
	NM_001185059; NM_001185074; NM_024617; NM_001330718
	NM_153538; NM_001373962; NM_001373963; NM_001373964
	NP_001171988; NP_001172003; NP_001317647; NP_078893
	NP_705766; NP_001360891; NP_001360892; NP_001360893
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Terminální uridylyltransferáza 7 (TUT7), také známý jako „zinkový prst, doména CCHC obsahující 6“, je enzym že u lidí je kódován ZCCHC6 gen umístěný na chromozóm 9.^[5]^[6] ZCCHC6 protein zprostředkovává terminál uridylace z RNA přepisy s krátkým poly-A ocasy a podílí se na degradaci mRNA a mikroRNA

Struktura

Gen ZCCHC6 obsahuje 33 exony s nejméně šesti známými izoformami kvůli alternativní sestřih. Gen ZCCHC6 kóduje a protein to je 171 kDa v molekulární váha a je lokalizován v cytoplazmě.

Funkce

Katalyzuje následující reakci, vyžaduje Mg2 + a Mn2 + jako kofaktory.

UTP + RNA (n) = difosfát + RNA (n + 1) ^[7]

Uridylace katalyzovaný ZCCHC6 probíhá snadno dál mrtvý izolovaný mRNA uvnitř buněk.^[8] Purifikovaný ZZHC6 selektivně rozpoznává a uridyláuje molekuly RNA mající krátké poly (A) ocasy (méně než 25 nukleotidů) in vitro. V buňkách zbavených ZCCHC6 ztrácí většina mRNA signální oligo (U) ocasy, které jsou charakteristické pro reaktivitu ZCCHC6, a poločas molekul mRNA se odpovídajícím způsobem prodlužuje.^[8]

Kromě degradace mRNA se předpokládá, že uridylace funguje takémikroRNA maturace, přičemž některá pre-mikroRNA skupiny II vyžaduje 3 'mono-uridylaci pro Hráč v kostky zpracovává se.^[9] Předpokládá se, že ZCCHC6 pracuje v redundanci se ZCCHC11 pro zprostředkování biogeneze let-7 mikroRNA prostřednictvím uridylace.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000083223 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035248 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nagase T, Kikuno R, Hattori A, Kondo Y, Okumura K, Ohara O (prosinec 2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 7 (6): 347–55. doi:10.1093 / dnares / 7.6.347. PMID 11214970.
^ „Entrez Gene: ZCCHC6 zinkový prst, doména CCHC obsahující 6“.
^ Rissland OS, Mikulášova A, Norbury CJ (2007). „Efektivní RNA polyuridylace nekanonickými poly (A) polymerázami“. Mol. Buňka. Biol. 27 (10): 3612–24. doi:10.1128 / MCB.02209-06. PMC 1899984. PMID 17353264.
^ ^A ^b Lim J, Ha M, Chang H, Kwon SC, Simanshu DK, Patel DJ, Kim VN (2014). „Uridylace pomocí TUT4 a TUT7 označuje degradaci mRNA“. Buňka. 159 (6): 1365–76. doi:10.1016 / j.cell.2014.10.055. PMC 4720960. PMID 25480299.
^ Heo I, Ha M, Lim J, Yoon MJ, Park JE, Kwon SC, Chang H, Kim VN (2012). „Mono-uridylace pre-mikroRNA jako klíčový krok v biogenezi mikroRNA skupiny II let-7“. Buňka. 151 (3): 521–32. doi:10.1016 / j.cell.2012.09.022. PMID 23063654.
^ Thornton JE, Chang HM, Piskounova E, Gregory RI (2012). „Řízení exprese letR7 mikroRNA zprostředkované Lin28 alternativními TUTázami Zcchc11 (TUT4) a Zcchc6 (TUT7)“. RNA. 18 (10): 1875–85. doi:10.1261 / rna.034538.112. PMC 3446710. PMID 22898984.

Další čtení

Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (říjen 2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Výzkum genomu. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (leden 2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000083223 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035248 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11214970-5] Nagase T, Kikuno R, Hattori A, Kondo Y, Okumura K, Ohara O (prosinec 2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. Výzkum DNA. 7 (6): 347–55. doi:10.1093 / dnares / 7.6.347. PMID 11214970.

[entrez-6] „Entrez Gene: ZCCHC6 zinkový prst, doména CCHC obsahující 6“.

[7] Rissland OS, Mikulášova A, Norbury CJ (2007). „Efektivní RNA polyuridylace nekanonickými poly (A) polymerázami“. Mol. Buňka. Biol. 27 (10): 3612–24. doi:10.1128 / MCB.02209-06. PMC 1899984. PMID 17353264.

[Lim-2014-8] A ^b Lim J, Ha M, Chang H, Kwon SC, Simanshu DK, Patel DJ, Kim VN (2014). „Uridylace pomocí TUT4 a TUT7 označuje degradaci mRNA“. Buňka. 159 (6): 1365–76. doi:10.1016 / j.cell.2014.10.055. PMC 4720960. PMID 25480299.

[9] Heo I, Ha M, Lim J, Yoon MJ, Park JE, Kwon SC, Chang H, Kim VN (2012). „Mono-uridylace pre-mikroRNA jako klíčový krok v biogenezi mikroRNA skupiny II let-7“. Buňka. 151 (3): 521–32. doi:10.1016 / j.cell.2012.09.022. PMID 23063654.

[10] Thornton JE, Chang HM, Piskounova E, Gregory RI (2012). „Řízení exprese letR7 mikroRNA zprostředkované Lin28 alternativními TUTázami Zcchc11 (TUT4) a Zcchc6 (TUT7)“. RNA. 18 (10): 1875–85. doi:10.1261 / rna.034538.112. PMC 3446710. PMID 22898984.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]