TRIL (gen) - TRIL (gene) - Wikipedia

TRIL
Identifikátory
Aliasy	TRILInteraktor KIAA0644, TLR4 s opakováními bohatými na leucin
Externí ID	OMIM: 613356 MGI: 1914123 HomoloGene: 69404 Genové karty: TRIL
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	28,958,330 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	53,820,830 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vázání lipopolysacharidů;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • komplex lipopolysacharidového receptoru; • membrána; • extracelulární; • extracelulární matrix;
Biologický proces	• regulace produkce cytokinů podílející se na imunitní odpovědi; • vrozený imunitní systém; • zánětlivá reakce; • signální dráha podobná mýtnému receptoru 4; • proces imunitního systému;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9865
	66873
	ENSG00000255690
	ENSMUSG00000043496
	Q7L0X0
	Q9DBY4
	NM_014817
	NM_025817
	NP_055632
	NP_080093
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

KIAA0644, také známý jako TRIL nebo Interaktor TLR4 s opakováními bohatými na leucin, je protein že u lidí je kódován KIAA0644 gen.^[5]

Funkce

Přesná funkce KIAA0644 není známa. Je však členem opakování bohaté na leucin rodina proteinů, o nichž je známo, že se účastní interakcí protein-protein. Je známo, že tento protein interaguje s TLR4 protein.

TRIL je součástí TLR4 komplex a je indukován v řadě typů buněk lipopolysacharid (LPS).^[6]

Sekvence proteinů

Hlavní izoforma lidského proteinu je 811 amino dlouhá a je složena převážně z leucinu (17%), alaninu a argininu (~ 10%) a glycinových (~ 8,5%) zbytků. Předpokládá se, že proteinová sekvence se skládá převážně z α-šroubovice a pár β-list

Homologie

KIAA0644 je mezi savci dobře konzervovaná, ale lze ji nalézt ve všech strunatcích s nižší sekvenční identitou.

Genové sousedství

Gen KIAA0644 sousedí s genem mRNA-cAMP reagujícím na element navazujícím a mRNA karboxypeptidázou a serin karboxypeptidázovým genem proti směru ^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000255690 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000043496 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: TRIL TLR4 interagující s opakováním bohatým na leucin“. Citováno 13. května 2010.
^ Carpenter S, Carlson T, Dellacasagrande J, Garcia A, Gibbons S, Hertzog P, Lyons A, Lin LL, Lynch M, Monie T, Murphy C, Seidl KJ, Wells C, Dunne A, O'Neill LA (září 2009) . „TRIL, funkční složka signalizačního komplexu TLR4, vysoce exprimovaná v mozku“. J. Immunol. 183 (6): 3989–3995. doi:10,4049 / jimmunol.0901518. PMID 19710467.
^ „NCBI Entrez“. Citováno 13. května 2010.
^ Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (červen 1998). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. X. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (3): 169–176. doi:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID 9734811.

Další čtení

Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2002). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–16903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR a kol. (2003). „Human Chromosome 7: DNA Sequence and Biology“. Věda. 300 (5620): 767–772. doi:10.1126 / science.1083423. PMC 2882961. PMID 12690205.
Büssow K, Cahill D, Nietfeld W a kol. (1998). „Metoda pro globální expresi proteinů a screening protilátek na filtrech s vysokou hustotou uspořádané knihovny cDNA“. Nucleic Acids Res. 26 (21): 5007–5008. doi:10.1093 / nar / 26.21.5007. PMC 147919. PMID 9776767.
Wheeler HE, Metter EJ, Tanaka T a kol. (2009). Gibson G (ed.). „Sekvenční použití profilování transkripce, kvantitativní mapování znaků exprese a asociace genů implikuje MMP20 při stárnutí lidské ledviny“. PLOS Genet. 5 (10): e1000685. doi:10.1371 / journal.pgen.1000685. PMC 2752811. PMID 19834535.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000255690 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000043496 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: TRIL TLR4 interagující s opakováním bohatým na leucin“. Citováno 13. května 2010.

[pmid19710467-6] Carpenter S, Carlson T, Dellacasagrande J, Garcia A, Gibbons S, Hertzog P, Lyons A, Lin LL, Lynch M, Monie T, Murphy C, Seidl KJ, Wells C, Dunne A, O'Neill LA (září 2009) . „TRIL, funkční složka signalizačního komplexu TLR4, vysoce exprimovaná v mozku“. J. Immunol. 183 (6): 3989–3995. doi:10,4049 / jimmunol.0901518. PMID 19710467.

[Gene_Neighborhood-7] „NCBI Entrez“. Citováno 13. května 2010.

[pmid9734811-8] Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (červen 1998). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. X. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro“. DNA Res. 5 (3): 169–176. doi:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID 9734811.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]