TIA1 - TIA1

Hledat
Struktury	Švýcarský model
Domény	InterPro

TIA1 (protein)
Identifikátory
Symbol	TIA1
Gen NCBI	7072
HGNC	11802
OMIM	603518
RefSeq	NM_022173
UniProt	P31483
Další údaje
Místo	Chr. 2 p13
Hledat
Struktury	Švýcarský model
Domény	InterPro

TIA1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2 MJN, 3BS9
Identifikátory
Aliasy	TIA1, TIA-1, WDM, TIA1 cytotoxický granulát asociovaný protein vázající RNA, TIA1 cytotoxický granulát asociovaný protein vázající RNA
Externí ID	OMIM: 603518 MGI: 107914 HomoloGene: 20692 Genové karty: TIA1
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	86,433,405 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleové kyseliny; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba prvků bohatých na AU; • poly (A) vazba; • Vazba RNA; • Vazba na oblast bohatou na mRNA 3'-UTR AU;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Stresová granule; • granule jaderného stresu; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol; • ribonukleoprotein;
Biologický proces	• negativní regulace procesu biosyntézy cytokinů; • negativní regulace překladu; • pozitivní regulace apoptotického procesu epiteliálních buněk; • regulace sestřihu mRNA prostřednictvím spliceosomu; • lokalizace proteinu do granule cytoplazmatického stresu; • apoptotický proces; • signální dráha receptoru pro růstový faktor fibroblastů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7072
	21841
	ENSG00000116001
	ENSMUSG00000071337
	P31483
	P52912
	NM_022037; NM_022173
	NM_001164078; NM_001164079; NM_011585
NP_071320; NP_071505; NP_001338437; NP_001338438; NP_001338439;
	NP_001338440; NP_001338441; NP_001338443; NP_001338444; NP_001338445; NP_001338446; NP_001338447; NP_001338448; NP_001338449; NP_001338450; NP_001338451; NP_001338452; NP_001338453; NP_001338454; NP_001338442
	NP_001157550; NP_001157551; NP_035715
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

TIA1 nebo Tia1 s cytotoxickými granulemi spojený protein vázající rna je 3'UTR mRNA vazebný protein, který se může vázat na 5'TOP sekvenci 5'TOP mRNA. Je spojena s programovanou smrtí buněk (apoptóza ) a reguluje alternativní sestřih genu kódujícího Fas receptor, protein podporující apoptózu.^[4] Za stresových podmínek se TIA1 lokalizuje do tzv. Buněčných konglomerací RNA-protein stresové granule.^[5] Je kódován TIA1 gen.^[6]

Mutace v TIA1 gen byly spojeny s Amyotrofní laterální skleróza, frontotemporální demence a Welander distální myopatie.^[7]^[8]^[9]

Funkce

Tento protein je členem rodiny proteinů vázajících RNA, která reguluje transkripce a RNA překlad. Poprvé byl identifikován v cílových buňkách cytotoxických lymfocytů (CTL). TIA1 působí v jádru a reguluje sestřih a transkripci.^[10] TIA1 pomáhá rekrutovat sestřih pro regulaci sestřihu RNA a inhibuje transkripci více genů, jako je cytokin.Faktor nekrózy nádorů alfa ^[10] V reakci na stres se TIA1 translokuje z jádra do cytoplazmy, kde nukleatuje typ granule RNA, nazývaný stresová granule a podílí se na translační stresové reakci.^[11] Jako součást reakce na translační stres pracuje TIA1 ve spolupráci s dalšími proteiny vázajícími RNA na sekvestraci transkriptů RNA od ribozomu, což umožňuje buňce zaměřit své mechanizmy syntézy proteinů / translace na produkci proteinů, které budou řešit konkrétní stres.^[12] Bylo navrženo, že tento protein může být zapojen do indukce apoptózy, protože přednostně rozpoznává poly (A) homopolymery a indukuje fragmentaci DNA v cílech CTL.^[13] Hlavním druhem spojeným s granulemi je 15-kDa protein, o kterém se předpokládá, že je odvozen od karboxylového konce 40-kDa produktu proteolytickým zpracováním. Byly popsány alternativní sestřihy vedoucí k různým izoformám tohoto genového produktu.

Viz také

Reference

^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000071337 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Izquierdo JM, Majós N, Bonnal S, Martínez C, Castelo R, Guigó R a kol. (Srpen 2005). "Regulace alternativního sestřihu Fas antagonistickými účinky TIA-1 a PTB na definici exonu". Molekulární buňka. 19 (4): 475–84. doi:10.1016 / j.molcel.2005.06.015. PMID 16109372.
^ Kedersha NL, Gupta M, Li W, Miller I, Anderson P (prosinec 1999). „Proteiny vázající RNA TIA-1 a TIAR spojují fosforylaci eIF-2 alfa se sestavením stresových granulí savců“. The Journal of Cell Biology. 147 (7): 1431–42. doi:10.1083 / jcb.147.7.1431. PMC 2174242. PMID 10613902.
^ „Entrez Gene: TIA1 cytotoxický granulát asociovaný protein vázající RNA“.
^ Mackenzie IR, Nicholson AM, Sarkar M, Messing J, Purice MD, Pottier C a kol. (Srpen 2017). „Mutace TIA1 při amyotrofické laterální skleróze a frontotemporální demenci podporují fázovou separaci a mění dynamiku stresových granulí“. Neuron. 95 (4): 808–816.e9. doi:10.1016 / j.neuron.2017.07.025. PMC 5576574. PMID 28817800.
^ Hackman P, Sarparanta J, Lehtinen S, Vihola A, Evilä A, Jonson PH a kol. (Duben 2013). „Welanderova distální myopatie je způsobena mutací v RNA vázajícím proteinu TIA1“. Annals of Neurology. 73 (4): 500–9. doi:10,1002 / ana.23831. PMID 23401021. S2CID 13908127.
^ Klar J, Sobol M, Melberg A, Mäbert K, Ameur A, Johansson AC a kol. (Duben 2013). „Welanderova distální myopatie způsobená starou zakladatelskou mutací v TIA1 spojenou s narušeným spojováním“. Lidská mutace. 34 (4): 572–7. doi:10,1002 / humu.22282. PMID 23348830. S2CID 10955236.
^ ^A ^b Rayman JB, Kandel ER (květen 2017). „TIA-1 je funkční protein podobný prionu“. Perspektivy Cold Spring Harbor v biologii. 9 (5): a030718. doi:10.1101 / cshperspect.a030718. PMC 5411700. PMID 28003185.
^ Anderson P, Kedersha N (březen 2008). „Stresové granule: Tao RNA třídění“. Trendy v biochemických vědách. 33 (3): 141–50. doi:10.1016 / j.tibs.2007.12.003. PMID 18291657.
^ Wolozin B, Ivanov P (listopad 2019). „Stresové granule a neurodegenerace“. Recenze přírody. Neurovědy. 20 (11): 649–666. doi:10.1038 / s41583-019-0222-5. PMC 6986315. PMID 31582840.
^ Anderson P, Kedersha N, Ivanov P (červenec 2015). „Stresové granule, těla P a rakovina“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - regulační mechanismy genů. 1849 (7): 861–70. doi:10.1016 / j.bbagrm.2014.11.009. PMC 4457708. PMID 25482014.

Další čtení

Kawakami A, Tian Q, Streuli M, Poe M, Edelhoff S, Disteche CM, Anderson P (květen 1994). "Organizace intron-exon a chromozomální lokalizace lidského genu TIA-1". Journal of Immunology. 152 (10): 4937–45. PMID 8176212.
Dember LM, Kim ND, Liu KQ, Anderson P (únor 1996). „Jednotlivé motivy rozpoznávání RNA TIA-1 a TIAR mají různé RNA vazebné specificity“. The Journal of Biological Chemistry. 271 (5): 2783–8. doi:10.1074 / jbc.271.5.2783. PMID 8576255.
Bossowski A, Czarnocka B, Bardadin K, Moniuszko A, Łyczkowska A, Czerwinska J a kol. (Leden 2010). "Identifikace vybrané apoptotické (TIAR a TIA-1) exprese markerů ve tkáních štítné žlázy u dospívajících s imunitními a neimunitními chorobami štítné žlázy". Folia Histochemica et Cytobiologica. 48 (2): 178–84. doi:10.2478 / v10042-010-0022-2. PMID 20675271.
Aznarez I, Barash Y, Shai O, He D, Zielenski J, Tsui LC a kol. (Srpen 2008). „Systematická analýza intronových sekvencí za 5 'spojovacími místy odhaluje rozsáhlou roli motivů bohatých na U a proteinů TIA1 / TIAL1 v alternativní regulaci sestřihu“. Výzkum genomu. 18 (8): 1247–58. doi:10.1101 / gr.073155.107. PMC 2493427. PMID 18456862.
López de Silanes I, Galbán S, Martindale JL, Yang X, Mazan-Mamczarz K, Indig FE a kol. (Listopad 2005). „Identifikace a funkční výsledek mRNA asociovaných s proteinem TIA-1 vázajícím RNA“. Molekulární a buněčná biologie. 25 (21): 9520–31. doi:10.1128 / MCB.25.21.9520-9531.2005. PMC 1265820. PMID 16227602.
McAlinden A, Liang L, Mukudai Y, Imamura T, Sandell LJ (srpen 2007). „Jaderný protein TIA-1 reguluje alternativní sestřih COL2A1 a interaguje s prekurzorovou mRNA a genomovou DNA“. The Journal of Biological Chemistry. 282 (33): 24444–54. doi:10,1074 / jbc.M702717200. PMID 17580305.
Anderson P, Nagler-Anderson C, O'Brien C, Levine H, Watkins S, Slayter HS a kol. (Leden 1990). „Monoklonální protilátka reaktivní s proteinem asociovaným s cytoplazmatickými granulemi 15 kDa definuje subpopulaci CD8 + T lymfocytů.“ Journal of Immunology. 144 (2): 574–82. PMID 2104899.
Sugihara M, Tsutsumi A, Suzuki E, Wakamatsu E, Suzuki T, Ogishima H a kol. (Červenec 2007). "Účinky léčby infliximabem na hladiny genové exprese faktoru nekrózy nádoru alfa, tristetraprolinu, intracelulárního antigenu 1 T buněk a Hu antigenu R u pacientů s revmatoidní artritidou". Artritida a revmatismus. 56 (7): 2160–9. doi:10,1002 / článek 22724. PMID 17599736.
Singh NN, Seo J, Ottesen EW, Shishimorova M, Bhattacharya D, Singh RN (březen 2011). „TIA1 brání přeskočení kritického exonu spojeného se spinální svalovou atrofií“. Molekulární a buněčná biologie. 31 (5): 935–54. doi:10.1128 / MCB.00945-10. PMC 3067828. PMID 21189287.

externí odkazy

TIA1 + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento biochemie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCm38Ensembl-1] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000071337 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid16109372-4] Izquierdo JM, Majós N, Bonnal S, Martínez C, Castelo R, Guigó R a kol. (Srpen 2005). "Regulace alternativního sestřihu Fas antagonistickými účinky TIA-1 a PTB na definici exonu". Molekulární buňka. 19 (4): 475–84. doi:10.1016 / j.molcel.2005.06.015. PMID 16109372.

[5] Kedersha NL, Gupta M, Li W, Miller I, Anderson P (prosinec 1999). „Proteiny vázající RNA TIA-1 a TIAR spojují fosforylaci eIF-2 alfa se sestavením stresových granulí savců“. The Journal of Cell Biology. 147 (7): 1431–42. doi:10.1083 / jcb.147.7.1431. PMC 2174242. PMID 10613902.

[entrez-6] „Entrez Gene: TIA1 cytotoxický granulát asociovaný protein vázající RNA“.

[7] Mackenzie IR, Nicholson AM, Sarkar M, Messing J, Purice MD, Pottier C a kol. (Srpen 2017). „Mutace TIA1 při amyotrofické laterální skleróze a frontotemporální demenci podporují fázovou separaci a mění dynamiku stresových granulí“. Neuron. 95 (4): 808–816.e9. doi:10.1016 / j.neuron.2017.07.025. PMC 5576574. PMID 28817800.

[8] Hackman P, Sarparanta J, Lehtinen S, Vihola A, Evilä A, Jonson PH a kol. (Duben 2013). „Welanderova distální myopatie je způsobena mutací v RNA vázajícím proteinu TIA1“. Annals of Neurology. 73 (4): 500–9. doi:10,1002 / ana.23831. PMID 23401021. S2CID 13908127.

[9] Klar J, Sobol M, Melberg A, Mäbert K, Ameur A, Johansson AC a kol. (Duben 2013). „Welanderova distální myopatie způsobená starou zakladatelskou mutací v TIA1 spojenou s narušeným spojováním“. Lidská mutace. 34 (4): 572–7. doi:10,1002 / humu.22282. PMID 23348830. S2CID 10955236.

[:0-10] A ^b Rayman JB, Kandel ER (květen 2017). „TIA-1 je funkční protein podobný prionu“. Perspektivy Cold Spring Harbor v biologii. 9 (5): a030718. doi:10.1101 / cshperspect.a030718. PMC 5411700. PMID 28003185.

[11] Anderson P, Kedersha N (březen 2008). „Stresové granule: Tao RNA třídění“. Trendy v biochemických vědách. 33 (3): 141–50. doi:10.1016 / j.tibs.2007.12.003. PMID 18291657.

[12] Wolozin B, Ivanov P (listopad 2019). „Stresové granule a neurodegenerace“. Recenze přírody. Neurovědy. 20 (11): 649–666. doi:10.1038 / s41583-019-0222-5. PMC 6986315. PMID 31582840.

[13] Anderson P, Kedersha N, Ivanov P (červenec 2015). „Stresové granule, těla P a rakovina“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - regulační mechanismy genů. 1849 (7): 861–70. doi:10.1016 / j.bbagrm.2014.11.009. PMC 4457708. PMID 25482014.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]