TMPRSS2 - TMPRSS2

TMPRSS2
Identifikátory
Aliasy	TMPRSS2„PP9284, PRSS10, transmembránová proteáza, serin 2, transmembránová serinová proteáza 2
Externí ID	OMIM: 602060 MGI: 1354381 HomoloGene: 4136 Genové karty: TMPRSS2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 21 (lidský)
Konec	41,531,116 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 16 (myš)
Konec	97,611,195 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita zachycovacího receptoru; • aktivita peptidázy; • aktivita peptidázy serinového typu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita hydrolázy; • aktivita endopeptidázy serinového typu;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • extracelulární oblast; • buněčná membrána; • integrální součást plazmatické membrány; • extracelulární exosom; • membrána;
Biologický proces	• pozitivní regulace vstupu viru do hostitelské buňky; • automatické zpracování bílkovin; • receptorem zprostředkovaná endocytóza; • proteolýza; • transport zprostředkovaný vezikuly; • endocytóza;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7113
	50528
	ENSG00000184012
	ENSMUSG00000000385
	O15393
	Q9JIQ8
	NM_001135099; NM_005656; NM_001382720
	NM_015775
	NP_001128571; NP_005647; NP_001369649
	NP_056590
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Transmembránová proteáza, serin 2 je enzym že u lidí je kódován TMPRSS2 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje protein, který patří do serinová proteáza rodina. Kódovaný protein obsahuje transmembránu typu II doména, doména třídy A receptoru, vychytávací receptor bohatá na cysteiny a doména proteázy. Je známo, že serinové proteázy se účastní mnoha fyziologických a patologických procesů. Ukázalo se, že tento gen je up-regulován androgenními hormony v rakovina prostaty buňky a dolů regulované rakovina prostaty nezávislá na androgenech tkáň. Předpokládá se, že proteázová doména tohoto proteinu je štěpena a vylučována do buněčného média po autokleavaci. Biologická funkce tohoto genu není známa.^[6]

Fúze genu ERG

Funkce proteinu TMPRSS2 v karcinogenezi prostaty závisí na nadměrné expresi Transkripční faktory ETS, jako ERG a ETV1, přes genová fúze. Fúzní gen TMPRSS2-ERG je nejčastější a je přítomen u 40% - 80% karcinomů prostaty u lidí. Nadměrná exprese ERG přispívá k rozvoji nezávislosti na androgenu u rakoviny prostaty narušením androgenní receptor signalizace.^[7]

Vztah ke koronavirům

Některé koronaviry, např. oba SARS koronavirus z roku 2003 a SARS-CoV-2 jsou aktivovány TMPRSS2 a mohou tak být inhibovány inhibitory TMPRSS2.^[8]^[9] "SARS-CoV-2 používá receptor SARS-CoV ACE2 pro vstup a serinová proteáza TMPRSS2 pro aktivaci S proteinem^[10]. Inhibitor TMPRSS2 schválený pro klinické použití zablokoval vstup a mohl by představovat možnost léčby. “^[9] Jeden experimentální kandidát jako inhibitor TMPRSS2 pro potenciální použití jak proti chřipce, tak proti koronavirovým infekcím obecně, včetně těch před příchodem COVID-19, je OTC (ve většině zemí) mukolytický lék proti kašli bromhexin,^[11] který je také zkoumán jako možná léčba samotného COVID-19.^[12]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000184012 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000385 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Paoloni-Giacobino A, Chen H, Peitsch MC, Rossier C, Antonarakis SE (září 1997). „Klonování genu TMPRSS2, který kóduje novou serinovou proteázu s transmembránovými, LDLRA a SRCR doménami a mapuje na 21q22.3“. Genomika. 44 (3): 309–20. doi:10.1006 / geno.1997.4845. PMID 9325052.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TMPRSS2 transmembránová proteáza, serin 2“.
^ Yu J, Yu J, Mani RS, Cao Q, Brenner CJ, Cao X a kol. (Květen 2010). „Integrovaná síť fúzí genů androgenního receptoru, polycombu a TMPRSS2-ERG v progresi rakoviny prostaty“. Rakovinová buňka. 17 (5): 443–54. doi:10.1016 / j.ccr.2010.03.018. PMC 2874722. PMID 20478527.
^ Huggins, DJ (listopad 2020). „Strukturální analýza experimentálních léků vázajících se na cíl SARS-CoV-2 TMPRSS2“. Journal of Molecular Graphics and Modeling. 100. doi:10.1016 / j.jmgm.2020.107710.
^ ^A ^b Hoffmann M, Kleine-Weber H, Schroeder S, Krüger N, Herrler T, Erichsen S a kol. (Březen 2020). „Vstup buněk SARS-CoV-2 závisí na ACE2 a TMPRSS2 a je blokován klinicky prokázaným inhibitorem proteázy“. Buňka. 181 (2): 271–280.e8. doi:10.1016 / j.cell.2020.02.052. PMC 7102627. PMID 32142651. Shrnutí ležel – Deutsches Primatenzentrum GmbH.
^ Rahman N, Basharat Z, Yousuf M, Castaldo G, Rastrelli L, Khan H (květen 2020). „Virtuální screening přírodních produktů proti transmembránové serinové proteáze typu II (TMPRSS2), základnímu činidlu koronaviru 2 (SARS-CoV-2)“. Molekuly. 25 (10): 2271. doi:10,3390 / molekuly25102271. PMC 7287752. PMID 32408547.
^ Shen, Li Wen; Mao, Hui Juan; Wu, Yan Ling; Tanaka, Yoshimasa; Zhang, Wen (listopad 2017). „TMPRSS2: Potenciální cíl pro léčbu chřipkových virů a koronavirových infekcí“. Biochimie. 142: 1–10. doi:10.1016 / j.biochi.2017.07.016. PMC 7116903. PMID 28778717.
^ Depfenhart, Markus; de Villiers, Danielle; Lemperle, Gottfried; Meyer, Markus; Di Somma, Salvatore (srpen 2020). „Potenciální nové léčebné strategie pro COVID-19: existuje role bromhexinu jako doplňkové léčby?“. Interní a urgentní medicína. 15 (5): 801–812. doi:10.1007 / s11739-020-02383-3. PMC 7249615. PMID 32458206.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Lin B, Ferguson C, White JT, Wang S, Vessella R, True LD a kol. (Září 1999). "Prostata lokalizovaná a androgenem regulovaná exprese membránově vázané serinové proteázy TMPRSS2". Výzkum rakoviny. 59 (17): 4180–4. PMID 10485450.
Vaarala MH, Porvari KS, Kellokumpu S, Kyllönen AP, Vihko PT (leden 2001). "Exprese transmembránové serinové proteázy TMPRSS2 v myších a lidských tkáních". The Journal of Pathology. 193 (1): 134–40. doi:10.1002 / 1096-9896 (2000) 9999: 9999 <:: AID-PATH743> 3.0.CO; 2-T. PMID 11169526.
Afar DE, Vivanco I, Hubert RS, Kuo J, Chen E, Saffran DC a kol. (Únor 2001). „Katalytické štěpení androgenem regulované TMPRSS2 proteázy vede k jeho sekreci prostatou a epiteli rakoviny prostaty“. Výzkum rakoviny. 61 (4): 1686–92. PMID 11245484.
Jacquinet E, Rao NV, Rao GV, Zhengming W, Albertine KH, Hoidal JR (květen 2001). "Klonování a charakterizace cDNA a genu pro lidský epitelium". European Journal of Biochemistry. 268 (9): 2687–99. doi:10.1046 / j.1432-1327.2001.02165.x. PMID 11322890.
Teng DH, Chen Y, Lian L, Ha PC, Tavtigian SV, Wong AK (červen 2001). "Mutační analýzy 268 kandidátských genů v lidských nádorových buněčných liniích". Genomika. 74 (3): 352–64. doi:10.1006 / geno.2001.6551. PMID 11414763.
Wilson S, Greer B, Hooper J, Zijlstra A, Walker B, Quigley J, Hawthorne S (červen 2005). „Membránově ukotvená serinová proteáza, TMPRSS2, aktivuje PAR-2 v buňkách rakoviny prostaty“. The Biochemical Journal. 388 (Pt 3): 967–72. doi:10.1042 / BJ20041066. PMC 1183478. PMID 15537383.
Soller MJ, Isaksson M, Elfving P, Soller W, Lundgren R, Panagopoulos I (červenec 2006). „Potvrzení vysoké frekvence fúzního genu TMPRSS2 / ERG u rakoviny prostaty“. Geny, chromozomy a rakovina. 45 (7): 717–9. doi:10,1002 / gcc.20329. PMID 16575875. S2CID 86518137.
Tomlins SA, Mehra R, Rhodes DR, Smith LR, Roulston D, Helgeson BE a kol. (Duben 2006). „TMPRSS2: fúze genů ETV4 definují třetí molekulární podtyp rakoviny prostaty“. Výzkum rakoviny. 66 (7): 3396–400. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-0168. PMID 16585160.
Yoshimoto M, Joshua AM, Chilton-Macneill S, Bayani J, Selvarajah S, Evans AJ a kol. (Červen 2006). „Tříbarevná FISH analýza fúzí TMPRSS2 / ERG u rakoviny prostaty naznačuje, že genomová mikrodelece chromozomu 21 je spojena s přesmykem“. Neoplazie. 8 (6): 465–9. doi:10.1593 / neo.06283. PMC 1601467. PMID 16820092.
Böttcher E, Matrosovich T, Beyerle M, Klenk HD, Garten W, Matrosovich M (říjen 2006). "Proteolytická aktivace chřipkových virů serinovými proteázami TMPRSS2 a HAT z epitelu dýchacích cest člověka". Journal of Virology. 80 (19): 9896–8. doi:10.1128 / JVI.01118-06. PMC 1617224. PMID 16973594.
Cerveira N, Ribeiro FR, Peixoto A, Costa V, Henrique R, Jerónimo C, Teixeira MR (říjen 2006). „Fúze genu TMPRSS2-ERG způsobující nadměrnou expresi ERG předchází změnám počtu kopií chromozomů u karcinomů prostaty a spárovaných lézí HGPIN“. Neoplazie. 8 (10): 826–32. doi:10.1593 / neo.06427. PMC 1715930. PMID 17032499.
Yoo NJ, Lee JW, Lee SH (březen 2007). "Absence fúze genů transkripčního faktoru TMPRSS2 a ETS v žaludečních a kolorektálních karcinomech". APMIS. 115 (3): 252–3. doi:10.1111 / j.1600-0463.2007.apm_652.x. PMID 17367471. S2CID 34487156.
Winnes M, Lissbrant E, Damber JE, Stenman G (květen 2007). „Molekulárně genetické analýzy fúzí genů TMPRSS2-ERG a TMPRSS2-ETV1 u 50 případů rakoviny prostaty“. Zprávy o onkologii. 17 (5): 1033–6. doi:10.3892 / nebo 17.5.1033. PMID 17390040.
Tu JJ, Rohan S, Kao J, Kitabayashi N, Mathew S, Chen YT (září 2007). „Genové fúze mezi geny rodiny TMPRSS2 a ETS u rakoviny prostaty: frekvence a analýza variant transkriptu pomocí RT-PCR a FISH na tkáních zalitých v parafinu“. Moderní patologie. 20 (9): 921–8. doi:10.1038 / modpathol.3800903. PMID 17632455.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000184012 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000000385 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9325052-5] Paoloni-Giacobino A, Chen H, Peitsch MC, Rossier C, Antonarakis SE (září 1997). „Klonování genu TMPRSS2, který kóduje novou serinovou proteázu s transmembránovými, LDLRA a SRCR doménami a mapuje na 21q22.3“. Genomika. 44 (3): 309–20. doi:10.1006 / geno.1997.4845. PMID 9325052.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: TMPRSS2 transmembránová proteáza, serin 2“.

[7] Yu J, Yu J, Mani RS, Cao Q, Brenner CJ, Cao X a kol. (Květen 2010). „Integrovaná síť fúzí genů androgenního receptoru, polycombu a TMPRSS2-ERG v progresi rakoviny prostaty“. Rakovinová buňka. 17 (5): 443–54. doi:10.1016 / j.ccr.2010.03.018. PMC 2874722. PMID 20478527.

[8] Huggins, DJ (listopad 2020). „Strukturální analýza experimentálních léků vázajících se na cíl SARS-CoV-2 TMPRSS2“. Journal of Molecular Graphics and Modeling. 100. doi:10.1016 / j.jmgm.2020.107710.

[Hoffmann_2020-9] A ^b Hoffmann M, Kleine-Weber H, Schroeder S, Krüger N, Herrler T, Erichsen S a kol. (Březen 2020). „Vstup buněk SARS-CoV-2 závisí na ACE2 a TMPRSS2 a je blokován klinicky prokázaným inhibitorem proteázy“. Buňka. 181 (2): 271–280.e8. doi:10.1016 / j.cell.2020.02.052. PMC 7102627. PMID 32142651. Shrnutí ležel – Deutsches Primatenzentrum GmbH.

[10] Rahman N, Basharat Z, Yousuf M, Castaldo G, Rastrelli L, Khan H (květen 2020). „Virtuální screening přírodních produktů proti transmembránové serinové proteáze typu II (TMPRSS2), základnímu činidlu koronaviru 2 (SARS-CoV-2)“. Molekuly. 25 (10): 2271. doi:10,3390 / molekuly25102271. PMC 7287752. PMID 32408547.

[Shen_2017-11] Shen, Li Wen; Mao, Hui Juan; Wu, Yan Ling; Tanaka, Yoshimasa; Zhang, Wen (listopad 2017). „TMPRSS2: Potenciální cíl pro léčbu chřipkových virů a koronavirových infekcí“. Biochimie. 142: 1–10. doi:10.1016 / j.biochi.2017.07.016. PMC 7116903. PMID 28778717.

[Depfenhart_2020-12] Depfenhart, Markus; de Villiers, Danielle; Lemperle, Gottfried; Meyer, Markus; Di Somma, Salvatore (srpen 2020). „Potenciální nové léčebné strategie pro COVID-19: existuje role bromhexinu jako doplňkové léčby?“. Interní a urgentní medicína. 15 (5): 801–812. doi:10.1007 / s11739-020-02383-3. PMC 7249615. PMID 32458206.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]