VPS4B - VPS4B
Protein 4B spojený s vakuovým tříděním proteinů je protein že u lidí je kódován VPS4B gen.[5][6]
Protein kódovaný tímto genem je členem AAA proteiny rodina (ATPázy spojené s různými buněčnými aktivitami) a je homologem kvasinkového proteinu Vps4.
U lidí dva paralogy z droždí byly identifikovány bílkoviny. První sdílejí vysoký stupeň aa sekvenční podobnosti mezi sebou navzájem a také s kvasinkovými proteiny Vps4 a myšími proteiny Skd1. Ukázalo se, že myš Skd1 (potlačující transportní vadu K + 1) je kvasinka Vps4 ortolog. Funkční studie ukazují, že oba lidské paralogy se sdružují s endozomální odděleních a jsou zapojeny do intracelulární přenos bílkovin, podobný proteinu Vps4 v kvasnicích. Gen, který to kóduje paralog byl namapován na chromozom 18; gen pro druhého přebývá chromozom 16.[6]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000119541 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000009907 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Scheuring S, Rohricht RA, Schoning-Burkhardt B, Beyer A, Muller S, Abts HF, Kohrer K (září 2001). „Savčí buňky exprimují dva proteiny VPS4, které se podílejí na intracelulárním transportu proteinů“. J Mol Biol. 312 (3): 469–80. doi:10.1006 / jmbi.2001.4917. PMID 11563910.
- ^ A b "Entrez Gene: VPS4B vakuolární protein třídění 4 homolog B (S. cerevisiae)".
Další čtení
- Périer F, Coulter KL, Liang H a kol. (1994). "Identifikace nového savčího člena rodiny NSF / CDC48p / Pas1p / TBP-1 prostřednictvím heterologní exprese v kvasinkách". FEBS Lett. 351 (2): 286–90. doi:10.1016/0014-5793(94)00879-5. PMID 8082782. S2CID 31778093.
- Mao M, Fu G, Wu JS a kol. (1998). „Identifikace genů exprimovaných v lidských CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách pomocí exprimovaných sekvenčních značek a účinného klonování cDNA v plné délce“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 95 (14): 8175–80. doi:10.1073 / pnas.95.14.8175. PMC 20949. PMID 9653160.
- Scheuring S, Bodor O, Röhricht RA a kol. (1999). „Klonování, charakterizace a funkční exprese genu Mus musculus SKD1 v kvasinkách ukazuje, že myší geny SKD1 a kvasinky VPS4 jsou ortology a podílejí se na intracelulárním transportu proteinů.“ Gen. 234 (1): 149–59. doi:10.1016 / S0378-1119 (99) 00163-8. PMID 10393249.
- Bishop N, Woodman P (2000). „Savčí VPS4 s defektem ATPázy se lokalizuje na aberantní endosomy a zhoršuje obchodování s cholesterolem“. Mol. Biol. Buňka. 11 (1): 227–39. doi:10,1091 / mbc.11.1.227. PMC 14770. PMID 10637304.
- Zhang QH, Ye M, Wu XY a kol. (2001). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámečky pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v buňkách hematopoetických kmenových / progenitorových buněk CD34 +“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
- Howard TL, Stauffer DR, Degnin CR, Hollenberg SM (2002). "CHMP1 funguje jako člen nově definované rodiny proteinů přenášejících vezikuly". J. Cell Sci. 114 (Pt 13): 2395–404. PMID 11559748.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Beyer A, Scheuring S, Müller S a kol. (2003). "Srovnávací sekvenční a expresní analýzy čtyř savčích genů VPS4". Gen. 305 (1): 47–59. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 01205-2. PMID 12594041.
- Strack B, Calistri A, Craig S a kol. (2003). „AIP1 / ALIX je vazebným partnerem pro HIV-1 p6 a EIAV p9 fungující při nadějném viru“. Buňka. 114 (6): 689–99. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00653-6. PMID 14505569. S2CID 10733770.
- von Schwedler UK, Stuchell M, Müller B a kol. (2003). "Proteinová síť HIV nadějná". Buňka. 114 (6): 701–13. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00714-1. PMID 14505570. S2CID 16894972.
- Fujita H, Umezuki Y, Imamura K a kol. (2005). „Proteiny Vps třídy E savců, SBP1 a mVps2 / CHMP2A, interagují s a regulují funkci AAA-ATPázy SKD1 / Vps4B“. J. Cell Sci. 117 (Pt 14): 2997–3009. doi:10.1242 / jcs.01170. PMID 15173323.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Katoh K, Suzuki H, Terasawa Y a kol. (2006). „Penta-EF-ruční protein ALG-2 interaguje přímo s ESCRT-I složkou TSG101 a Ca2 + se nezávisle lokalizuje do aberantních endosomů s dominantně negativní AAA ATPázou SKD1 / Vps4B“. Biochem. J. 391 (Pt 3): 677–85. doi:10.1042 / BJ20050398. PMC 1276969. PMID 16004603.
- Takasu H, Jee JG, Ohno A a kol. (2005). "Strukturální charakterizace MIT domény z lidské Vps4b". Biochem. Biophys. Res. Commun. 334 (2): 460–5. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.06.110. PMID 16018968.
- Scott A, Chung HY, Gonciarz-Swiatek M a kol. (2005). „Strukturální a mechanické studie proteinů VPS4“. EMBO J.. 24 (20): 3658–69. doi:10.1038 / sj.emboj.7600818. PMC 1276703. PMID 16193069.
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů ve velkém měřítku“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
- Welsch S, Habermann A, Jäger S a kol. (2007). „Ultrastrukturální analýza proteinů ESCRT naznačuje úlohu tubulárně-vezikulárních membrán asociovaných s endosomy ve funkci ESCRT.“ Provoz. 7 (11): 1551–66. doi:10.1111 / j.1600-0854.2006.00489.x. PMID 17014699.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
- Lambert C, Döring T, Prange R (2007). „Zrání viru hepatitidy B je citlivé na funkční inhibici ESCRT-III, Vps4 a γ2-adapinu“. J. Virol. 81 (17): 9050–60. doi:10.1128 / JVI.00479-07. PMC 1951427. PMID 17553870.
Tento článek o gen na lidský chromozom 18 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |