UBE4B - UBE4B - Wikipedia

UBE4B
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2KRE, 3L1X, 3L1Z
Identifikátory
Aliasy	UBE4B, E4, HDNB1, UBOX3, UFD2, UFD2A, ubikvitinační faktor E4B
Externí ID	OMIM: 613565 MGI: 1927086 HomoloGene: 107623 Genové karty: UBE4B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	10,181,239 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	149,426,749 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • Vazba ATPázy; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • vazba enzymu; • ATP vazba; • aktivita transferázy; • aktivita ubikvitin-ubikvitin ligázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• komplex ubikvitin ligázy; • buněčné jádro; • cytoplazma;
Biologický proces	• buněčný proteinový katabolický proces; • monoubikvitinace bílkovin; • reakce na stres endoplazmatického retikula; • komorová trabekula morfogeneze myokardu; • ubikvitinace bílkovin; • vývoj neuronové projekce; • apoptotická signální dráha zprostředkovaná granzymem; • reakce na UV; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • autoubiquitination bílkovin; • polyubikvitinace bílkovin; • cesta ERAD závislá na ubikvitinu; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10277
	63958
	ENSG00000130939
	ENSMUSG00000028960
	O95155
	Q9ES00
	NM_001105562; NM_006048
	NM_022022
	NP_001099032; NP_006039
	NP_071305
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Konjugační faktor ubikvitinu E4 B je protein že u lidí je kódován UBE4B gen.^[5]^[6]^[7]

Modifikace proteinů pomocí ubikvitin je důležitý buněčný mechanismus pro zacílení na degradaci abnormálních nebo krátkodobých proteinů. Ubikvitinace zahrnuje nejméně tři třídy enzymů: enzymy aktivující ubikvitin nebo E1s, enzymy konjugující s ubikvitinem nebo E2s a ubikvitin-proteinové ligázy nebo E3s.

Tento gen kóduje další konjugační faktor, E4, který se podílí na sestavení řetězce multiubiquitinů. Tento gen je také nejsilnějším kandidátem v USA neuroblastom geny potlačující nádory.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000130939 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028960 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (prosinec 1998). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. X. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro". DNA Res. 5 (3): 169–76. doi:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID 9734811.
^ Koegl M, Hoppe T, Schlenker S, Ulrich HD, Mayer TU, Jentsch S (duben 1999). „Nový ubikvitinační faktor, E4, je zapojen do sestavování řetězce multiubiquitinů“. Buňka. 96 (5): 635–44. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80574-7. PMID 10089879.
^ ^A ^b „Entrez Gene: UBE4B ubikvitinační faktor E4B (homolog UFD2, kvasnice)“.

Další čtení

Onyango P, Lubyova B, Gardellin P a kol. (1998). "Molekulární klonování a analýza exprese pěti nových genů v chromozomu 1p36". Genomika. 50 (2): 187–98. doi:10.1006 / geno.1997.5186. PMID 9653645.
Ohira M, Kageyama H, Mihara M a kol. (2000). "Identifikace a charakterizace 500 kb homozygotně odstraněné oblasti na 1p36.2-p36.3 v buněčné linii neuroblastomu". Onkogen. 19 (37): 4302–7. doi:10.1038 / sj.onc.1203786. PMID 10980605.
Mahoney JA, Odin JA, White SM a kol. (2002). „Lidský homolog kvasinkového polyubikvitinačního faktoru Ufd2p je během apoptózy štěpen kaspázou 6 a granzymem B“. Biochem. J. 361 (Pt 3): 587–95. doi:10.1042/0264-6021:3610587. PMC 1222341. PMID 11802788.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Kaneko C, Hatakeyama S, Matsumoto M a kol. (2003). "Charakterizace myšího genu pro ubikvitin ligázu typu U-box typu UFD2a". Biochem. Biophys. Res. Commun. 300 (2): 297–304. doi:10.1016 / S0006-291X (02) 02834-6. PMID 12504083.
Krona C, Ejeskär K, Abel F a kol. (2003). "Screening na genové mutace v 500 kb oblasti potlačující nádor neuroblastomu v chromozomu 1p; mutace a fázově specifická exprese v UBE4B / UFD2". Onkogen. 22 (15): 2343–51. doi:10.1038 / sj.onc.1206324. PMID 12700669.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Okumura F, Hatakeyama S, Matsumoto M a kol. (2005). „Funkční regulace FEZ1 pomocí ubikvitin ligázy typu U-box typu E4B přispívá k neuritogenezi“. J. Biol. Chem. 279 (51): 53533–43. doi:10,1074 / jbc.M402916200. PMID 15466860.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE a kol. (2006). „Sekvence DNA a biologická anotace lidského chromozomu 1“. Příroda. 441 (7091): 315–21. doi:10.1038 / nature04727. PMID 16710414.
Spinette S, Mahoney JA, Rosen A (2006). „MPAC doména je nová mitoticky regulovaná doména, odstraněná štěpením apoptotickou proteázou během buněčné smrti“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 347 (4): 1103–12. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.06.194. PMID 16870146.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.

externí odkazy

UBE4B umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
UBE4B podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000130939 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028960 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9734811-5] Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (prosinec 1998). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. X. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro". DNA Res. 5 (3): 169–76. doi:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID 9734811.

[pmid10089879-6] Koegl M, Hoppe T, Schlenker S, Ulrich HD, Mayer TU, Jentsch S (duben 1999). „Nový ubikvitinační faktor, E4, je zapojen do sestavování řetězce multiubiquitinů“. Buňka. 96 (5): 635–44. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80574-7. PMID 10089879.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: UBE4B ubikvitinační faktor E4B (homolog UFD2, kvasnice)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]