WIPI2 - WIPI2 - Wikipedia

WIPI2
Identifikátory
Aliasy	WIPI2, ATG18B, Atg21, WIPI-2, CGI-50, WD opakovaná doména, fosfoinositid interagující 2, IDDSSA
Externí ID	OMIM: 609225 MGI: 1923831 HomoloGene: 90887 Genové karty: WIPI2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	5,233,840 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	142,670,588 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba fosfatidylinositol-5-fosfátu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba fosfatidylinositol-3-fosfátu; • vazba fosfatidylinositol-3,5-bisfosfátu; • vazba lipidů;
Buněčná složka	• autofagozom; • cytosol; • membrána před autofagozomální strukturou; • membrána; • pre-autofagozomální struktura; • vnější složka membrány; • nukleoplazma; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• autofagie; • GO: 0000046 zrání autofagosomu; • makroautofagie; • autofagozomální sestava; • mitofagie; • lipidace bílkovin; • autofagie jádra; • lokalizace proteinu do pre-autofagozomální struktury; • lipidace proteinu zapojená do sestavování autofagosomu; • xenofágie; • buněčná odpověď na hladovění;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	26100
	74781
	ENSG00000157954
	ENSMUSG00000029578
	Q9Y4P8
	Q80W47
NM_001033518; NM_001033519; NM_001033520; NM_001278299; NM_015610;
	NM_016003
	NM_178398
NP_001028690; NP_001028691; NP_001028692; NP_001265228; NP_056425;
	NP_057087; NP_056425.1
	NP_848485
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

WD opakující se doména protein interagující s fosfoinositidem 2 je protein že u lidí je kódován WIPI2 gen.^[5]^[6]

Funkce

WD40 opakovat proteiny jsou klíčovými složkami mnoha základních biologických funkcí. Regulují sestavení komplexů multiproteinů tím, že představují beta-vrtulovou platformu pro současné a reverzibilní interakce protein-protein. Členové podskupiny WIPI opakujících se proteinů WD40, jako je WIPI2, mají vrtulovou strukturu se 7 lopatkami a obsahují konzervovaný motiv pro interakci s fosfolipidy.^[5]^[6]

WIPI2 je savčí homolog Atg18, nikoli Atg21, spolu s blízce příbuzným proteinem, WIPI1. WIPI2 mRNA je snadno detekovatelná v několika běžně používaných laboratorních buněčných liniích (HEK293A, HeLa, A431) a v několika rakovinných buněčných liniích, zatímco exprese WIPI1 je omezena na rakovinné buňky [je třeba ji také detekovat v mnoha lidských tkáních].

Atg proteiny regulují autofagie, což je lysozomální degradace vyžadovaná pro udržení zdraví buněk, přežívající období deprivace živin a také hraje roli při rakovině, neurodegeneraci a imunitních reakcích na nejrůznější patogeny.^[7] WIPI2 je přijímán brzy do formujícího se autofagosomu spolu s DFCP-1, ULK-1 a Atg16, kde pozitivně reguluje lipidaci Atg8 (LC3). To neplatí pro WIPI1.

Viz také

Rodina proteinů WIPI

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000157954 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029578 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Proikas-Cezanne T, Waddell S, Gaugel A, Frickey T, Lupas A, Nordheim A (prosinec 2004). „WIPI-1alfa (WIPI49), člen nové rodiny proteinů WIPI se 7 čepelemi, je aberantně exprimován u lidské rakoviny a je spojen s autofagií vyvolanou hladem“. Onkogen. 23 (58): 9314–25. doi:10.1038 / sj.onc.1208331. PMID 15602573.
^ ^A ^b „Entrez Gene: WIPI2 WD repeat domain, fosfoinositid interagující 2“.
^ Orsi A, Polson HE, Tooze SA (prosinec 2009). "Události obchodování s membránami, které se účastní autofagie". Curr Opin Cell Biol. 22 (2): 150–6. doi:10.1016 / j.ceb.2009.11.013. PMID 20036114.

* Polson HE, de Lartigue J, Rigden DJ, Reedijk M, Urbé S, Clague MJ, Tooze SA (2010). „Savčí Atg18 (WIPI2) lokalizuje fagofory ukotvené v omegasomech a pozitivně reguluje lipidaci LC3“. Autofagie. 6 (4): 506–22. doi:10,4161 / auto.6.4.11863. PMID  20505359.

Další čtení

Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: potrubí funkční genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Hillier LW, Fulton RS, Fulton LA a kol. (2003). „Sekvence DNA lidského chromozomu 7“. Příroda. 424 (6945): 157–64. doi:10.1038 / nature01782. PMID 12853948.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro specifické specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY a kol. (2000). „Identifikace nových lidských genů evolučně konzervovaných u Caenorhabditis elegans srovnávací proteomikou“. Genome Res. 10 (5): 703–13. doi:10,1101 / gr. 10.703. PMC 310876. PMID 10810093.
(1999). „Směrem k úplné sekvenci lidského genomu“. Genome Res. 8 (11): 1097–108. doi:10.1101 / gr.8.11.1097. PMID 9847074.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000157954 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029578 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid15602573-5] A ^b Proikas-Cezanne T, Waddell S, Gaugel A, Frickey T, Lupas A, Nordheim A (prosinec 2004). „WIPI-1alfa (WIPI49), člen nové rodiny proteinů WIPI se 7 čepelemi, je aberantně exprimován u lidské rakoviny a je spojen s autofagií vyvolanou hladem“. Onkogen. 23 (58): 9314–25. doi:10.1038 / sj.onc.1208331. PMID 15602573.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: WIPI2 WD repeat domain, fosfoinositid interagující 2“.

[pmid20036114-7] Orsi A, Polson HE, Tooze SA (prosinec 2009). "Události obchodování s membránami, které se účastní autofagie". Curr Opin Cell Biol. 22 (2): 150–6. doi:10.1016 / j.ceb.2009.11.013. PMID 20036114.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]