WDR57 - WDR57
Opakovaná doména WD 57 (specifická pro U5 snRNP), také známý jako WDR57, je gen nachází se v mnoha organismech, mimo jiné Homo sapiens, Gallus gallus, Pan troglodyty, Canus familiaris, Bos taurus, Mus musculus, a Rattus norvegicus.[4]
Funkce
Tento gen kóduje složku U5 malé částice nukleárního ribonukleoproteinu (snRNP). U5 snRNP je součástí spliceosomu, multiproteinového komplexu, který katalyzuje odstranění intronů z pre-poselských RNA.[4]
Interakce
WDR57 bylo prokázáno komunikovat s PRPF8[5][6] a EFTUD2.[5][6]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000060688 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b „Entrez Gene: WDR57 WD repeat domain 57 (U5 snRNP specific)“.
- ^ A b Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
- ^ A b Achsel T, Ahrens K, Brahms H, Teigelkamp S, Lührmann R (listopad 1998). „Lidský protein U5-220kD (hPrp8) tvoří stabilní komplex bez RNA s několika proteiny specifickými pro U5, včetně RNA unwindase, homologu ribozomálního elongačního faktoru EF-2 a nového proteinu WD-40.“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (11): 6756–66. doi:10,1128 / mcb.18.11.6756. PMC 109259. PMID 9774689.
Další čtení
- Turner IA, Norman CM, Churcher MJ, Newman AJ (prosinec 2004). "Role U5 snRNP v dynamice spliceosomu a katalýze". Transakce s biochemickou společností. 32 (Pt 6): 928–31. doi:10.1042 / BST0320928. PMID 15506927.
- Neubauer G, král A, Rappsilber J, Calvio C, Watson M, Ajuh P, Sleeman J, Lamond A, Mann M (září 1998). "Hmotnostní spektrometrie a vyhledávání v EST databázi umožňuje charakterizaci komplexu multiproteinových spliceosomů". Genetika přírody. 20 (1): 46–50. doi:10.1038/1700. PMID 9731529.
- Achsel T, Ahrens K, Brahms H, Teigelkamp S, Lührmann R (listopad 1998). „Lidský protein U5-220kD (hPrp8) tvoří stabilní komplex bez RNA s několika proteiny specifickými pro U5, včetně RNA unwindase, homologu ribozomálního elongačního faktoru EF-2 a nového proteinu WD-40.“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (11): 6756–66. doi:10,1128 / mcb.18.11.6756. PMC 109259. PMID 9774689.
- Makarov EM, Makarova OV, Achsel T, Lührmann R (květen 2000). „Lidský homolog faktoru sestřihu kvasinek prp6p obsahuje více TPR prvků a je stabilně spojován s U5 snRNP prostřednictvím interakcí protein-protein“. Journal of Molecular Biology. 298 (4): 567–75. doi:10.1006 / jmbi.2000.3685. PMID 10788320.
- Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (duben 2002). „Čištění a charakterizace nativních spliceosomů vhodných pro trojrozměrnou strukturní analýzu“. RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
- Jordanova A, Irobi J, Thomas FP, Van Dijck P, Meerschaert K, Dewil M, Dierick I, Jacobs A, De Vriendt E, Guergueltcheva V, Rao CV, Tournev I, Gondim FA, D'Hooghe M, Van Gerwen V, Callaerts P, Van Den Bosch L, Timmermans JP, Robberecht W, Gettemans J, Thevelein JM, De Jonghe P, Kremensky I, Timmerman V (únor 2006). „Narušená funkce a axonální distribuce mutantní tyrosyl-tRNA syntetázy v dominantní intermediární neuropatii Charcot-Marie-Tooth“. Genetika přírody. 38 (2): 197–202. doi:10.1038 / ng1727. PMID 16429158.
- Liu S, Rauhut R, Vornlocher HP, Lührmann R (červenec 2006). „Síť interakcí protein-protein v lidském tri-snRNP U4 / U6.U5“. RNA. 12 (7): 1418–30. doi:10,1261 / rna.55406. PMC 1484429. PMID 16723661.
- Higa LA, Wu M, Ye T, Kobayashi R, Sun H, Zhang H (listopad 2006). „Ubikvitinová ligáza CUL4-DDB1 interaguje s více proteiny opakujícími se WD40 a reguluje methylaci histonu“. Přírodní buněčná biologie. 8 (11): 1277–83. doi:10.1038 / ncb1490. PMID 17041588.
- Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
![]() | Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |