Karyopherin alfa 1 - Karyopherin alpha 1

KPNA1

Protein KPNA1 PDB 2jdq.png

Dostupné struktury

Hledání ortologu: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
2JDQ, 3TJ3, 4B18

Identifikátory

KPNA1, IPOA5, NPI-1, RCH2, SRP1, Importin, Karyopherin alfa 1, karyoferinová podjednotka alfa 1

Externí ID

OMIM: 600686 MGI: 103560 HomoloGene: 55642 Genové karty: KPNA1

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 3 (lidský)^[1]

Kapela	3q21.1	Start	122,421,902 bp^[1]
Kapela	3q21.1	Konec	122,514,945 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 16 (myš)^[2]

Kapela	16 \| 16 B3	Start	35,978,750 bp^[2]
Kapela	16 \| 16 B3	Konec	36,037,131 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny • vazba sekvence nukleární lokalizace • aktivita signálního receptoru jaderného importu
Buněčná složka	• jaderný pór • nukleoplazma • dendrit • buněčné jádro • cytoplazma • cytosol • hostitelská buňka • GO: 0097483, GO: 0097481 postsynaptická hustota • glutamátergická synapse
Biologický proces	• regulace rekombinace DNA • GO: 0046795 intracelulární transport viru • apoptotická fragmentace DNA • import bílkovin do jádra • transport bílkovin • modulace virem hostitelského procesu • Import proteinů nesoucích NLS do jádra • GO: virový proces 0022415 • postsynapse na jádro signální dráhy
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


3836


16646


ENSG00000114030


ENSMUSG00000022905


P52294


Q60960

RefSeq (mRNA)


NM_002264


NM_008465

RefSeq (protein)


NP_002255


NP_032491

Místo (UCSC)

Chr 3: 122,42 - 122,51 Mb

Chr 16: 35,98 - 36,04 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Importovat podjednotku alfa-1 je protein že u lidí je kódován KPNA1 gen.^[5]

Interakce

Bylo prokázáno, že karyofherin alfa 1 komunikovat s KPNB1^[6]^[7] a UBR5.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000114030 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022905 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Cortes P, Ye ZS, Baltimore D (září 1994). „RAG-1 interaguje s opakovaným aminokyselinovým motivem lidského homologu kvasinkového proteinu SRP1“. Proc Natl Acad Sci U S A. 91 (16): 7633–7. Bibcode:1994PNAS ... 91.7633C. doi:10.1073 / pnas.91.16.7633. PMC 44456. PMID 8052633.
^ Köhler, M; Speck C; Christiansen M; Bischoff FR; Prehn S; Haller H; Görlich D; Hartmann E (listopad 1999). „Důkazy o odlišných substrátových specificitách členů importinové alfa rodiny při importu jaderných proteinů“. Mol. Buňka. Biol. SPOJENÉ STÁTY. 19 (11): 7782–91. doi:10.1128 / mcb.19.11.7782. ISSN 0270-7306. PMC 84838. PMID 10523667.
^ Percipalle, P; Clarkson W D; Kent HM; Rhodes D; Stewart M (březen 1997). "Molekulární interakce mezi importin alfa / beta heterodimerem a proteiny podílejícími se na importu jaderných proteinů obratlovců". J. Mol. Biol. ANGLIE. 266 (4): 722–32. doi:10.1006 / jmbi.1996.0801. ISSN 0022-2836. PMID 9102465.
^ Henderson, Michelle J; Russell Amanda J; Hird Samantha; Muñoz Marcia; Clancy Jennifer L; Lehrbach Gillian M; Calanni Sophina T; Jans David A; Sutherland Robert L; Watts Colin K W (červenec 2002). „EDD, protein lidských hyperplastických disků, hraje roli v koaktivaci receptoru progesteronu a potenciálním zapojení do reakce poškození DNA“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 277 (29): 26468–78. doi:10,1074 / jbc.M203527200. ISSN 0021-9258. PMID 12011095.

Další čtení

Bukrinsky MI, Haffar OK (2004). „Jaderný import HIV-1: při hledání vůdce“. Přední. Biosci. 2 (4): d578–87. doi:10.2741 / A213. PMID 9366553.
Bukrinsky MI, Haffar OK (1998). „Jaderný import HIV-1: maticový protein je zpět v centru pozornosti, tentokrát společně s Vpr“. Mol. Med. 4 (3): 138–43. doi:10.1007 / BF03401911. PMC 2230352. PMID 9562972.
Kino T, Pavlakis GN (2004). „Partnerské molekuly doplňkového proteinu Vpr viru lidské imunodeficience typu 1“. DNA Cell Biol. 23 (4): 193–205. doi:10.1089/104454904773819789. PMID 15142377.
Bukrinsky MI, Sharova N, Dempsey MP a kol. (1992). „Aktivní jaderný import preintegračních komplexů viru lidské imunodeficience typu 1“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 89 (14): 6580–4. Bibcode:1992PNAS ... 89.6580B. doi:10.1073 / pnas.89.14.6580. PMC 49545. PMID 1631159.
Sharova N, Bukrinskaya A (1991). „Prekurzory gag obsahujícího p17 a p17 vstupního viru lidské imunodeficience jsou transportovány do jader infikovaných buněk“. AIDS Res. Hučení. Retroviry. 7 (3): 303–6. doi:10.1089 / podpora.1991.7.303. PMID 2064827.
Di Marzio P, Choe S, Ebright M a kol. (1996). „Mutační analýza zástavy buněčného cyklu, nukleární lokalizace a balení virionů viru lidské imunodeficience typu 1 Vpr“. J. Virol. 69 (12): 7909–16. doi:10.1128 / JVI.69.12.7909-7916.1995. PMC 189735. PMID 7494303.
Gallay P, Swingler S, Song J a kol. (1995). „Jaderný import HIV je řízen vazbou matrice na základní doménu integrázy zprostředkovanou fosfotyrosinem“. Buňka. 83 (4): 569–76. doi:10.1016/0092-8674(95)90097-7. PMID 7585960. S2CID 15536328.
Moroianu J, Hijikata M, Blobel G, Radu A (1995). „Savčí karyoferin alfa 1 beta a alfa 2 beta heterodimery: alfa 1 nebo alfa 2 podjednotka váže signál nukleární lokalizace a beta podjednotka interaguje s nukleoporiny obsahujícími peptidové repetice“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 92 (14): 6532–6. Bibcode:1995PNAS ... 92,6532M. doi:10.1073 / pnas.92.14.6532. PMC 41552. PMID 7604027.
Freed EO, Englund G, Martin MA (1995). „Role základní domény matrice viru lidské imunodeficience typu 1 při makrofágové infekci“. J. Virol. 69 (6): 3949–54. doi:10.1128 / JVI.69.6.3949-3954.1995. PMC 189124. PMID 7745752.
Weis K, Mattaj IW, Lamond AI (1995). "Identifikace hSRP1 alfa jako funkčního receptoru pro nukleární lokalizační sekvence". Věda. 268 (5213): 1049–53. Bibcode:1995Sci ... 268.1049W. doi:10.1126 / science.7754385. PMID 7754385.
O'Neill RE, Palese P (1995). „NPI-1, lidský homolog SRP-1, interaguje s nukleoproteinem viru chřipky“. Virologie. 206 (1): 116–25. doi:10.1016 / S0042-6822 (95) 80026-3. PMID 7831767.
Gallay P, Swingler S, Aiken C, Trono D (1995). „HIV-1 infekce nedělících se buněk: klíčovým regulátorem je C-koncová tyrosinová fosforylace proteinu virové matrice“. Buňka. 80 (3): 379–88. doi:10.1016/0092-8674(95)90488-3. PMID 7859280. S2CID 15064293.
Moroianu J, Blobel G, Radu A (1995). „Dříve identifikovaným proteinem s nejistou funkcí je karyoferin alfa a společně s doky karyoferinu beta importují substrát v komplexech jaderných pórů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 92 (6): 2008–11. Bibcode:1995PNAS ... 92. 2008M. doi:10.1073 / pnas.92.6.2008. PMC 42412. PMID 7892216.
von Schwedler U, Kornbluth RS, Trono D (1994). „Signál nukleární lokalizace matricového proteinu viru lidské imunodeficience typu 1 umožňuje vznik infekce v makrofágech a klidových T lymfocytech“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (15): 6992–6. Bibcode:1994PNAS ... 91.6992V. doi:10.1073 / pnas.91.15.6992. PMC 44324. PMID 8041734.
Heinzinger NK, Bukinsky MI, Haggerty SA a kol. (1994). „Protein Vpr viru lidské imunodeficience typu 1 ovlivňuje nukleární lokalizaci virových nukleových kyselin v nedělících se hostitelských buňkách“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (15): 7311–5. Bibcode:1994PNAS ... 91.7311H. doi:10.1073 / pnas.91.15.7311. PMC 44389. PMID 8041786.
Bukrinsky MI, Haggerty S, Dempsey MP a kol. (1993). "Signál nukleární lokalizace v proteinu matrice HIV-1, který řídí infekci nedělících se buněk". Příroda. 365 (6447): 666–9. Bibcode:1993 Natur.365..666B. doi:10.1038 / 365666a0. PMID 8105392. S2CID 25678.
Dubrovsky L, Ulrich P, Nuovo GJ a kol. (1996). „Signál nukleární lokalizace HIV-1 jako nový cíl terapeutické intervence“. Mol. Med. 1 (2): 217–30. doi:10.1007 / BF03401569. PMC 2229944. PMID 8529100.
Gallay P, Stitt V, Mundy C a kol. (1996). „Role dráhy karyofherinu v jaderném importu viru lidské imunodeficience typu 1“. J. Virol. 70 (2): 1027–32. doi:10.1128 / JVI.70.2.1027-1032.1996. PMC 189908. PMID 8551560.
Bukrinskaya AG, Ghorpade A, Heinzinger NK a kol. (1996). „Infekce virem lidské imunodeficience typu 1 závislá na fosforylaci a nukleární cílení virové DNA“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (1): 367–71. Bibcode:1996PNAS ... 93..367B. doi:10.1073 / pnas.93.1.367. PMC 40239. PMID 8552640.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.