USP10 - USP10

USP10
Identifikátory
Aliasy	USP10UBPO, ubikvitin specifická peptidáza 10
Externí ID	OMIM: 609818 MGI: 894652 HomoloGene: 31294 Genové karty: USP10
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 16 (lidský)
Konec	84,779,922 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 8 (myš)
Konec	119,957,560 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita peptidázy cysteinového typu; • vazba iontového kanálu; • vazba p53; • aktivita peptidázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita endopeptidázy cysteinového typu; • aktivita hydrolázy; • Vazba RNA; • thiol-závislá ubiquitin-specifická proteázová aktivita;
Buněčná složka	• cytoplazma; • endozom; • nukleoplazma; • časný endosom; • buněčné jádro; • cytosol; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • proteolýza; • autofagie; • regulace autofagie; • syntéza překladů; • buněčná odpověď na interleukin-1; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • negativní regulace signalizace I-kappaB kinázy / NF-kappaB; • Oprava DNA; • deubikvitinace bílkovin; • Odpověď na poškození DNA, transdukce signálu mediátorem třídy p53;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9100
	22224
	ENSG00000103194
	ENSMUSG00000031826
	Q14694
	P52479
	NM_001272075; NM_005153
	NM_009462; NM_001310630
	NP_001259004; NP_005144
	NP_001297559; NP_033488
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Ubiquitin specifická peptidáza 10, také známý jako USP10, je enzym který je u lidí kódován USP10 gen.^[5]

Funkce

Ubikvitin je vysoce konzervovaný protein, který je kovalentně spojen s jinými proteiny, aby reguloval jejich funkci a degradaci. Tento gen kóduje člena rodiny proteáz specifických pro ubikvitin cysteinové proteázy. Enzym specificky štěpí ubikvitin z proteinových substrátů konjugovaných s ubikvitinem. Protein se nachází v jádru a cytoplazmě. Funguje jako kofaktor navázaného na DNA androgenní receptor komplex a je inhibován proteinem v Ras -GTPáza cesta. Lidský genom obsahuje několik pseudogeny podobný tomuto genu.^[5]

Interakce

USP10 bylo prokázáno komunikovat s G3BP1.^[6]V endotelu reguluje USP10 Notch signalizaci zpomalením degradace intracelulární domény Zářez 1. ^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000103194 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031826 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: USP10 ubikvitinová specifická peptidáza 10“.
^ Soncini C, Berdo I, Draetta G (červen 2001). „Protein vázající se na doménu Ras-GAP SH3 (G3BP) je modulátor USP10, nové proteázy specifické pro lidský ubikvitin“. Onkogen. 20 (29): 3869–79. doi:10.1038 / sj.onc.1204553. PMID 11439350. S2CID 7515868.
^ Lim R, Sugino T, Nolte H, Andrade J, Zimmermann B, Shi C, Doddaballapur A, Ong YT, Wilhelm K, Fasse JW, Ernst A, Kaulich M, Husnjak K, Boettger T, Guenther S, Braun T, Krüger M , Benedito R, Dikic I, Potente M (duben 2019). „Deubiquitináza USP10 reguluje signalizaci Notch v endotelu“. Věda. 364 (6436): 188–193. doi:10.1126 / science.aat0778 (neaktivní 2020-10-04). PMID 30975888.CS1 maint: DOI neaktivní od října 2020 (odkaz)

Další čtení

D'Andrea A, Pellman D (1999). „Deubikvitinační enzymy: nová třída biologických regulátorů“. Krit. Biochem. Mol. Biol. 33 (5): 337–52. doi:10.1080/10409239891204251. PMID 9827704.
Puente XS, Sánchez LM, celkově CM, López-Otín C (2003). "Lidské a myší proteázy: komparativní genomický přístup". Nat. Genet. 4 (7): 544–58. doi:10.1038 / nrg1111. PMID 12838346. S2CID 2856065.
Nagase T, Seki N, Ishikawa K, Tanaka A, Nomura N (1996). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. V. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0161-KIAA0200) odvozené analýzou klonů cDNA z lidské buněčné linie KG-1“. DNA Res. 3 (1): 17–24. doi:10.1093 / dnares / 3.1.17. PMID 8724849.
Soncini C, Berdo I, Draetta G (2001). „Protein vázající se na doménu Ras-GAP SH3 (G3BP) je modulátor USP10, nové proteázy specifické pro lidský ubikvitin“. Onkogen. 20 (29): 3869–79. doi:10.1038 / sj.onc.1204553. PMID 11439350. S2CID 7515868.
Fortna A, Kim Y, MacLaren E, Marshall K, Hahn G, Meltesen L, Brenton M, Hink R, Burgers S, Hernandez-Boussard T, Karimpour-Fard A, Glueck D, McGavran L, Berry R, Pollack J, Sikela JM (2006). „Zdvojení a ztráta genů specifických pro daný rod v evoluci člověka a lidoopů“. PLOS Biol. 2 (7): E207. doi:10.1371 / journal.pbio.0020207. PMC 449870. PMID 15252450.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Faus H, Meyer HA, Huber M, Bahr I, Haendler B (2006). „Ubiquitin-specifická proteáza USP10 moduluje funkci androgenového receptoru“. Mol. Buňka. Endokrinol. 245 (1–2): 138–46. doi:10.1016 / j.mce.2005.11.011. PMID 16368182. S2CID 24365493.
Grunda JM, Nabors LB, Palmer CA, Chhieng DC, Steg A, Mikkelsen T Diasio RB, Zhang K, Allison D, Grizzle WE, Wang W, Gillespie GY, Johnson MR (2007). „Zvýšená exprese thymidylát syntetázy (TS), ubikvitin specifické proteázy 10 (USP10) a survivinu je spojena se špatným přežitím v multiformním glioblastomu (GBM)“. J. Neurooncol. 80 (3): 261–74. doi:10.1007 / s11060-006-9191-4. PMID 16773218. S2CID 42007677.
Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (2006). „Přístup založený na pravděpodobnosti pro vysoce výkonnou analýzu fosforylace proteinů a lokalizaci místa“. Nat. Biotechnol. 24 (10): 1285–92. doi:10.1038 / nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292.
Deng S, Zhou H, Xiong R, Lu Y, Yan D, Xing T, Dong L, Tang E, Yang H (2007). „Nadměrná exprese genů a proteinů ubikvitinově specifických peptidáz (USP) a proteazomových podjednotek (PS) v tkáni rakoviny prsu pozorovaná metodami RFDD-PCR a proteomiky“. Breast Cancer Res. Zacházet. 104 (1): 21–30. doi:10.1007 / s10549-006-9393-7. PMID 17004105. S2CID 29643544.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Tento článek o gen na lidský chromozom 16 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000103194 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000031826 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: USP10 ubikvitinová specifická peptidáza 10“.

[pmid11439350-6] Soncini C, Berdo I, Draetta G (červen 2001). „Protein vázající se na doménu Ras-GAP SH3 (G3BP) je modulátor USP10, nové proteázy specifické pro lidský ubikvitin“. Onkogen. 20 (29): 3869–79. doi:10.1038 / sj.onc.1204553. PMID 11439350. S2CID 7515868.

[pmid30975888-7] Lim R, Sugino T, Nolte H, Andrade J, Zimmermann B, Shi C, Doddaballapur A, Ong YT, Wilhelm K, Fasse JW, Ernst A, Kaulich M, Husnjak K, Boettger T, Guenther S, Braun T, Krüger M , Benedito R, Dikic I, Potente M (duben 2019). „Deubiquitináza USP10 reguluje signalizaci Notch v endotelu“. Věda. 364 (6436): 188–193. doi:10.1126 / science.aat0778 (neaktivní 2020-10-04). PMID 30975888.CS1 maint: DOI neaktivní od října 2020 (odkaz)

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]