TGS1 - TGS1

TGS1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3EGI, 3GDH
Identifikátory
Aliasy	TGS1, NCOA6IP, PIMT, PIPMT, trimethylguanosin syntáza 1
Externí ID	OMIM: 606461 MGI: 2151797 HomoloGene: 32608 Genové karty: TGS1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	55,826,445 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	3,616,619 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita methyltransferázy; • aktivita transferázy; • Aktivita trimethylguanosin syntázy RNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita RNA methyltransferázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Cajal tělo; • nukleoplazma; • jádro; • malý nukleární ribonukleoproteinový komplex; • buněčné jádro; • extracelulární; • cytosol;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • sestava spliceosomal snRNP; • methylace; • Uzávěr 7-methylguanosinu RNA; • Hypermethylace čepičky 7-methylguanosinu; • biogeneze komplexu ribonukleoproteinů; • Methylace RNA; • regulace metabolismu lipidů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	96764
	116940
	ENSG00000137574
	ENSMUSG00000028233
	Q96RS0
	Q923W1
	NM_024831; NM_001317902; NM_001363184
	NM_054089
	NP_001304831; NP_079107; NP_001350113
	NP_473430
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Trimethylguanosin syntáza je enzym že u lidí je kódován TGS1 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

TGS1 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137574 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028233 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Zhu Y, Qi C, Cao WQ, Yeldandi AV, Rao MS, Reddy JK (srpen 2001). „Klonování a charakterizace PIMT, proteinu s doménou methyltransferázy, který interaguje s funkcí PRIP a aktivuje koaktivátor jaderných receptorů“. Proc Natl Acad Sci U S A. 98 (18): 10380–5. doi:10.1073 / pnas.181347498. PMC 56969. PMID 11517327.
^ Mouaikel J, Verheggen C, Bertrand E, Tazi J, Bordonné R (květen 2002). „Hypermethylace struktury víčka jak kvasnicových snRNA, tak snoRNA vyžaduje konzervovanou methyltransferázu, která je lokalizována v jádře“. Mol Cell. 9 (4): 891–901. doi:10.1016 / S1097-2765 (02) 00484-7. PMID 11983179.
^ "Entrez Gene: TGS1 trimethylguanosin syntáza homolog (S. cerevisiae)".
^ ^A ^b ^C ^d Misra P, Qi C, Yu S, Shah SH, Cao WQ, Rao MS, Thimmapaya B, Zhu Y, Reddy JK (květen 2002). „Interakce PIMT s transkripčními koaktivátory CBP, p300 a PBP diferenciální role v transkripční regulaci“. J. Biol. Chem. 277 (22): 20011–9. doi:10,1074 / jbc.M201739200. PMID 11912212.
^ Enünlü I, Pápai G, Cserpán I, Udvardy A, Jeang KT, Boros I (září 2003). „Různé izoformy proteinu interagujícího s PRIP s doménou methyltransferázy / trimethylguanosin syntázou se lokalizují do cytoplazmy a jádra“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 309 (1): 44–51. doi:10.1016 / s0006-291x (03) 01514-6. PMID 12943661.

Další čtení

Misra P, Qi C, Yu S, Shah SH, Cao WQ, Rao MS, Thimmapaya B, Zhu Y, Reddy JK (2002). „Interakce PIMT s transkripčními koaktivátory CBP, p300 a PBP diferenciální role v transkripční regulaci“. J. Biol. Chem. 277 (22): 20011–9. doi:10,1074 / jbc.M201739200. PMID 11912212.
Verheggen C, Lafontaine DL, Samarsky D, Mouaikel J, Blanchard JM, Bordonné R, Bertrand E (2002). „Savčí a kvasinkové U3 snoRNP dozrávají ve specifických a souvisejících jaderných kompartmentech“. EMBO J.. 21 (11): 2736–45. doi:10.1093 / emboj / 21.11.2736. PMC 126019. PMID 12032086.
Wang Y, Han KJ, Pang XW, Vaughan HA, Qu W, Dong XY, Peng JR, Zhao HT, Rui JA, Leng XS, Cebon J, Burgess AW, Chen WF (2002). "Rozsáhlá identifikace antigenů asociovaných s lidským hepatocelulárním karcinomem pomocí autoprotilátek". J. Immunol. 169 (2): 1102–9. doi:10,4049 / jimmunol.169.2.1102. PMID 12097419.
Surapureddi S, Yu S, Bu H, Hashimoto T, Yeldandi AV, Kashireddy P, Cherkaoui-Malki M, Qi C, Zhu YJ, Rao MS, Reddy JK (2002). „Identifikace transkripčně aktivního peroxisomového proliferátoru aktivovaného komplexu kofaktoru receptoru alfa v krysích játrech a charakterizace PRIC285 jako koaktivátoru“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (18): 11836–41. doi:10.1073 / pnas.182426699. PMC 129355. PMID 12189208.
Krackhardt AM, Witzens M, Harig S, Hodi FS, Zauls AJ, Chessia M, Barrett P, Gribben JG (2002). „Identifikace antigenů asociovaných s nádorem u chronické lymfocytární leukémie metodou SEREX“. Krev. 100 (6): 2123–31. doi:10.1182 / krev-2002-02-0513. PMID 12200376.
Mouaikel J, Narayanan U, Verheggen C, Matera AG, Bertrand E, Tazi J, Bordonné R (2004). „Interakce mezi hypermethylázou s malou nukleární RNA a proteinem spinální svalové atrofie, přežití motorického neuronu“. EMBO Rep. 4 (6): 616–22. doi:10.1038 / sj.embor.embor863. PMC 1319203. PMID 12776181.
Enünlü I, Pápai G, Cserpán I, Udvardy A, Jeang KT, Boros I (2003). „Různé izoformy proteinu interagujícího s PRIP s doménou methyltransferázy / trimethylguanosin syntázou se lokalizují do cytoplazmy a jádra“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 309 (1): 44–51. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 01514-6. PMID 12943661.
Watkins NJ, Lemm I, Ingelfinger D, Schneider C, Hossbach M, Urlaub H, Lührmann R (2005). "Sestavení a zrání U3 snoRNP v nukleoplazmě ve velkém dynamickém multiproteinovém komplexu". Mol. Buňka. 16 (5): 789–98. doi:10.1016 / j.molcel.2004.11.012. hdl:11858 / 00-001M-0000-0012-EB89-8. PMID 15574333.
Oh JH, Yang JO, Hahn Y, Kim MR, Byun SS, Jeon YJ, Kim JM, Song KS, Noh SM, Kim S, Yoo HS, Kim YS, Kim NS (2006). "Transkriptomová analýza lidské rakoviny žaludku". Mamm. Genom. 16 (12): 942–54. doi:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137574 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028233 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11517327-5] A ^b Zhu Y, Qi C, Cao WQ, Yeldandi AV, Rao MS, Reddy JK (srpen 2001). „Klonování a charakterizace PIMT, proteinu s doménou methyltransferázy, který interaguje s funkcí PRIP a aktivuje koaktivátor jaderných receptorů“. Proc Natl Acad Sci U S A. 98 (18): 10380–5. doi:10.1073 / pnas.181347498. PMC 56969. PMID 11517327.

[pmid11983179-6] Mouaikel J, Verheggen C, Bertrand E, Tazi J, Bordonné R (květen 2002). „Hypermethylace struktury víčka jak kvasnicových snRNA, tak snoRNA vyžaduje konzervovanou methyltransferázu, která je lokalizována v jádře“. Mol Cell. 9 (4): 891–901. doi:10.1016 / S1097-2765 (02) 00484-7. PMID 11983179.

[entrez-7] "Entrez Gene: TGS1 trimethylguanosin syntáza homolog (S. cerevisiae)".

[pmid11912212-8] A ^b ^C ^d Misra P, Qi C, Yu S, Shah SH, Cao WQ, Rao MS, Thimmapaya B, Zhu Y, Reddy JK (květen 2002). „Interakce PIMT s transkripčními koaktivátory CBP, p300 a PBP diferenciální role v transkripční regulaci“. J. Biol. Chem. 277 (22): 20011–9. doi:10,1074 / jbc.M201739200. PMID 11912212.

[pmid12943661-9] Enünlü I, Pápai G, Cserpán I, Udvardy A, Jeang KT, Boros I (září 2003). „Různé izoformy proteinu interagujícího s PRIP s doménou methyltransferázy / trimethylguanosin syntázou se lokalizují do cytoplazmy a jádra“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 309 (1): 44–51. doi:10.1016 / s0006-291x (03) 01514-6. PMID 12943661.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]