Sekvence signálního signálu - Uptake signal sequence - Wikipedia

Nasávejte signální sekvence (USS) jsou krátké DNA sekvence přednostně přijaté kompetentními bakterie z rodiny Pasteurellaceae (např., Haemophilus influenzae ). Podobné sekvence, tzv Sekvence absorpce DNA (DUS) se vyskytují u druhů čeledi Neisseriaceae (počítaje v to Neisseria meningitidis a Neisseria gonorrhoeae ).^[1]

Neisseria meningitidis

Genetická transformace je proces, při kterém bakteriální buňka příjemce přijímá DNA ze sousední buňky a integruje tuto DNA do genomu příjemce pomocí rekombinace. v N. meningitidis „Transformace DNA vyžaduje přítomnost krátké DUS (10–12 mérů sídlících v kódujících a intergenních oblastech) donorové DNA. Specifické rozpoznávání DUS je zprostředkováno typem IV Pilin.^[2] Davidsen a kol.^[3] hlásil, že v N. meningitidis DUS se vyskytují ve významně vyšší hustotě genů zapojených do Oprava DNA a rekombinace (stejně jako v restrikční modifikaci a replikaci) než v jiných anotovaných genových skupinách. Tito autoři navrhli, aby nadměrné zastoupení DUS v genech pro reparaci a rekombinaci DNA mohlo odrážet výhodu zachování integrity mechanismu pro reparaci a rekombinaci DNA preferenčním přijetím genů pro udržování genomu, které by mohly nahradit jejich poškozené protějšky v genomu buňky příjemce. Příjem takových genů by mohl poskytnout mechanismus pro usnadnění zotavení z poškození DNA po genotoxický stres.

Reference

^ Frye SA, Nilsen M, Tønjum T, Ambur OH (2013). "Dialekty sekvence absorpce DNA v Neisseriaceae". PLoS Genet. 9 (4): 3065–70. doi:10.1371 / journal.pgen.1003458. PMC 3630211. PMID 23637627.
^ Cehovin A, Simpson PJ, McDowell MA, Brown DR, Noschese R, Pallett M, Brady J, Baldwin GS, Lea SM, Matthews SJ, Pelicic V (2013). „Specifické rozpoznávání DNA zprostředkované pilinem typu IV“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 110 (8): 3065–70. doi:10.1073 / pnas.1218832110. PMC 3581936. PMID 23386723.
^ Davidsen T, Rødland EA, Lagesen K, Seeberg E, Rognes T, Tønjum T (2004). „Předpojatá distribuce sekvencí absorpce DNA do genů pro udržování genomu“. Nucleic Acids Res. 32 (3): 1050–8. doi:10.1093 / nar / gkh255. PMC 373393. PMID 14960717.

externí odkazy

Bakkali, M .; Chen, T.-Y .; Lee, H. C .; Redfield, R. J. (2004). „Evoluční stabilita signálních sekvencí absorpce DNA v Pasteurellaceae“. Sborník Národní akademie věd. 101 (13): 4513–4518. doi:10.1073 / pnas.0306366101. PMC 384778. PMID 15070749.
Bakkali, Mohammed (2007). Fairhead, Cecile (ed.). „Dynamika genomu krátkých oligonukleotidů: příklad sekvencí zvyšujících absorpci bakteriální DNA“. PLOS ONE. 2 (8): e741. doi:10.1371 / journal.pone.0000741. PMC 1939737. PMID 17710141.

Tento genetika článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[pmid23637627-1] Frye SA, Nilsen M, Tønjum T, Ambur OH (2013). "Dialekty sekvence absorpce DNA v Neisseriaceae". PLoS Genet. 9 (4): 3065–70. doi:10.1371 / journal.pgen.1003458. PMC 3630211. PMID 23637627.

[pmid23386723-2] Cehovin A, Simpson PJ, McDowell MA, Brown DR, Noschese R, Pallett M, Brady J, Baldwin GS, Lea SM, Matthews SJ, Pelicic V (2013). „Specifické rozpoznávání DNA zprostředkované pilinem typu IV“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 110 (8): 3065–70. doi:10.1073 / pnas.1218832110. PMC 3581936. PMID 23386723.

[pmid14960717-3] Davidsen T, Rødland EA, Lagesen K, Seeberg E, Rognes T, Tønjum T (2004). „Předpojatá distribuce sekvencí absorpce DNA do genů pro udržování genomu“. Nucleic Acids Res. 32 (3): 1050–8. doi:10.1093 / nar / gkh255. PMC 373393. PMID 14960717.

[1]

[2]

[3]