TDRD7 - TDRD7

TDRD7
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3RCO
Identifikátory
Aliasy	TDRD7, CATC4, CTRCT36, PCTAIRE2BP, TRAP, doména tudor obsahující 7
Externí ID	OMIM: 611258 MGI: 2140279 HomoloGene: 8618 Genové karty: TDRD7
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	97,496,125 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	46,034,761 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• mRNA vazba; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba N-konce proteinu; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • chromatoidní tělo; • mitochondriální matice; • ribonukleoproteinová granule;
Biologický proces	• posttranskripční regulace genové exprese; • diferenciace buněk; • diferenciace buněk optických vláken; • morfogeneze čočky v oku kamery; • spermatogeneze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	23424
	100121
	ENSG00000196116
	ENSMUSG00000035517
	Q8NHU6
	Q8K1H1
	NM_001302884; NM_014290
	NM_001290475; NM_146142; NM_001355189
	NP_001289813; NP_055105
	NP_001277404; NP_666254; NP_001342118
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein obsahující tudorovskou doménu 7 je protein že u lidí je kódován TDRD7 gen.^[5]^[6]

V melanocytických buňkách může být exprese genu TDRD7 regulována MITF.^[7]

Genový polymorfismus

Byly identifikovány různé jednonukleotidové polymorfismy (SNP) genu TDRD7 a pro některé z nich byla prokázána asociace s nižší citlivostí na kataraktu související s věkem.^[8]

Interakce

Bylo prokázáno, že TDRD7 komunikovat s TACC1.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196116 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035517 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T , Max SI, Wang J, Hsieh F, Diatchenko L, Marusina K, Farmer AA, Rubin GM, Hong L, Stapleton M, Soares MB, Bonaldo MF, Casavant TL, Scheetz TE, Brownstein MJ, Usdin TB, Toshiyuki S, Carninci P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (prosinec 2002). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
^ „Entrez Gene: TDRD7 tudor doména obsahující 7“.
^ Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir K, Schepsky A, Dummer R, Steingrimsson E (2008). "Nové cíle MITF identifikované pomocí dvoustupňové strategie DNA microarray". Pigment Cell Melanoma Res. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971. S2CID 24698373.
^ Zheng C, Wu M, He CY, An XJ, Sun M, Chen CL, Ye J (únor 2014). "Polymorfismy genové komponenty RNA TDRD7 v čínské populaci Han s kataraktou související s věkem". J. Int. Med. Res. 42 (1): 153–63. doi:10.1177/0300060513504702. PMID 24435515.
^ Conte N, Delaval B, Ginestier C, Ferrand A, Isnardon D, Larroque C, Prigent C, Séraphin B, Jacquemier J, Birnbaum D (listopad 2003). "TACC1-chTOG-Aurora A proteinový komplex u rakoviny prsu". Onkogen. 22 (50): 8102–16. doi:10.1038 / sj.onc.1206972. PMID 14603251.

Další čtení

Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Conte N, Delaval B, Ginestier C, Ferrand A, Isnardon D, Larroque C, Prigent C, Séraphin B, Jacquemier J, Birnbaum D (2003). "TACC1-chTOG-Aurora A proteinový komplex u rakoviny prsu". Onkogen. 22 (50): 8102–16. doi:10.1038 / sj.onc.1206972. PMID 14603251.
Lauffart B, Howell SJ, Tasch JE, Cowell JK, Still IH (2002). „Interakce transformujícího se kyselého proteinu coiled-coil 1 (TACC1) s ch-TOG a GAS41 / NuBI1 naznačuje více proteinových komplexů obsahujících TACC1 v lidských buňkách“. Biochem. J. 363 (Pt 1): 195–200. doi:10.1042/0264-6021:3630195. PMC 1222467. PMID 11903063.
Yamochi T, Nishimoto I, Okuda T, Matsuoka M (2001). "ik3-1 / Cables je spojen s Trap a Pctaire2". Biochem. Biophys. Res. Commun. 286 (5): 1045–50. doi:10.1006 / bbrc.2001.5493. PMID 11527406.
Hirose T, Kawabuchi M, Tamaru T, Okumura N, Nagai K, Okada M (2000). „Identifikace asociace tudorovy repetice s PCTAIRE 2 (Trap). Nový protein, který interaguje s N-koncovou doménou PCTAIRE 2 v mozku krysy“. Eur. J. Biochem. 267 (7): 2113–21. doi:10.1046 / j.1432-1327.2000.01218.x. PMID 10727952.

externí odkazy

Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q8NHU6 (Protein 7 obsahující lidskou doménu Tudor) na PDBe-KB.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q8K1H1 (Protein 7 obsahující doménu myšího Tudora) na PDBe-KB.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000196116 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000035517 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12477932-5] Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T , Max SI, Wang J, Hsieh F, Diatchenko L, Marusina K, Farmer AA, Rubin GM, Hong L, Stapleton M, Soares MB, Bonaldo MF, Casavant TL, Scheetz TE, Brownstein MJ, Usdin TB, Toshiyuki S, Carninci P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (prosinec 2002). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.

[entrez-6] „Entrez Gene: TDRD7 tudor doména obsahující 7“.

[pmid19067971-7] Hoek KS, Schlegel NC, Eichhoff OM, Widmer DS, Praetorius C, Einarsson SO, Valgeirsdottir S, Bergsteinsdottir K, Schepsky A, Dummer R, Steingrimsson E (2008). "Nové cíle MITF identifikované pomocí dvoustupňové strategie DNA microarray". Pigment Cell Melanoma Res. 21 (6): 665–76. doi:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID 19067971. S2CID 24698373.

[pmid_=_24435515-8] Zheng C, Wu M, He CY, An XJ, Sun M, Chen CL, Ye J (únor 2014). "Polymorfismy genové komponenty RNA TDRD7 v čínské populaci Han s kataraktou související s věkem". J. Int. Med. Res. 42 (1): 153–63. doi:10.1177/0300060513504702. PMID 24435515.

[pmid14603251-9] Conte N, Delaval B, Ginestier C, Ferrand A, Isnardon D, Larroque C, Prigent C, Séraphin B, Jacquemier J, Birnbaum D (listopad 2003). "TACC1-chTOG-Aurora A proteinový komplex u rakoviny prsu". Onkogen. 22 (50): 8102–16. doi:10.1038 / sj.onc.1206972. PMID 14603251.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]