TCEA2 - TCEA2

TCEA2
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2LW4
Identifikátory
Aliasy	TCEA2, TFIIS, faktor prodloužení transkripce A2
Externí ID	OMIM: 604784 MGI: 107368 HomoloGene: 68304 Genové karty: TCEA2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	64,072,347 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	181,688,071 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba iontů zinku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • vazba nukleové kyseliny; • aktivita činitele translačního prodloužení;
Buněčná složka	• komplex faktoru prodloužení transkripce; • buněčné jádro;
Biologický proces	• Transkripce s templátem DNA, prodloužení; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • regulace transkripce templátované DNA, prodloužení; • translační prodloužení;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6919
	21400
	ENSG00000171703
	ENSMUSG00000059540
	Q15560; Q6IB64
	Q9QVN7
	NM_003195; NM_198723
	NM_009326; NM_001356342; NM_001356343
	NP_003186; NP_942016; NP_003186.1
	NP_033352; NP_001343271; NP_001343272
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein prodloužení transkripce A protein 2 je protein že u lidí je kódován TCEA2 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem se nachází v jádru, kde funguje jako transkripční elongační faktor třídy SII. Faktory prodloužení v této třídě jsou odpovědné za uvolňování ternárních komplexů RNA polymerázy II ze zástavy transkripce na zádržných místech kódovaných templátem. Ukázalo se, že kódovaný protein interaguje s obecným transkripčním faktorem IIB, bazálním transkripčním faktorem. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy.^[7]

Interakce

Ukázalo se, že TCEA2 komunikovat s MAGEA11.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171703 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000059540 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Weaver ZA, Kane CM (prosinec 1997). "Genomická charakterizace genu TFIIS (TCEA2) specifického pro varlata". Genomika. 46 (3): 516–9. doi:10.1006 / geno.1997.5073. PMID 9441762.
^ Umehara T, Kida S, Yamamoto T, Horikoshi M (prosinec 1995). "Izolace a charakterizace cDNA kódující nový typ lidského transkripčního elongačního faktoru S-II". Gen. 167 (1–2): 297–302. doi:10.1016/0378-1119(95)00634-6. PMID 8566795.
^ ^A ^b "Entrez Gene: TCEA2 transkripční elongační faktor A (SII), 2".
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Další čtení

Kato H, Sumimoto H, Pognonec P, Chen CH, Rosen CA, Roeder RG (duben 1992). „HIV-1 Tat působí in vitro ve spojení s faktory prodlužování buněk jako faktor procesivity“. Geny a vývoj. 6 (4): 655–66. doi:10,1101 / gad. 6.4.455. PMID 1559613.
Li XY, Green MR (říjen 1998). „Buněčný koaktivátor Tat-SF1 HIV-1 Tat je obecným faktorem prodloužení transkripce“. Geny a vývoj. 12 (19): 2992–6. doi:10.1101 / gad.12.19.2992. PMC 317190. PMID 9765201.
Trembley JH, Hu D, Hsu LC, Yeung CY, Slaughter C, Lahti JM, Kidd VJ (leden 2002). „Proteinové kinázy PITSLRE p110 se asociují s transkripčními komplexy a ovlivňují jejich aktivitu“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (4): 2589–96. doi:10,1074 / jbc.M109755200. PMID 11709559.
Sijbrandi R, Fiedler U, Timmers HT (červen 2002). „Komplexy RNA polymerázy II ve velmi rané fázi transkripce nejsou citlivé na exonukleolytické štěpení indukované TFIIS“. Výzkum nukleových kyselin. 30 (11): 2290–8. doi:10.1093 / nar / 30.11.2290. PMC 117193. PMID 12034815.
Saso K, Ito T, Natori S, Sekimizu K (duben 2003). „Identifikace nového tkáňově specifického transkripčního aktivátoru FESTA jako proteinu, který interaguje s transkripčním elongačním faktorem S-II“. Journal of Biochemistry. 133 (4): 493–500. doi:10.1093 / jb / mvg065. PMID 12761297.
Tamura K, Miyata K, Sugahara K, Onishi S, Shuin T, Aso T (září 2003). „Identifikace EloA-BP1, nového proteinu vázajícího elongin A s doménou homologie exonukleázy“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 309 (1): 189–95. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 01556-0. PMID 12943681.
Nakata A, Ito T, Nagata M, Hori S, Sekimizu K (listopad 2004). „GRIP1tau, nový transkripční aktivátor obsahující doménu PDZ, spolupracuje s varlat specifickým transkripčním elongačním faktorem SII-T1“. Geny do buněk. 9 (11): 1125–35. doi:10.1111 / j.1365-2443.2004.00795.x. PMID 15507123. S2CID 23334030.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E „Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (září 2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Palangat M, Renner DB, Price DH, Landick R (říjen 2005). „Negativní elongační faktor pro lidskou RNA polymerázu II inhibuje anti-aretační transkript-štěpný faktor TFIIS“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 102 (42): 15036–41. doi:10.1073 / pnas.0409405102. PMC 1257689. PMID 16214896.
Kuraoka I, Suzuki K, Ito S, Hayashida M, Kwei JS, Ikegami T, Handa H, Nakabeppu Y, Tanaka K (červen 2007). „RNA polymeráza II obchází 8-oxoguanin v přítomnosti transkripčního elongačního faktoru TFIIS“. Oprava DNA. 6 (6): 841–51. doi:10.1016 / j.dnarep.2007.01.014. PMID 17374514.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000171703 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000059540 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9441762-5] Weaver ZA, Kane CM (prosinec 1997). "Genomická charakterizace genu TFIIS (TCEA2) specifického pro varlata". Genomika. 46 (3): 516–9. doi:10.1006 / geno.1997.5073. PMID 9441762.

[pmid8566795-6] Umehara T, Kida S, Yamamoto T, Horikoshi M (prosinec 1995). "Izolace a charakterizace cDNA kódující nový typ lidského transkripčního elongačního faktoru S-II". Gen. 167 (1–2): 297–302. doi:10.1016/0378-1119(95)00634-6. PMID 8566795.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: TCEA2 transkripční elongační faktor A (SII), 2".

[pmid16189514-8] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (říjen 2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]