Transaktivující crRNA - Trans-activating crRNA

v molekulární biologie, trans-aktivující Crispr RNA (tracrRNA) je malý transkódované RNA. Poprvé byl objeven v člověk patogen Streptococcus pyogenes.[1] v bakterie a archaea; CRISPR -Cas (seskupené, pravidelně rozložené krátké palindromické repetice / proteiny spojené s CRISPR) tvoří obranný systém zprostředkovaný RNA, který chrání před viry a plazmidy. Tato obranná cesta má tři kroky. Nejprve kopie napadení nukleová kyselina je integrován do CRISPR místo. Dále CRISPR RNA (crRNA ) jsou přepsal z tohoto lokusu CRISPR. CrRNA jsou poté začleněny do efektoru komplexy kde crRNA vede komplex k napadající nukleové kyselině a proteiny Cas tuto nukleovou kyselinu degradují.[2] Existuje několik podtypů systému CRISPR.

Systémy CRISPR-Cas typu II vyžadují tracrRNA, která hraje roli při zrání crRNA.[3]TracrRNA je částečně komplementární do a základní páry s pre-crRNA tvořící RNA duplex. To štěpí RNáza III, specifický pro RNA ribonukleáza, aby se vytvořil hybrid crRNA / tracrRNA. Tento hybrid funguje jako vodítko pro endonukleáza Cas9, který štěpí invazní nukleovou kyselinu.[1][4][5]

Viz také

Reference

  1. ^ A b Deltcheva E, Chylinski K, Sharma CM, Gonzales K, Chao Y, Pirzada ZA a kol. (2011). „Maturace CRISPR RNA trans-kódovanou malou RNA a hostitelským faktorem RNázou III“. Příroda. 471 (7340): 602–607. Bibcode:2011Natur.471..602D. doi:10.1038 / nature09886. PMC  3070239. PMID  21455174.
  2. ^ Terns MP, Terns RM (2011). „Adaptivní imunitní systémy založené na CRISPR“. Curr Opin Microbiol. 14 (3): 321–327. doi:10.1016 / j.mib.2011.03.005. PMC  3119747. PMID  21531607.
  3. ^ Charpentier E, Richter H, van der Oost J, White MF (2015). „Dráhy biogeneze průvodců RNA v archaální a bakteriální adaptivní imunitě CRISPR-Cas“. Recenze mikrobiologie FEMS. 39 (3): 428–441. doi:10.1093 / femsre / fuv023. PMC  5965381. PMID  25994611.
  4. ^ Jinek M, Chylinski K, Fonfara I, Hauer M, Doudna JA, Charpentier E (2012). „Programovatelná endonukleáza DNA vedená duální RNA v adaptivní bakteriální imunitě“. Věda. 337 (6096): 816–821. Bibcode:2012Sci ... 337..816J. doi:10.1126 / science.1225829. PMC  6286148. PMID  22745249.
  5. ^ Brouns SJ (2012). "Švýcarský armádní nůž s imunitou". Věda. 337 (6096): 808–809. Bibcode:2012Sci ... 337..808B. doi:10.1126 / science.1227253. PMID  22904002.

Další čtení