UBR5 - UBR5
E3 ubikvitin-protein ligáza UBR5 je enzym že u lidí je kódován UBR5 gen.[5][6][7]
Funkce
Tento gen kóduje progestinem indukovaný protein, který patří do rodiny HECT (homologie k E6-AP karboxylovému konci). Proteiny rodiny HECT fungují jako E3 ubikvitin-proteinové ligázy, zaměřené na specifické proteiny pro proteolýzu zprostředkovanou ubikvitinem. Tento gen je lokalizován na chromozomu 8q22, který je narušen u různých druhů rakoviny. Tento gen potenciálně hraje roli v regulaci buněčné proliferace nebo diferenciace.[7]
Interakce
UBR5 bylo prokázáno komunikovat s:
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000104517 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037487 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Callaghan MJ, Russell AJ, Woollatt E, Sutherland GR, Sutherland RL, Watts CK (březen 1999). „Identifikace lidského proteinu rodiny HECT s homologií s hyperplastickými disky supresorového genu Drosophila“. Onkogen. 17 (26): 3479–91. doi:10.1038 / sj.onc.1202249. PMID 10030672.
- ^ Tasaki T, Mulder LC, Iwamatsu A, Lee MJ, Davydov IV, Varshavsky A, Muesing M, Kwon YT (srpen 2005). „Rodina savčích ligandů E3 ubikvitinu, které obsahují motiv UBR Box a rozpoznávají N-degrony“. Mol Cell Biol. 25 (16): 7120–36. doi:10.1128 / MCB.25.16.7120-7136.2005. PMC 1190250. PMID 16055722.
- ^ A b „Entrez Gene: EDD1 E3 ubikvitinová proteinová ligáza, obsahující doménu HECT, 1“.
- ^ A b Henderson MJ, Russell AJ, Hird S, Muñoz M, Clancy JL, Lehrbach GM, Calanni ST, Jans DA, Sutherland RL, Watts CK (červenec 2002). „EDD, protein lidských hyperplastických disků, hraje roli v koaktivaci receptoru progesteronu a potenciálním zapojení do reakce poškození DNA“. J. Biol. Chem. 277 (29): 26468–78. doi:10,1074 / jbc.M203527200. PMID 12011095.
- ^ Eblen ST, Kumar NV, Shah K, Henderson MJ, Watts CK, Shokat KM, Weber MJ (duben 2003). „Identifikace nových substrátů ERK2 pomocí upravené kinázy a analogů ATP“. J. Biol. Chem. 278 (17): 14926–35. doi:10,1074 / jbc.M300485200. PMID 12594221.
- ^ Honda Y, Tojo M, Matsuzaki K, Anan T, Matsumoto M, Ando M, Saya H, Nakao M (únor 2002). „Spolupráce ubikvitin ligázy hHYD s doménou HECT a proteinu vázajícího DNA topoizomerázu II na reakci poškození DNA“. J. Biol. Chem. 277 (5): 3599–605. doi:10,1074 / jbc.M104347200. PMID 11714696.
Další čtení
- Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H, Kikuno R, Ohara O, Nagase T (2003). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cDNA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
- Nagase T, Ishikawa K, Suyama M, Kikuno R, Hirosawa M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (1999). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (6): 355–64. doi:10.1093 / dnares / 5.6.355. PMID 10048485.
- Deo RC, Sonenberg N, Burley SK (2001). „Rentgenová struktura proteinu lidských hyperplastických disků: ortolog C-terminální domény proteinu vázajícího poly (A)“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (8): 4414–9. doi:10.1073 / pnas.071552198. PMC 31849. PMID 11287654.
- Honda Y, Tojo M, Matsuzaki K, Anan T, Matsumoto M, Ando M, Saya H, Nakao M (2002). „Spolupráce ubikvitin ligázy hHYD s doménou HECT a proteinu vázajícího DNA topoizomerázu II na reakci poškození DNA“. J. Biol. Chem. 277 (5): 3599–605. doi:10,1074 / jbc.M104347200. PMID 11714696.
- Henderson MJ, Russell AJ, Hird S, Muñoz M, Clancy JL, Lehrbach GM, Calanni ST, Jans DA, Sutherland RL, Watts CK (2002). „EDD, protein lidských hyperplastických disků, hraje roli v koaktivaci receptoru progesteronu a potenciálním zapojení do reakce poškození DNA“. J. Biol. Chem. 277 (29): 26468–78. doi:10,1074 / jbc.M203527200. PMID 12011095.
- Eblen ST, Kumar NV, Shah K, Henderson MJ, Watts CK, Shokat KM, Weber MJ (2003). „Identifikace nových substrátů ERK2 pomocí upravené kinázy a analogů ATP“. J. Biol. Chem. 278 (17): 14926–35. doi:10,1074 / jbc.M300485200. PMID 12594221.
- Zhang C, Dowd DR, Staal A, Gu C, Lian JB, van Wijnen AJ, Stein GS, MacDonald PN (2003). „Nukleární koaktivátor-62 kDa / protein interagující s lyží je koaktivátor spojený s jadernou matricí, který může spojovat transkripci zprostředkovanou receptorem vitaminu D a sestřih RNA“. J. Biol. Chem. 278 (37): 35325–36. doi:10,1074 / jbc.M305191200. PMID 12840015.
- Clancy JL, Henderson MJ, Russell AJ, Anderson DW, Bova RJ, Campbell IG, Choong DY, Macdonald GA, Mann GJ, Nolan T, Brady G, Olopade OI, Woollatt E, Davies MJ, Segara D, Hacker NF, Henshall SM , Sutherland RL, Watts CK (2003). „EDD, lidský ortolog hyperplastických disků potlačující gen tumoru, je při rakovině zesílen a nadměrně exprimován“. Onkogen. 22 (32): 5070–81. doi:10.1038 / sj.onc.1206775. PMID 12902990.
- Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (2004). "Funkční proteomika mapující cestu lidské signalizace". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
- Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157.
- Kim JE, Tannenbaum SR, White FM (2005). "Globální fosfoproteom buněk HT-29 humánního adenokarcinomu tlustého střeva". J. Proteome Res. 4 (4): 1339–46. doi:10.1021 / pr050048h. PMID 16083285.
- Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G, Nigg EA, Körner R (2006). „Fosfoproteomová analýza lidského mitotického vřetena“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 103 (14): 5391–6. doi:10.1073 / pnas.0507066103. PMC 1459365. PMID 16565220.
- Henderson MJ, Munoz MA, Saunders DN, Clancy JL, Russell AJ, Williams B, Pappin D, Khanna KK, Jackson SP, Sutherland RL, Watts CK (2007). „EDD zprostředkovává aktivaci CHK2 vyvolanou poškozením DNA“ (PDF). J. Biol. Chem. 281 (52): 39990–40000. doi:10,1074 / jbc.M602818200. PMID 17074762. S2CID 25298222.
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
- Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
externí odkazy
- Ubr5: Přehled bílkovin: Stránky molekul UCSD-Nature
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: O95071 (E3 ubikvitin-protein ligáza UBR5) na PDBe-KB.
![]() | Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |