TH1L - TH1L

NELFCD
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	5L3X
Identifikátory
Aliasy	NELFCD, NELF-C, NELF-D, TH1, TH1L, HSPC130, negativní člen faktor prodloužení komplexní člen C / D
Externí ID	OMIM: 605297 MGI: 1926424 HomoloGene: 9496 Genové karty: NELFCD
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	58,995,133 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	174,427,502 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• membrána; • NELF komplex; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • pozitivní regulace virové transkripce; • negativní regulace transkripce, chráněná DNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • negativní regulace prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51497
	57314
	ENSG00000101158
	ENSMUSG00000016253
	Q8IXH7
	Q922L6
	NM_016397; NM_198976
	NM_020580
	NP_945327
	NP_065605
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Negativní faktor prodloužení C / D je protein že u lidí je kódován TH1L gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Komplex proteinů NELF interaguje s komplexem proteinů DSIF a potlačuje tak transkripční prodloužení RNA polymerázou II. Protein kódovaný tímto genem je podstatnou součástí komplexu NELF. Výsledkem alternativního použití místa zahájení iniciace translace je vytvoření dvou izoforem s různými N-konci.^[7]

Interakce

Bylo prokázáno, že TH1L komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101158 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000016253 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bonthron DT, Hayward BE, Moran V, kmen L (srpen 2000). "Charakterizace TH1 a CTSZ, dvou netištěných genů po směru transkripce GNAS1 v chromozomu 20q13". Genetika člověka. 107 (2): 165–75. doi:10,1007 / s004390000344. PMID 11030415. S2CID 25570066.
^ Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (říjen 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Výzkum genomu. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TH1L TH1-like (Drosophila)“.
^ Yuryev A, Wennogle LP (únor 2003). „Nové interakce raf kináza-protein-protein nalezené vyčerpávající kvasinkovou dvouhybridní analýzou“. Genomika. 81 (2): 112–25. doi:10.1016 / s0888-7543 (02) 00008-3. PMID 12620389.
^ Yin XL, Chen S, Gu JX (únor 2002). "Identifikace TH1 jako interakčního partnera A-Raf kinázy". Molekulární a buněčná biochemie. 231 (1–2): 69–74. doi:10.1023 / A: 1014437024129. PMID 11952167. S2CID 19362635.
^ ^A ^b Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
^ ^A ^b Narita T, Yamaguchi Y, Yano K, Sugimoto S, Chanarat S, Wada T, Kim DK, Hasegawa J, Omori M, Inukai N, Endoh M, Yamada T, Handa H (březen 2003). "Lidský transkripční elongační faktor NELF: identifikace nových podjednotek a rekonstituce funkčně aktivního komplexu". Molekulární a buněčná biologie. 23 (6): 1863–73. doi:10.1128 / mcb.23.6.1863-1873.2003. PMC 149481. PMID 12612062.

Další čtení

Stevens M, De Clercq E, Balzarini J (září 2006). „Regulace transkripce HIV-1: molekulární cíle pro chemoterapeutickou intervenci“. Recenze lékařského výzkumu. 26 (5): 595–625. doi:10.1002 / med.20081. PMC 7168390. PMID 16838299.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Yamaguchi Y, Takagi T, Wada T, Yano K, Furuya A, Sugimoto S, Hasegawa J, Handa H (duben 1999). „NELF, multisubunitový komplex obsahující RD, spolupracuje s DSIF na potlačení prodloužení RNA polymerázy II“. Buňka. 97 (1): 41–51. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80713-8. PMID 10199401. S2CID 16855257.
Ping YH, Rana TM (duben 2001). „DSIF a NELF interagují s komplexem pro prodloužení RNA polymerázy II a HIV-1 Tat stimuluje P-TEFb zprostředkovanou fosforylaci RNA polymerázy II a DSIF během prodloužení transkripce“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (16): 12951–8. doi:10,1074 / jbc.M006130200. PMID 11112772.
Yin XL, Chen S, Gu JX (únor 2002). "Identifikace TH1 jako interakčního partnera A-Raf kinázy". Molekulární a buněčná biochemie. 231 (1–2): 69–74. doi:10.1023 / A: 1014437024129. PMID 11952167. S2CID 19362635.
Narita T, Yamaguchi Y, Yano K, Sugimoto S, Chanarat S, Wada T, Kim DK, Hasegawa J, Omori M, Inukai N, Endoh M, Yamada T, Handa H (březen 2003). "Lidský transkripční elongační faktor NELF: identifikace nových podjednotek a rekonstituce funkčně aktivního komplexu". Molekulární a buněčná biologie. 23 (6): 1863–73. doi:10.1128 / MCB.23.6.1863-1873.2003. PMC 149481. PMID 12612062.
Yuryev A, Wennogle LP (únor 2003). „Nové interakce raf kináza-protein-protein nalezené vyčerpávající kvasinkovou dvouhybridní analýzou“. Genomika. 81 (2): 112–25. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 00008-3. PMID 12620389.
Liu W, Shen X, Yang Y, Yin X, Xie J, Yan J, Jiang J, Liu W, Wang H, Sun M, Zheng Y, Gu J (březen 2004). „Trihydrofobin 1 je nový negativní regulátor A-Raf kinázy“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (11): 10167–75. doi:10,1074 / jbc.M307994200. PMID 14684750.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (červenec 2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Výzkum genomu. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E „Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (září 2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
Yang Y, Liu W, Zou W, Wang H, Zong H, Jiang J, Wang Y, Gu J (květen 2007). „Ubiquitin-dependentní proteolýza trihydrofobinu 1 (TH1) proteinem E6 souvisejícím s lidským papilomavirem (E6-AP)“. Journal of Cellular Biochemistry. 101 (1): 167–80. doi:10.1002 / jcb.21164. PMID 17131388. S2CID 23675528.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101158 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000016253 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11030415-5] Bonthron DT, Hayward BE, Moran V, kmen L (srpen 2000). "Charakterizace TH1 a CTSZ, dvou netištěných genů po směru transkripce GNAS1 v chromozomu 20q13". Genetika člověka. 107 (2): 165–75. doi:10,1007 / s004390000344. PMID 11030415. S2CID 25570066.

[pmid11042152-6] Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (říjen 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Výzkum genomu. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: TH1L TH1-like (Drosophila)“.

[pmid12620389-8] Yuryev A, Wennogle LP (únor 2003). „Nové interakce raf kináza-protein-protein nalezené vyčerpávající kvasinkovou dvouhybridní analýzou“. Genomika. 81 (2): 112–25. doi:10.1016 / s0888-7543 (02) 00008-3. PMID 12620389.

[pmid11952167-9] Yin XL, Chen S, Gu JX (únor 2002). "Identifikace TH1 jako interakčního partnera A-Raf kinázy". Molekulární a buněčná biochemie. 231 (1–2): 69–74. doi:10.1023 / A: 1014437024129. PMID 11952167. S2CID 19362635.

[pmid17353931-10] A ^b Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[pmid12612062-11] A ^b Narita T, Yamaguchi Y, Yano K, Sugimoto S, Chanarat S, Wada T, Kim DK, Hasegawa J, Omori M, Inukai N, Endoh M, Yamada T, Handa H (březen 2003). "Lidský transkripční elongační faktor NELF: identifikace nových podjednotek a rekonstituce funkčně aktivního komplexu". Molekulární a buněčná biologie. 23 (6): 1863–73. doi:10.1128 / mcb.23.6.1863-1873.2003. PMC 149481. PMID 12612062.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]