WWOX - WWOX - Wikipedia

WWOX
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1 WMV
Identifikátory
Aliasy	WWOX, D16S432E, FOR, FRA16D, HHCMA56, PRO0128, SCAR12, SDR41C1, WOX1, EIEE28, doména WW obsahující oxidoreduktázu
Externí ID	OMIM: 605131 MGI: 1931237 HomoloGene: 56334 Genové karty: WWOX
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	79,212,667 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	115,352,708 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105; • aktivita dimerizace bílkovin; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba enzymu; • aktivita oxidoreduktázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • Golgiho aparát; • buněčná membrána; • mikrovilli; • Komplex transkripčních faktorů RNA polymerázy II; • mitochondrie; • buněčné jádro;
Biologický proces	• buněčná odpověď na stimul transformujícího růstového faktoru beta; • metabolický proces steroidů; • vnější apoptotická signální cesta; • negativní regulace signální dráhy Wnt; • morfogeneze kosterního systému; • Wnt signální cesta; • pozitivní regulace vnější apoptotické signální dráhy v nepřítomnosti ligandu; • diferenciace osteoblastů; • vnitřní apoptotická signální cesta zprostředkovatelem třídy p53; • pozitivní regulace vnější apoptotické signální dráhy; • oxidačně-redukční proces; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • apoptotický proces; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51741
	80707
	ENSG00000186153
	ENSMUSG00000004637
	Q9NZC7
	Q91WL8
NM_001291997; NM_016373; NM_018560; NM_130788; NM_130790;
	NM_130791; NM_130792; NM_130844
	NM_019573
	NP_001278926; NP_057457; NP_570607
	NP_062519
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Oxidoreduktáza obsahující WW doménu je enzym že u lidí je kódován WWOX gen.^[5]^[6]^[7]^[8]

Funkce

WW doména -obsahující proteiny se nacházejí ve všech eukaryotech a hrají důležitou roli v regulaci široké škály buněčných funkcí, jako je degradace proteinu, transkripce a sestřih RNA. Tento gen kóduje protein, který obsahuje 2 WW domény a doménu dehydrogenázy / reduktázy s krátkým řetězcem (SRD). Nejvyšší normální exprese tohoto genu je detekována v hormonálně regulovaných tkáních, jako jsou varlata, vaječníky a prostata. Tento expresní vzorec a přítomnost SRD domény naznačují roli tohoto genu v metabolismu steroidů. Kódovaný protein je více než 90% identický s myším proteinem, který je podstatným mediátorem apoptózy indukované alfa-faktorem nádorové nekrózy, což naznačuje podobnou důležitou roli v apoptóze pro lidský protein. Kromě toho existují důkazy, že se tento gen chová jako supresor růstu nádoru. Alternativní sestřih tohoto genu generuje varianty transkriptu, které kódují různé izoformy.^[8]

WWOX je také známý jako lidská zrychlená oblast 6. Může proto hrát klíčovou roli při odlišení lidí od lidoopů.^[9]

Interakce

WWOX bylo prokázáno komunikovat s P53 a ACK1.^[10]^[11]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000186153 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000004637 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bednarek AK, Laflin KJ, Daniel RL, Liao Q, Hawkins KA, Aldaz CM (květen 2000). „WWOX, nové mapování proteinu obsahující WW doménu na lidský chromozom 16q23.3-24.1, oblast často postiženou rakovinou prsu“. Cancer Res. 60 (8): 2140–5. PMID 10786676.
^ Ried K, Finnis M, Hobson L, Mangelsdorf M, Dayan S, Nancarrow JK, Woollatt E, Kremmidiotis G, Gardner A, Venter D, Baker E, Richards RI (září 2000). „Společná sekvence FRA16D křehkého místa chromozomu: identifikace genu FOR zahrnujícího FRA16D a homozygotní delece a hraniční body translokace v rakovinných buňkách“. Hum Mol Genet. 9 (11): 1651–63. doi:10,1093 / hmg / 9.11.1651. PMID 10861292.
^ Persson B, Kallberg Y, Bray JE, Bruford E, Dellaporta SL, Favia AD, Duarte RG, Jörnvall H, Kavanagh KL, Kedishvili N, Kisiela M, Maser E, Mindnich R, Orchard S, Penning TM, Thornton JM, Adamski J , Oppermann U (únor 2009). „Iniciativa pro názvosloví SDR (dehydrogenáza / reduktáza s krátkým řetězcem a související enzymy)“. Chem Biol Interact. 178 (1–3): 94–8. doi:10.1016 / j.cbi.2008.10.040. PMC 2896744. PMID 19027726.
^ ^A ^b „Entrez Gene: WWOX WW doména obsahující oxidoreduktázu“.
^ Pollard KS, Salama SR, Lambert N, Lambot MA, Coppens S, Pedersen JS, Katzman S, King B, Onodera C, Siepel A, Kern AD, Dehay C, Igel H, Ares M, Vanderhaeghen P, Haussler D (2006- 08-16). „Gen RNA exprimovaný během kortikálního vývoje se u lidí rychle vyvinul“ (PDF). Příroda. 443 (7108): 167–72. doi:10.1038 / nature05113. PMID 16915236. S2CID 18107797. doplněk
^ Chang NS, Pratt N, Heath J, Schultz L, Sleve D, Carey GB, Zevotek N (únor 2001). „Hyaluronidáza indukce oxidoreduktázy obsahující WW doménu, která zvyšuje cytotoxicitu faktoru nekrotizujícího nádory“. J. Biol. Chem. 276 (5): 3361–70. doi:10,1074 / jbc.M007140200. PMID 11058590.
^ Mahajan NP, Whang YE, Mohler JL, Earp HS (listopad 2005). „Aktivovaná tyrosinkináza Ack1 podporuje tumorigenezu prostaty: role Ack1 v polyubikvitaci tumor supresoru Wwox“. Cancer Res. 65 (22): 10514–23. CiteSeerX 10.1.1.322.9333. doi:10.1158 / 0008-5472.can-05-1127. PMID 16288044.

Další čtení

Ramos D, Aldaz CM (2007). "WWOX, chromozomální křehký gen místa a jeho role v rakovině". Nové trendy v rakovině pro 21. století. Adv. Exp. Med. Biol. Pokroky v experimentální medicíně a biologii. 587. 149–59. doi:10.1007/978-1-4020-5133-3_14. ISBN 978-1-4020-4966-8. PMID 17163164.
Chang NS, Pratt N, Heath J, Schultz L, Sleve D, Carey GB, Zevotek N (2001). „Hyaluronidáza indukce oxidoreduktázy obsahující WW doménu, která zvyšuje cytotoxicitu faktoru nekrotizujícího nádory“. J. Biol. Chem. 276 (5): 3361–70. doi:10,1074 / jbc.M007140200. PMID 11058590.
Paige AJ, Taylor KJ, Taylor C, Hillier SG, Farrington S, Scott D, Porteous DJ, Smyth JF, Gabra H, Watson JE (2001). „WWOX: Kandidátní tumor supresorový gen podílející se na více typech nádorů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (20): 11417–22. doi:10.1073 / pnas.191175898. PMC 58744. PMID 11572989.
Bednarek AK, Keck-Wagoner CL, Daniel RL, Laflin KJ, Bergsagel PL, Kiguchi K, Brenner AJ, Aldaz CM (2001). „WWOX, gen FRA16D, se chová jako supresor růstu nádoru“. Cancer Res. 61 (22): 8068–73. PMID 11719429.
Kuroki T, Trapasso F, Shiraishi T, Alder H, Mimori K, Mori M, Croce CM (2002). "Genetické změny tumor supresorového genu WWOX u karcinomu dlaždicových buněk jícnu". Cancer Res. 62 (8): 2258–60. PMID 11956080.
Chang NS, Doherty J, Ensign A (2003). „JNK1 fyzicky interaguje s oxidoreduktázou obsahující WW doménu (WOX1) a inhibuje apoptózu zprostředkovanou WOX1“. J. Biol. Chem. 278 (11): 9195–202. doi:10,1074 / jbc.M208373200. PMID 12514174.
Ludes-Meyers JH, Bednarek AK, Popescu NC, Bedford M, Aldaz CM (2004). „WWOX, společné chromozomální křehké místo, FRA16D, gen pro rakovinu“. Cytogenet. Genome Res. 100 (1–4): 101–10. doi:10.1159/000072844. PMC 4150470. PMID 14526170.
Watanabe A, Hippo Y, Taniguchi H, Iwanari H, Yashiro M, Hirakawa K, Kodama T, Aburatani H (2004). "Opačný názor na funkci proteinu WWOX jako supresoru nádoru". Cancer Res. 63 (24): 8629–33. PMID 14695174.
Chen ST, Chuang JI, Wang JP, Tsai MS, Li H, Chang NS (2004). „Exprese oxidoreduktázy WOX1 obsahující WW doménu ve vyvíjejícím se myším nervovém systému“. Neurovědy. 124 (4): 831–9. doi:10.1016 / j.neuroscience.2003.12.036. PMID 15026124. S2CID 14784743.
Ishii H, Mimori K, Vecchione A, Sutheesophon K, Fujiwara T, Mori M, Furukawa Y (2004). "Účinek exogenního E2F-1 na expresi běžných genů křehkého místa chromozomu, FHIT a WWOX". Biochem. Biophys. Res. Commun. 316 (4): 1088–93. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.02.159. PMID 15044096.
Ludes-Meyers JH, Kil H, Bednarek AK, Drake J, Bedford MT, Aldaz CM (2004). „WWOX váže specifický ligand bohatý na prolin PPXY: identifikace kandidátských interagujících proteinů“. Onkogen. 23 (29): 5049–55. doi:10.1038 / sj.onc.1207680. PMC 4143251. PMID 15064722.
Aqeilan RI, Pekarsky Y, Herrero JJ, Palamarchuk A, Letofsky J, Druck T, Trapasso F, Han SY, Melino G, Huebner K, Croce CM (2004). „Funkční asociace mezi nádorovým supresorovým proteinem Wwox a p73, homologem p53“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (13): 4401–6. doi:10.1073 / pnas.0400805101. PMC 384759. PMID 15070730.
Kuroki T, Yendamuri S, Trapasso F, Matsuyama A, Aqeilan RI, Alder H, Rattan S, Cesari R, Nolli ML, Williams NN, Mori M, Kanematsu T, Croce CM (2004). „Nádorový supresorový gen WWOX na FRA16D se podílí na karcinogenezi pankreatu“. Clin. Cancer Res. 10 (7): 2459–65. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-03-0096. PMID 15073125.
Guler G, Uner A, Guler N, Han SY, Iliopoulos D, Hauck WW, McCue P, Huebner K (2004). „Křehké geny FHIT a WWOX jsou inaktivovány koordinovaně u invazivního karcinomu prsu“. Rakovina. 100 (8): 1605–14. doi:10.1002 / cncr.20137. PMID 15073846. S2CID 23157412.
Sze CI, Su M, Pugazhenthi S, Jambal P, Hsu LJ, Heath J, Schultz L, Chang NS (2004). „Dolní regulace oxidoreduktázy obsahující WW doménu indukuje fosforylaci Tau in vitro. Potenciální role při Alzheimerově chorobě“. J. Biol. Chem. 279 (29): 30498–506. doi:10,1074 / jbc.M401399200. PMID 15126504.
Aqeilan RI, Kuroki T, Pekarsky Y, Albagha O, Trapasso F, Baffa R, Huebner K, Edmonds P, Croce CM (2004). "Ztráta exprese WWOX u karcinomu žaludku". Clin. Cancer Res. 10 (9): 3053–8. doi:10.1158 / 1078-0432.CCR-03-0594. PMID 15131042.
Park SW, Ludes-Meyers J, Zimonjic DB, Durkin ME, Popescu NC, Aldaz CM (2004). „Častá downregulace a ztráta exprese genu WWOX v lidském hepatocelulárním karcinomu“. Br. J. Cancer. 91 (4): 753–9. doi:10.1038 / sj.bjc.6602023. PMC 2364795. PMID 15266310.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000186153 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000004637 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10786676-5] Bednarek AK, Laflin KJ, Daniel RL, Liao Q, Hawkins KA, Aldaz CM (květen 2000). „WWOX, nové mapování proteinu obsahující WW doménu na lidský chromozom 16q23.3-24.1, oblast často postiženou rakovinou prsu“. Cancer Res. 60 (8): 2140–5. PMID 10786676.

[pmid10861292-6] Ried K, Finnis M, Hobson L, Mangelsdorf M, Dayan S, Nancarrow JK, Woollatt E, Kremmidiotis G, Gardner A, Venter D, Baker E, Richards RI (září 2000). „Společná sekvence FRA16D křehkého místa chromozomu: identifikace genu FOR zahrnujícího FRA16D a homozygotní delece a hraniční body translokace v rakovinných buňkách“. Hum Mol Genet. 9 (11): 1651–63. doi:10,1093 / hmg / 9.11.1651. PMID 10861292.

[pmid19027726-7] Persson B, Kallberg Y, Bray JE, Bruford E, Dellaporta SL, Favia AD, Duarte RG, Jörnvall H, Kavanagh KL, Kedishvili N, Kisiela M, Maser E, Mindnich R, Orchard S, Penning TM, Thornton JM, Adamski J , Oppermann U (únor 2009). „Iniciativa pro názvosloví SDR (dehydrogenáza / reduktáza s krátkým řetězcem a související enzymy)“. Chem Biol Interact. 178 (1–3): 94–8. doi:10.1016 / j.cbi.2008.10.040. PMC 2896744. PMID 19027726.

[entrez-8] A ^b „Entrez Gene: WWOX WW doména obsahující oxidoreduktázu“.

[Pollard2006-9] Pollard KS, Salama SR, Lambert N, Lambot MA, Coppens S, Pedersen JS, Katzman S, King B, Onodera C, Siepel A, Kern AD, Dehay C, Igel H, Ares M, Vanderhaeghen P, Haussler D (2006- 08-16). „Gen RNA exprimovaný během kortikálního vývoje se u lidí rychle vyvinul“ (PDF). Příroda. 443 (7108): 167–72. doi:10.1038 / nature05113. PMID 16915236. S2CID 18107797. doplněk

[pmid11058590-10] Chang NS, Pratt N, Heath J, Schultz L, Sleve D, Carey GB, Zevotek N (únor 2001). „Hyaluronidáza indukce oxidoreduktázy obsahující WW doménu, která zvyšuje cytotoxicitu faktoru nekrotizujícího nádory“. J. Biol. Chem. 276 (5): 3361–70. doi:10,1074 / jbc.M007140200. PMID 11058590.

[pmid16288044-11] Mahajan NP, Whang YE, Mohler JL, Earp HS (listopad 2005). „Aktivovaná tyrosinkináza Ack1 podporuje tumorigenezu prostaty: role Ack1 v polyubikvitaci tumor supresoru Wwox“. Cancer Res. 65 (22): 10514–23. CiteSeerX 10.1.1.322.9333. doi:10.1158 / 0008-5472.can-05-1127. PMID 16288044.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]