YARS - YARS
Tyrosyl-tRNA syntetáza, cytoplazmatická, také známý jako Tyrosin-tRNA ligáza, je enzym že u lidí je kódován YARS gen.[4][5][6]
Živé buňky překládají sekvence DNA na sekvence RNA a poté na proteinové sekvence. Proteiny jsou řetězce aminokyselin, jako je tyrosin. Jak protein roste, je každá aminokyselina přidávána na konec enzymem nazývaným transfer RNA (tRNA). Každá aminokyselina má svou vlastní tRNA a tyrosyl-tRNA syntetáza je tRNA, která přidává tyrosin na konec rostoucího proteinu.
Aminoacyl-tRNA syntetázy katalyzovat aminoacylaci přenos RNA (tRNA) jejich příbuznou aminokyselinou. Vzhledem k jejich ústřední úloze při spojování aminokyselin s nukleotidovými triplety obsaženými v tRNA jsou aminoacyl-tRNA syntetázy považovány za první proteiny, které se objevily v evoluci. Tyrosyl-tRNA syntetáza patří do rodiny tRNA syntetázy třídy I. Cytokin byly také pozorovány aktivity pro lidskou tyrosyl-tRNA syntetázu poté, co byla rozdělena na dvě části, N-terminál fragment, který ukrývá katalytické místo a a C-terminál fragment nalezený pouze v savčím enzymu. N-koncový fragment je cytokin podobný interleukinu-8, zatímco uvolněný C-koncový fragment je cytokin podobný EMAP II.[6]
Nedávno byla tyrosyl-tRNA syntetáza prokázána jako biologicky a funkčně významný cíl pro resveratrol.[7]
Pro srovnání cytoplazmatický lidská tyrosyl-tRNA syntetáza s mitochondriálním protějškem a tyrosyl-tRNA syntetázy jiných biologických království a organismů, viz stránka Wikipedia na Tyrosin-tRNA ligáza a obecný přehled jejich struktur a funkcí.[8]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000134684 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Ribas de Pouplana L, Frugier M, Quinn CL, Schimmel P (únor 1996). „Důkazy o tom, že dvě současné složky potřebné pro genetický kód se objevily po oddělení jaderných buněk od eubakterií“. Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (1): 166–70. Bibcode:1996PNAS ... 93..166R. doi:10.1073 / pnas.93.1.166. PMC 40199. PMID 8552597.
- ^ Kleeman TA, Wei D, Simpson KL, první EA (červen 1997). „Lidská tyrosyl-tRNA syntetáza sdílí homologii aminokyselinové sekvence s domnělým cytokinem“. J Biol Chem. 272 (22): 14420–5. doi:10.1074 / jbc.272.22.14420. PMID 9162081.
- ^ A b „Entrez Gene: YARS tyrosyl-tRNA syntetáza“.
- ^ Sajish, Mathew; Schimmel, Paul (2015). „Lidská tRNA syntetáza je silným PARP1 aktivujícím efektorovým cílem pro resveratrol“. Příroda. 519 (7543): 370–373. Bibcode:2015 Natur.519..370S. doi:10.1038 / příroda14028. PMC 4368482. PMID 25533949.
- ^ Bedouelle, Hugues (2013). Tyrosyl-tRNA syntetázy. In: Madame Curie Bioscience Database [NCBI NBK6553]. Austin (TX): Landes Bioscience.
Další čtení
- Ewalt KL, Schimmel P (2002). "Aktivace angiogenních signálních drah dvěma lidskými tRNA syntetázami". Biochemie. 41 (45): 13344–9. doi:10.1021 / bi020537k. PMID 12416978.
- Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Wakasugi K, Quinn CL, Tao N, Schimmel P (1998). „Genetický kód v evoluci: přepínání druhově specifické aminoacylace s transplantací peptidu“. EMBO J.. 17 (1): 297–305. doi:10.1093 / emboj / 17.1.297. PMC 1170380. PMID 9427763.
- Wakasugi K, Schimmel P (1999). "Dva odlišné cytokiny uvolněné z lidské aminoacyl-tRNA syntetázy". Věda. 284 (5411): 147–51. doi:10.1126 / science.284.5411.147. PMID 10102815.
- Wakasugi K, Schimmel P (1999). „Vysoce diferencované motivy odpovědné za dvě cytokinové aktivity rozdělené lidské tRNA syntetázy“. J. Biol. Chem. 274 (33): 23155–9. doi:10.1074 / jbc.274.33.23155. PMID 10438485.
- Austin J, první EA (2002). „Katalýza tvorby tyrosyl-adenylátu lidskou tyrosyl-tRNA syntetázou“. J. Biol. Chem. 277 (17): 14812–20. doi:10,1074 / jbc.M103396200. PMID 11856731.
- Austin J, první EA (2002). „Draslík funkčně nahrazuje druhý lysin signální sekvence KMSKS v lidské tyrosyl-tRNA syntetáze“. J. Biol. Chem. 277 (23): 20243–8. doi:10.1074 / jbc.M201923200. PMID 11927599.
- Wakasugi K, Slike BM, Hood J a kol. (2002). „Indukce angiogeneze fragmentem lidské tyrosyl-tRNA syntetázy“. J. Biol. Chem. 277 (23): 20124–6. doi:10.1074 / jbc.C200126200. PMID 11956181.
- Austin J, první EA (2002). „Srovnání katalytických rolí, které hraje motiv KMSKS v lidských a Bacillus stearothermophilus trosyl-tRNA syntetázách“. J. Biol. Chem. 277 (32): 28394–9. doi:10,1074 / jbc.M204404200. PMID 12016229.
- Yang XL, Skene RJ, McRee DE, Schimmel P (2003). "Krystalová struktura cytokinu lidské aminoacyl-tRNA syntetázy". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (24): 15369–74. doi:10.1073 / pnas.242611799. PMC 137723. PMID 12427973.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Jia J, Li B, Jin Y, Wang D (2003). "Exprese, čištění a charakterizace lidské tyrosyl-tRNA syntetázy". Protein Expr. Purif. 27 (1): 104–8. doi:10.1016 / S1046-5928 (02) 00576-4. PMID 12509991.
- Gevaert K, Goethals M, Martens L a kol. (2004). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801.
- Jordanova A, Thomas FP, Guergueltcheva V, et al. (2004). „Dominantní meziprodukt Charcot-Marie-Tooth typu C se mapuje na chromozom 1p34-p35“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 73 (6): 1423–30. doi:10.1086/379792. PMC 1180404. PMID 14606043.
- Yang XL, Otero FJ, Skene RJ a kol. (2004). „Krystalové struktury, které naznačují pozdní vývoj složek genetického kódu pro rozlišení aromatických postranních řetězců“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (26): 15376–80. doi:10.1073 / pnas.2136794100. PMC 307575. PMID 14671330.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
externí odkazy
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P54577 (Tyrosin - tRNA ligáza, cytoplazmatická) na PDBe-KB.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |