UBE4A - UBE4A

UBE4A
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1 WGM
Identifikátory
Aliasy	UBE4A, E4, UBOX2, UFD2, ubikvitinační faktor E4A
Externí ID	OMIM: 603753 MGI: 2154580 HomoloGene: 3517 Genové karty: UBE4A
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	118,399,211 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	44,965,600 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita ubikvitin-protein transferázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita transferázy; • aktivita ubikvitin-ubikvitin ligázy;
Buněčná složka	• komplex ubikvitin ligázy; • buněčné jádro; • cytoplazma;
Biologický proces	• ubikvitinace bílkovin; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • cesta ERAD závislá na ubikvitinu; • polyubikvitinace bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9354
	140630
	ENSG00000110344
	ENSMUSG00000059890
	Q14139
	E9Q735
	NM_004788; NM_001204077
	NM_145400; NM_001346698; NM_001361075; NM_001361076
	NP_001191006; NP_004779
	NP_001333627; NP_663375; NP_001348004; NP_001348005
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Konjugační faktor ubikvitinu E4 A je protein že u lidí je kódován UBE4A gen.^[5]^[6]

Modifikace proteinů pomocí ubikvitin je důležitý buněčný mechanismus pro zacílení abnormálních nebo krátkodobých proteinů na degradaci.

Ubikvitinace zahrnuje nejméně tři třídy enzymů: enzymy aktivující ubikvitin nebo E1s, enzymy konjugující s ubikvitinem nebo E2s a ubikvitin-proteinové ligázy nebo E3s. Tento gen kóduje další konjugační faktor, E4, který se podílí na sestavení řetězce multiubiquitinů.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110344 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000059890 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Koegl M, Hoppe T, Schlenker S, Ulrich HD, Mayer TU, Jentsch S (duben 1999). „Nový ubikvitinační faktor, E4, je zapojen do sestavování řetězce multiubiquitinů“. Buňka. 96 (5): 635–44. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80574-7. PMID 10089879.
^ ^A ^b „Entrez Gene: UBE4A ubikvitinační faktor E4A (homolog UFD2, kvasnice)“.

Další čtení

Robertson NG, Khetarpal U, Gutiérrez-Espeleta GA a kol. (1995). „Izolace nových a známých genů z knihovny lidského kochleárního cDNA pomocí subtraktivní hybridizace a diferenciálního screeningu“. Genomika. 23 (1): 42–50. doi:10.1006 / geno.1994.1457. PMID 7829101.
Nagase T, Seki N, Tanaka A a kol. (1996). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. IV. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0121-KIAA0160) odvozené analýzou cDNA klonů z lidské buněčné linie KG-1“. DNA Res. 2 (4): 167–74, 199–210. doi:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID 8590280.
Mahoney JA, Odin JA, White SM a kol. (2002). „Lidský homolog kvasinkového polyubikvitinačního faktoru Ufd2p je během apoptózy štěpen kaspázou 6 a granzymem B“. Biochem. J. 361 (Pt 3): 587–95. doi:10.1042/0264-6021:3610587. PMC 1222341. PMID 11802788.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gevaert K, Goethals M, Martens L a kol. (2004). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Contino G, Amati F, Pucci S a kol. (2004). „Expresní analýza genu kódujícího ubikvitin ligázu typu U-box typu UBE4A v lidských tkáních“. Gen. 328: 69–74. doi:10.1016 / j.gene.2003.11.017. PMID 15019985.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Spinette S, Lengauer C, Mahoney JA a kol. (2006). „Ufd2, nový autoantigen ve sklerodermii, reguluje separaci sesterských chromatid“. Buněčný cyklus. 3 (12): 1638–44. doi:10,4161 / cc.3.12.1345. PMID 15611659.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000110344 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000059890 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10089879-5] Koegl M, Hoppe T, Schlenker S, Ulrich HD, Mayer TU, Jentsch S (duben 1999). „Nový ubikvitinační faktor, E4, je zapojen do sestavování řetězce multiubiquitinů“. Buňka. 96 (5): 635–44. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80574-7. PMID 10089879.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: UBE4A ubikvitinační faktor E4A (homolog UFD2, kvasnice)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]