TRAK2 - TRAK2

TRAK2
Identifikátory
Aliasy	TRAK2, ALS2CR3, CALS-C, GRIF-1, GRIF1, MILT2, OIP98, přenos kinesinového proteinu 2
Externí ID	OMIM: 607334 MGI: 1918077 HomoloGene: 22861 Genové karty: TRAK2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	201,451,500 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	58,973,430 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na receptory; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba na receptor GABA; • kinesinová vazba; • Vazba domény TPR; • vazba enzymu; • vazba myosinu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • endozom; • buněčná membrána; • časný endosom; • mitochondrie; • buněčné jádro; • dendritová cytoplazma; • dendrit; • neuronová projekce; • tělo neuronových buněk; • axonální růstový kužel; • cytoplazmatický váček; • axonová cytoplazma;
Biologický proces	• regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • cílení na bílkoviny; • glykosylace vázaná na protein O; • anterográdní dendritický transport mitochondrií; • transport endosomu k lysozomu; • dendritická morfogeneze; • negativní regulace axonogeneze; • dendritický transport mitochondrií; • anterográdní axonální transport; • lokalizace bílkovin; • neurogeneze; • transport vezikul podél mikrotubulů; • distribuce mitochondrií; • anterográdní axonální transport mitochondrií;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	66008
	70827
	ENSG00000115993
	ENSMUSG00000026028
	O60296
	n / a
	NM_015049
	NM_172406
	NP_055864
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Obchodování s proteinem vázajícím kinesin 2 je protein že u lidí je kódován TRAK2 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

Ukázalo se, že TRAK2 komunikovat s Kir2.1^[8] a GABRB2.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115993 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026028 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hadano S, Yanagisawa Y, Skaug J, Fichter K, Nasir J, Martindale D, Koop BF, Scherer SW, Nicholson DW, Rouleau GA, Ikeda J, Hayden MR (leden 2001). „Klonování a charakterizace tří nových genů, ALS2CR1, ALS2CR2 a ALS2CR3, v kritické oblasti juvenilní amyotrofické laterální sklerózy (ALS2) na chromozomu 2q33-q34: kandidátské geny pro ALS2“. Genomika. 71 (2): 200–13. doi:10,1006 / geno.2000.6392. PMID 11161814.
^ Gilbert SL, Zhang L, Forster ML, Anderson JR, Iwase T, Soliven B, Donahue LR, Sweet HO, Bronson RT, Davisson MT, Wollmann RL, Lahn BT (únor 2006). „Mutace Trak1 narušuje homeostázu receptoru GABA (A) u hypertonických myší“. Genetika přírody. 38 (2): 245–50. doi:10.1038 / ng1715. PMID 16380713. S2CID 20231963.
^ „Entrez Gene: TRAK2 trafficking protein, kinesin binding 2“.
^ Grishin A, Li H, Levitan ES, Zaks-Makhina E (říjen 2006). „Identifikace faktoru 1 (TRAK2) interagujícího s receptorem gama-aminomáselné jako faktoru přenosu pro kanál K + Kir2.1“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (40): 30104–11. doi:10,1074 / jbc.M602439200. PMID 16895905.
^ Beck M, Brickley K, Wilkinson HL, Sharma S, Smith M, Chazot PL, Pollard S, Stephenson FA (srpen 2002). „Identifikace, molekulární klonování a charakterizace nového proteinu spojeného s receptorem GABAA, GRIF-1“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (33): 30079–90. doi:10,1074 / jbc.M200438200. PMID 12034717.

Další čtení

Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (únor 1998). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. IX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro". Výzkum DNA. 5 (1): 31–9. doi:10.1093 / dnares / 5.1.31. PMID 9628581.
Machado RD, Pauciulo MW, Fretwell N, Veal C, Thomson JR, Vilariño Güell C, Aldred M, Brannon CA, Trembath RC, Nichols WC (září 2000). "Fyzická a přepisová mapa založená na upřesnění kritického intervalu pro PPH1, gen pro familiární primární plicní hypertenzi. Mezinárodní konsorcium PPH". Genomika. 68 (2): 220–8. doi:10,1006 / geno.2000.6291. PMID 10964520.
Beck M, Brickley K, Wilkinson HL, Sharma S, Smith M, Chazot PL, Pollard S, Stephenson FA (srpen 2002). „Identifikace, molekulární klonování a charakterizace nového proteinu spojeného s receptorem GABAA, GRIF-1“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (33): 30079–90. doi:10,1074 / jbc.M200438200. PMID 12034717.
Iyer SP, Akimoto Y, Hart GW (únor 2003). „Identifikace a klonování nové rodiny proteinů domény coiled-coil, které interagují s O-GlcNAc transferázou“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (7): 5399–409. doi:10,1074 / jbc.M209384200. PMID 12435728.
Brickley K, Smith MJ, Beck M, Stephenson FA (duben 2005). „GRIF-1 a OIP106, členové nové genové rodiny proteinů domény coiled-coil: asociace in vivo a in vitro s kinesinem“. The Journal of Biological Chemistry. 280 (15): 14723–32. doi:10,1074 / jbc.M409095200. PMID 15644324.
Fransson S, Ruusala A, Aspenström P (červen 2006). „Atypické Rho GTPasy Miro-1 a Miro-2 mají zásadní roli v mitochondriálním obchodování.“ Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 344 (2): 500–10. doi:10.1016 / j.bbrc.2006.03.163. PMID 16630562.
Smith MJ, Pozo K, Brickley K, Stephenson FA (září 2006). „Mapování vazebné domény GRIF-1 kinesinu, KIF5C, potvrzuje roli GRIF-1 jako adaptačního proteinu v anterográdním obchodování s nákladem“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (37): 27216–28. doi:10,1074 / jbc.M600522200. PMID 16835241.
Grishin A, Li H, Levitan ES, Zaks-Makhina E (říjen 2006). „Identifikace faktoru 1 (TRAK2) interagujícího s receptorem gama-aminomáselné jako faktoru přenosu pro kanál K + Kir2.1“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (40): 30104–11. doi:10,1074 / jbc.M602439200. PMID 16895905.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115993 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026028 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11161814-5] Hadano S, Yanagisawa Y, Skaug J, Fichter K, Nasir J, Martindale D, Koop BF, Scherer SW, Nicholson DW, Rouleau GA, Ikeda J, Hayden MR (leden 2001). „Klonování a charakterizace tří nových genů, ALS2CR1, ALS2CR2 a ALS2CR3, v kritické oblasti juvenilní amyotrofické laterální sklerózy (ALS2) na chromozomu 2q33-q34: kandidátské geny pro ALS2“. Genomika. 71 (2): 200–13. doi:10,1006 / geno.2000.6392. PMID 11161814.

[pmid16380713-6] Gilbert SL, Zhang L, Forster ML, Anderson JR, Iwase T, Soliven B, Donahue LR, Sweet HO, Bronson RT, Davisson MT, Wollmann RL, Lahn BT (únor 2006). „Mutace Trak1 narušuje homeostázu receptoru GABA (A) u hypertonických myší“. Genetika přírody. 38 (2): 245–50. doi:10.1038 / ng1715. PMID 16380713. S2CID 20231963.

[entrez-7] „Entrez Gene: TRAK2 trafficking protein, kinesin binding 2“.

[pmid16895905-8] Grishin A, Li H, Levitan ES, Zaks-Makhina E (říjen 2006). „Identifikace faktoru 1 (TRAK2) interagujícího s receptorem gama-aminomáselné jako faktoru přenosu pro kanál K + Kir2.1“. The Journal of Biological Chemistry. 281 (40): 30104–11. doi:10,1074 / jbc.M602439200. PMID 16895905.

[pmid12034717-9] Beck M, Brickley K, Wilkinson HL, Sharma S, Smith M, Chazot PL, Pollard S, Stephenson FA (srpen 2002). „Identifikace, molekulární klonování a charakterizace nového proteinu spojeného s receptorem GABAA, GRIF-1“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (33): 30079–90. doi:10,1074 / jbc.M200438200. PMID 12034717.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]