WDR5 - WDR5
Protein obsahující WD opakovaně 5 je protein že u lidí je kódován WDR5 gen.[5][6]
Tento gen kóduje člena rodiny proteinů WD repeat. Opakování WD jsou minimálně konzervované oblasti přibližně 40 aminokyselin, které jsou typicky spojeny gly-his a trp-asp (GH-WD), což může usnadnit tvorbu heterotrimerních nebo multiproteinových komplexů. Členové této rodiny se účastní různých buněčných procesů, včetně progrese buněčného cyklu, signální transdukce, apoptózy a genové regulace. Tento protein obsahuje 7 opakování WD. Alternativně byly identifikovány sestřihové varianty transkriptu kódující stejný protein.[6]
Interakce
WDR5 bylo prokázáno komunikovat s Faktor hostitelské buňky C1[7][8] a MLL.[7] Interaguje také s dlouhá nekódující RNA TIP.[9]WDR5 je klíčový determinant pro MOJE C nábor do chromatin[10]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196363 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026917 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Gori F, Divieti P, Demay MB (prosinec 2001). „Klonování a charakterizace nového proteinu opakování WD-40, který dramaticky urychluje osteoblastickou diferenciaci“. J Biol Chem. 276 (49): 46515–22. doi:10,1074 / jbc.M105757200. PMID 11551928.
- ^ A b „Entrez Gene: WDR5 WD opakovaná doména 5“.
- ^ A b Yokoyama, Akihiko; Wang Zhong; Wysocka Joanna; Sanyal Mrinmoy; Aufiero Deborah J; Kitabayashi Issay; Herr Winship; Cleary Michael L (červenec 2004). „Leukemický protoonkoprotein MLL tvoří komplex histonmethyltransferázy podobný SET1 s meninem k regulaci exprese genu Hox“. Mol. Buňka. Biol. 24 (13): 5639–49. doi:10.1128 / MCB.24.13.5639-5649.2004. ISSN 0270-7306. PMC 480881. PMID 15199122.
- ^ Wysocka, Joanna; Myers Michael P; Laherty Carol D; Eisenman Robert N; Herr Winship (duben 2003). „Lidská sin3 deacetyláza a trithorax související s Set1 / Ash2 histonem H3-K4 methyltransferáza jsou spolu vázány selektivně faktorem buněčné proliferace HCF-1“. Genes Dev. 17 (7): 896–911. doi:10,1101 / gad.252103. ISSN 0890-9369. PMC 196026. PMID 12670868.
- ^ Wang KC, Yang YW, Liu B, Sanyal A, Corces-Zimmerman R, Chen Y a kol. (2011). "Dlouhá nekódující RNA udržuje aktivní chromatin pro koordinaci homeotické genové exprese". Příroda. 472 (7341): 120–4. Bibcode:2011Natur.472..120W. doi:10.1038 / nature09819. PMC 3670758. PMID 21423168.
- ^ Thomas, L. R .; Tansey, W. P. (2015). „Interakce s WDR5 podporuje rozpoznávání cílového genu a tumorigenezi od MYC“. Molekulární buňka. 58 (3): 1–13. doi:10.1016 / j.molcel.2015.02.028. PMC 4427524. PMID 25818646.
Další čtení
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Wysocka J, Myers MP, Laherty CD, et al. (2003). „Lidská sin3 deacetyláza a trithorax související s Set1 / Ash2 histonem H3-K4 methyltransferáza jsou spolu vázány selektivně faktorem buněčné proliferace HCF-1“. Genes Dev. 17 (7): 896–911. doi:10,1101 / gad.252103. PMC 196026. PMID 12670868.
- Gori F, Demay MB (2004). „BIG-3, nový opakující se protein WD-40, je exprimován ve vyvíjející se růstové ploténce a urychluje diferenciaci chondrocytů in vitro“. Endokrinologie. 145 (3): 1050–4. doi:10.1210 / cs.2003-1314. PMID 14657013.
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Yokoyama A, Wang Z, Wysocka J a kol. (2004). „Leukemický protoonkoprotein MLL tvoří komplex histonmethyltransferázy podobný SET1 s meninem k regulaci exprese genu Hox“. Mol. Buňka. Biol. 24 (13): 5639–49. doi:10.1128 / MCB.24.13.5639-5649.2004. PMC 480881. PMID 15199122.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK a kol. (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005 Natur.433 ... 77A. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
- Wysocka J, Swigut T, Milne TA a kol. (2005). „WDR5 se asociuje s histonem H3 methylovaným na K4 a je nezbytný pro methylaci H3 K4 a vývoj obratlovců“. Buňka. 121 (6): 859–72. doi:10.1016 / j.cell.2005.03.036. PMID 15960974. S2CID 17521631.
- Dou Y, Milne TA, Tackett AJ a kol. (2005). "Fyzická asociace a souřadnicová funkce H3 K4 methyltransferázy MLL1 a H4 K16 acetyltransferázy MOF". Buňka. 121 (6): 873–85. doi:10.1016 / j.cell.2005.04.031. PMID 15960975. S2CID 14717470.
- Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Gori F, Friedman L, Demay MB (2006). „Wdr5, nový protein WD opakování, reguluje diferenciaci osteoblastů a chondrocytů in vivo“. Journal of Muskuloskeletal & Neuronal Interaction. 5 (4): 338–9. PMID 16340128.
- Lim J, Hao T, Shaw C a kol. (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
- Ruthenburg AJ, Wang W, Graybosch DM a kol. (2006). „Rozpoznávání a prezentace Histone H3 modulem WDR5 komplexu MLL1“. Nat. Struct. Mol. Biol. 13 (8): 704–12. doi:10.1038 / nsmb1119. PMC 4698793. PMID 16829959.
- Couture JF, Collazo E, Trievel RC (2006). "Molekulární rozpoznávání histonu H3 proteinem WD40 WDR5". Nat. Struct. Mol. Biol. 13 (8): 698–703. doi:10.1038 / nsmb1116. PMID 16829960. S2CID 26165068.
- Dou Y, Milne TA, Ruthenburg AJ a kol. (2006). "Regulace aktivity MLL1 H3K4 methyltransferázy jejími základními složkami". Nat. Struct. Mol. Biol. 13 (8): 713–9. doi:10.1038 / nsmb1128. PMID 16878130. S2CID 12849159.
- Schuetz A, Allali-Hassani A, Martín F a kol. (2006). "Strukturní základ pro molekulární rozpoznávání a prezentaci histonu H3 pomocí WDR5". EMBO J.. 25 (18): 4245–52. doi:10.1038 / sj.emboj.7601316. PMC 1570438. PMID 16946699.
- Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
- Bryan AF, Wang J, Howard GC a kol. (2020). „WDR5 je konzervovaný regulátor genové exprese proteinové syntézy“. Výzkum nukleových kyselin. 48 (6): 2924–2941. doi:10.1093 / nar / gkaa051. PMC 7102967. PMID 31996893.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |