Regulátor prodloužení transkripce 1 - Transcription elongation regulator 1
Regulátor prodloužení transkripce 1, také známý jako TCERG1, je protein který je u lidí kódován TCERG1 gen.[5][6][7]
Funkce
Tento gen kóduje jaderný protein, který reguluje transkripční prodloužení a pre-mRNA sestřih. Kódovaný protein interaguje s hyperfosforylovaným C-terminál doména z RNA polymeráza II prostřednictvím více FF domén a s faktorem sestřihu pre-mRNA SF1 přes WW doménu. Výsledkem alternativního sestřihu je více variant transkriptů kódujících různé izoformy.[5]
Interakce
Bylo prokázáno, že regulátor 1 prodloužení transkripce komunikovat s SF1[8] a POLR2A.[9]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000113649 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024498 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b "Entrez Gene: TCERG1 regulátor prodloužení transkripce 1".
- ^ Suñé C, Hayashi T, Liu Y, Lane WS, Young RA, Garcia-Blanco MA (říjen 1997). „CA150, jaderný protein spojený s holoenzymem RNA polymerázy II, je zapojen do transkripce viru lidské imunodeficience typu 1 aktivovaného Tat“. Molekulární a buněčná biologie. 17 (10): 6029–39. doi:10.1128 / MCB.17.10.6029. PMC 232452. PMID 9315662.
- ^ Bohne J, Cole SE, Suñe C, Lindman BR, Ko VD, Vogt TF, Garcia-Blanco MA (říjen 2000). "Expresní analýza a mapování myšího a lidského transkripčního regulátoru CA150". Savčí genom. 11 (10): 930–3. doi:10,1007 / s003350010162. PMID 11003711. S2CID 2396234.
- ^ Goldstrohm, AC; Albrecht TR; Suñé C; Bedford MT; Garcia-Blanco M A (listopad 2001). „Faktor pro prodloužení transkripce CA150 interaguje s RNA polymerázou II a faktorem sestřihu pre-mRNA SF1“. Mol. Buňka. Biol. 21 (22): 7617–28. doi:10.1128 / MCB.21.22.7617-7628.2001. ISSN 0270-7306. PMC 99933. PMID 11604498.
- ^ Carty, SM; Goldstrohm A C; Suñé C; Garcia-Blanco MA; Greenleaf A L (srpen 2000). „Moduly pro interakci proteinů, které organizují jadernou funkci: FF domény CA150 vážou fosfoCTD RNA polymerázy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97 (16): 9015–20. Bibcode:2000PNAS ... 97.9015C. doi:10.1073 / pnas.160266597. ISSN 0027-8424. PMC 16813. PMID 10908677.
Další čtení
- Suñé C, Hayashi T, Liu Y a kol. (1997). „CA150, jaderný protein spojený s holoenzymem RNA polymerázy II, je zapojen do transkripce viru lidské imunodeficience typu 1 aktivovaného Tat“. Mol. Buňka. Biol. 17 (10): 6029–39. doi:10.1128 / MCB.17.10.6029. PMC 232452. PMID 9315662.
- Neubauer G, král A, Rappsilber J a kol. (1998). „Hmotnostní spektrometrie a vyhledávání v databázi EST umožňuje charakterizaci komplexu víceproteinových spliceosomů“. Nat. Genet. 20 (1): 46–50. doi:10.1038/1700. PMID 9731529. S2CID 585778.
- Suñé C, Garcia-Blanco MA (1999). „Transkripční kofaktor CA150 reguluje prodloužení RNA polymerázy II způsobem závislým na TATA-boxu“. Mol. Buňka. Biol. 19 (7): 4719–28. doi:10.1128 / MCB.19.7.4719. PMC 84270. PMID 10373521.
- Carty SM, Goldstrohm AC, Suñé C a kol. (2000). „Moduly pro interakci proteinů, které organizují jadernou funkci: FF domény CA150 vážou fosfoCTD RNA polymerázy II“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (16): 9015–20. Bibcode:2000PNAS ... 97.9015C. doi:10.1073 / pnas.160266597. PMC 16813. PMID 10908677.
- Bohne J, Cole SE, Suñe C a kol. (2000). "Expresní analýza a mapování myšího a lidského transkripčního regulátoru CA150". Mamm. Genom. 11 (10): 930–3. doi:10,1007 / s003350010162. PMID 11003711. S2CID 2396234.
- Holbert S, Denghien I, Kiechle T a kol. (2001). „Transkripční aktivátor opakování Gln-Ala CA150 interaguje s huntingtinem: neuropatologické a genetické důkazy o roli v patogenezi Huntingtonovy choroby“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 98 (4): 1811–6. doi:10.1073 / pnas.041566798. PMC 29339. PMID 11172033.
- Goldstrohm AC, Albrecht TR, Suñé C a kol. (2001). „Faktor pro prodloužení transkripce CA150 interaguje s RNA polymerázou II a faktorem sestřihu pre-mRNA SF1“. Mol. Buňka. Biol. 21 (22): 7617–28. doi:10.1128 / MCB.21.22.7617-7628.2001. PMC 99933. PMID 11604498.
- Zhou Z, Licklider LJ, Gygi SP, Reed R (2002). "Komplexní proteomická analýza lidského spliceosomu". Příroda. 419 (6903): 182–5. Bibcode:2002 Natur.419..182Z. doi:10.1038 / nature01031. PMID 12226669. S2CID 4372405.
- Carty SM, Greenleaf AL (2003). „Hyperfosforylované C-koncové domény opakující se s doménou v transkripci vazby nukleárního proteomu na modifikaci DNA / chromatinu a zpracování RNA“. Mol. Buňka. Proteomika. 1 (8): 598–610. doi:10,1074 / mcp.M200029-MCP200. PMID 12376575.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Chattopadhyay B, Ghosh S, Gangopadhyay PK a kol. (2003). „Modulace věku při nástupu Huntingtonovy choroby a pacientů s spinocerebelární ataxií typu 2 pocházela z východní Indie“. Neurosci. Lett. 345 (2): 93–6. doi:10.1016 / S0304-3940 (03) 00436-1. PMID 12821179. S2CID 33727221.
- Reuter TY, Medhurst AL, Waisfisz Q a kol. (2003). „Kvasinkové dvouhybridní testy naznačují účast proteinů anémie Fanconi na regulaci transkripce, buněčné signalizaci, oxidačním metabolismu a buněčném transportu“. Exp. Cell Res. 289 (2): 211–21. doi:10.1016 / S0014-4827 (03) 00261-1. PMID 14499622.
- Palancade B, Marshall NF, Tremeau-Bravard A, et al. (2004). „Defosforylace RNA polymerázy II pomocí CTD-fosfatázy FCP1 je inhibována proteiny asociovanými s fosfo-CTD“. J. Mol. Biol. 335 (2): 415–24. doi:10.1016 / j.jmb.2003.10.036. PMID 14672652.
- Nagel JE, Smith RJ, Shaw L a kol. (2005). "Identifikace genů odlišně exprimovaných v T buňkách po stimulaci chemokiny CXCL12 a CXCL10". BMC Immunol. 5: 17. doi:10.1186/1471-2172-5-17. PMC 514893. PMID 15296517.
- Goehler H, Lalowski M, Stelzl U a kol. (2004). „Síť proteinových interakcí spojuje GIT1, zesilovač agregace huntingtinu, s Huntingtonovou chorobou“. Mol. Buňka. 15 (6): 853–65. doi:10.1016 / j.molcel.2004.09.016. PMID 15383276.
- Lin KT, Lu RM, Tarn WY (2004). „Proteiny obsahující WW doménu interagují s časným spliceosomem a účastní se sestřihu pre-mRNA in vivo“. Mol. Buňka. Biol. 24 (20): 9176–85. doi:10.1128 / MCB.24.20.9176-9185.2004. PMC 517884. PMID 15456888.
- Smith MJ, Kulkarni S, Pawson T (2004). „FF domény CA150 váží transkripční a sestřihové faktory prostřednictvím několika slabých interakcí“. Mol. Buňka. Biol. 24 (21): 9274–85. doi:10.1128 / MCB.24.21.9274-9285.2004. PMC 522232. PMID 15485897.
- Andersen JS, Lam YW, Leung AK a kol. (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. Bibcode:2005 Natur.433 ... 77A. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
- McFie PJ, Wang GL, Timchenko NA a kol. (2006). „Identifikace korepresoru, který inhibuje transkripční aktivity a aktivity zastavující růst CCAAT / protein vázající enhancer alfa“. J. Biol. Chem. 281 (26): 18069–80. doi:10,1074 / jbc.M512734200. PMID 16644732.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |