UXT - UXT

UXT
Identifikátory
Aliasy	UXTART-27, STAP1, všudypřítomně exprimovaný prefoldin jako chaperon
Externí ID	OMIM: 300234 MGI: 1277988 HomoloGene: 40902 Genové karty: UXT
Umístění genu (člověk)
Chr.	X chromozom (lidský)
Konec	47,659,180 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	X chromozom (myš)
Konec	20,962,017 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba mikrotubulů; • vazba aktinového vlákna; • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106; • vazba chromatinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba beta-tubulinu; • GO: Aktivita transkripčního koregulátoru 0001104;
Buněčná složka	• cytoplazma; • centrosome; • komplex gama-tubulin; • cytoskelet; • buněčné jádro; • organizační centrum mikrotubulů; • vřetenová tyč; • nukleoplazma; • chromatin;
Biologický proces	• transport mitochondrií podél mikrotubulů; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • organizace mikrotubulů cytoskeletu; • transkripce, chráněná DNA; • centrosomový cyklus; • apoptotický proces; • negativní regulace přechodu G0 na G1;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8409
	22294
	ENSG00000126756
	ENSMUSG00000001134
	Q9UBK9
	Q9WTZ0
	NM_004182; NM_153477
	NM_013840
	NP_004173; NP_705582
	NP_038868; NP_038868
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein UXT (Ubiquitously eXpressed Transcript protein) také známý jako klon 27 zachycený v androgenním receptoru (ART-27) protein je a protein že u lidí je kódován UXT gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

UXT interaguje s N-konec z androgenní receptor a hraje roli v usnadnění transkripční aktivace vyvolané receptorem. Je také pravděpodobné, že se bude podílet na tumorigenezi, protože je hojně exprimován v nádorových tkáních. Tento gen je součástí genového klastru na chromozomu Xp11.23. Výsledkem alternativního sestřihu jsou 2 varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[7]

Varianta transkriptu 2 má délku 575 bp a kóduje polypeptidovou sekvenci o délce 157 aminokyselin (~ 18 kDa). Ukázalo se, že interaguje se dvěma doménami aktivace N-terminálu AR, které jsou obě vyžadovány pro plnou transkripční aktivaci.^[8] Kromě toho je do značné míry lokalizován do jádra a je vysoce exprimován v epitelových buňkách lidské prostaty i v tkáních prsu. ART-27 pravděpodobně slouží k navázání AR na větší komplex transkripčních faktorů, jak dokazuje jeho asociace s řadou proteinů včetně RNA pol II podjednotka 5, pár prefoldinové β-podjednotky, a Proteiny interagující s TATA vázajícími proteiny.^[9] Ukazuje také homologii s prefoldiny, což jsou proteiny s nízkou molekulovou hmotností, které se shromažďují do komplexů molekulárních chaperonů, aby ovlivnily skládání proteinů.^[8]

Ukázalo se, že ART-27 podléhá jak buněčnému typu, tak vývojové regulaci u lidí. Jeho exprese je spojena s množstvím diferencovaných epiteliálních buněk prostaty a regulovanou expresí v buňky rakoviny prostaty vede ke snížené proliferaci buněk. Je příznačné, že protože se v buňkách rakoviny prostaty trvale nacházejí snížené hladiny ART-27, pravděpodobně hraje roli při podpoře diferenciace epitelu prostřednictvím potlačení proliferativních drah.^[10] Novější studie definitivněji identifikovaly ART-27 jako korpresor AR.^[11] Skutečnost, že zvýšení genové transkripce projevené po vyčerpání ART-27 vyžaduje přítomnost AR, znamená, že konkrétně funguje jako korpresor tohoto receptoru. Navzdory nedostatku informací o jeho mechanismech potlačení hraje ART-27 pravděpodobně několik rolí, které inhibují transkripci zprostředkovanou AR. V nepřítomnosti androgenů může ART-27 vázat AR N konec a tím zabránit AR-dependentní aktivaci genů zapojených do buněčné proliferace. Další mechanismy mohou zahrnovat nábor ART-27 do ARE nebo inhibici methylace histonu což jinak umožňuje zvýšenou transkripci cílových genů.

Interakce

UXT bylo prokázáno komunikovat s Androgenní receptor.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000126756 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001134 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Schroer A, Schneider S, Ropers H, Nothwang H (květen 1999). „Klonování a charakterizace UXT, nového genu v lidském Xp11, který je široce a hojně exprimován v nádorové tkáni“. Genomika. 56 (3): 340–3. doi:10.1006 / geno.1998.5712. PMID 10087202.
^ Zhao H, Wang Q, Zhang H, Liu Q, Du X, Richter M, Greene MI (listopad 2005). „UXT je nový centrosomální protein nezbytný pro životaschopnost buněk“. Mol Biol Cell. 16 (12): 5857–65. doi:10,1091 / mbc.E05-08-0705. PMC 1289427. PMID 16221885.
^ ^A ^b „Entrez Gene: UXT ubikvitně vyjádřený přepis“.
^ ^A ^b ^C Markus SM, Taneja SS, Logan SK, Li W, Ha S, Hittelman AB, Rogatsky I, Garabedian MJ (únor 2002). „Identifikace a charakterizace ART-27, nového koaktivátoru pro N-konec androgenového receptoru“. Mol. Biol. Buňka. 13 (2): 670–82. doi:10.1091 / mbc.01-10-0513. PMC 65658. PMID 11854421.
^ Nwachukwu JC, Li W, Pineda-Torra I, Huang HY, Ruoff R, Shapiro E, Taneja SS, Logan SK, Garabedian MJ (prosinec 2007). "Transkripční regulace klonu 27 zachyceného androgenového receptoru kofaktorem androgenního receptoru". Mol. Endokrinol. 21 (12): 2864–76. doi:10.1210 / me.2007-0094. PMID 17761951.
^ Taneja SS, Ha S, Swenson NK, Torra IP, Rome S, Walden PD, Huang HY, Shapiro E, Garabedian MJ, Logan SK (duben 2004). „ART-27, koaktivátor androgenového receptoru regulovaný ve vývoji prostaty a rakovině“. J. Biol. Chem. 279 (14): 13944–52. doi:10,1074 / jbc.M306576200. PMID 14711828.
^ Nwachukwu JC, Mita P, Ruoff R, Ha S, Wang Q, Huang SJ, Taneja SS, Brown M, Gerald WL, Garabedian MJ, Logan SK (duben 2009). „Dopad ztráty klonu-27 na klon 27 na zachycení androgenu regulované transkripce v buňkách rakoviny prostaty v celém genomu“. Cancer Res. 69 (7): 3140–7. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-08-3738. PMC 2702238. PMID 19318562.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Zhang QH, Ye M, Wu XY a kol. (2001). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Weinmann AS, Yan PS, Oberley MJ a kol. (2002). „Izolace cílů lidského transkripčního faktoru spojením imunoprecipitace chromatinu a analýzy mikročipů ostrova CpG“. Genes Dev. 16 (2): 235–44. doi:10,1101 / gad.943102. PMC 155318. PMID 11799066.
Liu L, McKeehan WL (2002). „Sekvenční analýza LRPPRC a jejích partnerů pro interakci s doménou SEC1 naznačuje role v cytoskeletální organizaci, vezikulárním obchodování, nukleocytosolovém přenosu a aktivitě chromozomu“. Genomika. 79 (1): 124–36. doi:10.1006 / geno.2001.6679. PMC 3241999. PMID 11827465.
Thiselton DL, McDowall J, Brandau O a kol. (2002). „Integrovaná, funkčně anotovaná genová mapa intervalu DXS8026-ELK1 na lidském Xp11.3-Xp11.23: potenciální hotspot pro neurogenetické poruchy“. Genomika. 79 (4): 560–72. doi:10.1006 / geno.2002.6733. PMID 11944989.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Liu L, Amy V, Liu G, McKeehan WL (2003). „Nový komplex integrující mitochondrie a mikrotubulární cytoskeleton s remodelací chromozomů a tumor supresorem RASSF1 odvozený z analýzy homologie silco, klonování interakcí v kvasinkách a kolokalizace v kultivovaných buňkách“. In Vitro Cell. Dev. Biol. Anim. 38 (10): 582–94. doi:10.1290 / 1543-706X (2002) 38 <582: NCIMAT> 2.0.CO; 2. PMC 3225227. PMID 12762840.
Gstaiger M, Luke B, Hess D a kol. (2003). "Řízení transkripčních programů citlivých na živiny nekonvenčním prefoldinovým URI". Věda. 302 (5648): 1208–12. doi:10.1126 / science.1088401. PMID 14615539.
Rayala HJ, Kendirgi F, Barry DM a kol. (2004). „Lidský Gle1 exportní faktor mRNA interaguje s proteinem komplexu jaderných pórů Nup155“. Mol. Buňka. Proteomika. 3 (2): 145–55. doi:10,1074 / mcp.M300106-MCP200. PMID 14645504.
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Ross MT, Grafham DV, Coffey AJ a kol. (2005). „Sekvence DNA lidského chromozomu X“. Příroda. 434 (7031): 325–37. doi:10.1038 / nature03440. PMC 2665286. PMID 15772651.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Moss TN, Vo A, McKeehan WL, Liu L (2007). „UXT (Ubiquitously Expressed Transcript) způsobuje mitochondriální agregaci“. In Vitro Cell. Dev. Biol. Anim. 43 (3–4): 139–46. doi:10.1007 / s11626-007-9016-6. PMC 3229262. PMID 17554592.
Sun S, Tang Y, Lou X a kol. (2007). „UXT je nový a zásadní kofaktor v transkripčním enhanosomu NF-kappaB“. J. Cell Biol. 178 (2): 231–44. doi:10.1083 / jcb.200611081. PMC 2064443. PMID 17620405.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000126756 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000001134 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10087202-5] Schroer A, Schneider S, Ropers H, Nothwang H (květen 1999). „Klonování a charakterizace UXT, nového genu v lidském Xp11, který je široce a hojně exprimován v nádorové tkáni“. Genomika. 56 (3): 340–3. doi:10.1006 / geno.1998.5712. PMID 10087202.

[pmid16221885-6] Zhao H, Wang Q, Zhang H, Liu Q, Du X, Richter M, Greene MI (listopad 2005). „UXT je nový centrosomální protein nezbytný pro životaschopnost buněk“. Mol Biol Cell. 16 (12): 5857–65. doi:10,1091 / mbc.E05-08-0705. PMC 1289427. PMID 16221885.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: UXT ubikvitně vyjádřený přepis“.

[pmid11854421-8] A ^b ^C Markus SM, Taneja SS, Logan SK, Li W, Ha S, Hittelman AB, Rogatsky I, Garabedian MJ (únor 2002). „Identifikace a charakterizace ART-27, nového koaktivátoru pro N-konec androgenového receptoru“. Mol. Biol. Buňka. 13 (2): 670–82. doi:10.1091 / mbc.01-10-0513. PMC 65658. PMID 11854421.

[pmid17761951-9] Nwachukwu JC, Li W, Pineda-Torra I, Huang HY, Ruoff R, Shapiro E, Taneja SS, Logan SK, Garabedian MJ (prosinec 2007). "Transkripční regulace klonu 27 zachyceného androgenového receptoru kofaktorem androgenního receptoru". Mol. Endokrinol. 21 (12): 2864–76. doi:10.1210 / me.2007-0094. PMID 17761951.

[pmid14711828-10] Taneja SS, Ha S, Swenson NK, Torra IP, Rome S, Walden PD, Huang HY, Shapiro E, Garabedian MJ, Logan SK (duben 2004). „ART-27, koaktivátor androgenového receptoru regulovaný ve vývoji prostaty a rakovině“. J. Biol. Chem. 279 (14): 13944–52. doi:10,1074 / jbc.M306576200. PMID 14711828.

[pmid19318562-11] Nwachukwu JC, Mita P, Ruoff R, Ha S, Wang Q, Huang SJ, Taneja SS, Brown M, Gerald WL, Garabedian MJ, Logan SK (duben 2009). „Dopad ztráty klonu-27 na klon 27 na zachycení androgenu regulované transkripce v buňkách rakoviny prostaty v celém genomu“. Cancer Res. 69 (7): 3140–7. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-08-3738. PMC 2702238. PMID 19318562.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]