TAX1BP3 - TAX1BP3

TAX1BP3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2KG2, 2L4S, 2L4T, 2VZ5, 3GJ9, 3SFJ, 4E3B, 4NNL, 4NNM
Identifikátory
Aliasy	TAX1BP3, TIP-1, TIP1, protein vázající Tax1 3
Externí ID	OMIM: 616484 MGI: 1923531 HomoloGene: 8749 Genové karty: TAX1BP3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	3,668,679 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	73,183,162 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba beta-katenin; • vazba na C-konec proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • buněčná membrána; • extracelulární exosom; • membrána; • buněčné jádro; • fibrilární centrum; • aktinový cytoskelet; • intracelulární membránou vázaná organela;
Biologický proces	• negativní regulace signální dráhy Wnt; • negativní regulace lokalizace proteinu na buněčný povrch; • regulace signální dráhy Wnt; • Wnt signální cesta; • Rho proteinová signální transdukce; • GO: 0032861, GO: 0032862, GO: 0032856 aktivace aktivity GTPázy; • negativní regulace buněčné proliferace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	30851
	76281
	ENSG00000213977
	ENSMUSG00000040158
	O14907
	Q9DBG9
	NM_014604; NM_001204698
	NM_029564
	NP_001191627; NP_055419
	NP_083840
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein vázající se na Tax1 3 je protein že u lidí je kódován TAX1BP3 gen.^[5]^[6]^[7] Tento název odkazuje na Daň1 protein z Lidský T-buněčný lymfotropní virus (HTLV), který byl použit k objevení Tax1BP3 na kvasinkové 2-hybridní obrazovce a následně ověřen společná IP. TIP1, jak je také známo, je a Doména PDZ obsahující bílkoviny. Avšak na rozdíl od většiny proteinů domény PDZ, které fungují jako lešení a často obsahují více domén PDZ i jiných proteinových domén, je TIP1 v podstatě pouze doménou PDZ. To vedlo ke spekulacím, že TIP1 funguje jako inhibitor buď působením k oddělení motivů vázajících PDZ od jejich normálních cílů, nebo jednoduše zabránění migraci proteinu z cytosol.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000213977 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040158 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (červen 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anal Biochem. 236 (1): 107–113. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
^ Touchman JW, Anikster Y, Dietrich NL, Maduro VV, McDowell G, Shotelersuk V, Bouffard GG, Beckstrom-Sternberg SM, Gahl WA, Green ED (březen 2000). „Genomová oblast zahrnující gen pro nefropatickou cystinózu (CTNS): kompletní sekvenování 200 kb segmentu a objev nového genu v rámci běžné delece způsobující cystinózu“. Genome Res. 10 (2): 165–173. doi:10.1101 / gr.10.2.165. PMC 310836. PMID 10673275.
^ "Entrez Gene: TAX1BP3 Tax1 (virus lidské leukémie typu T-buněk typu I) vázající protein 3".

Další čtení

Banerjee M a kol. (2012). „Specifičnost a promiskuita v rozpoznávání bílkovin interagujících s lidskou glutaminázou: pohled z vazby vnitřního a C-koncového motivu“. Biochemie. 51 (35): 6950–6960. doi:10.1021 / bi3008033. PMC 3433589. PMID 22876914.
Rousset R, Fabre S, Desbois C a kol. (1998). „C-konec onkoproteinu HTLV-1 Tax zprostředkovává interakci s doménou PDZ buněčných proteinů“. Onkogen. 16 (5): 643–654. doi:10.1038 / sj.onc.1201567. PMID 9482110.
Reynaud C, Fabre S, Jalinot P (2000). „Protein PDZ TIP-1 interaguje s Rho efektorovým rhotekinem a podílí se na Rho signalizaci do prvku sérové odpovědi“. J. Biol. Chem. 275 (43): 33962–33968. doi:10,1074 / jbc.M000465200. PMID 10940294.
Olalla L, Aledo JC, Bannenberg G, Márquez J (2001). „C-konec lidské glutaminázy L zprostředkovává asociaci s proteiny obsahujícími doménu PDZ.“. FEBS Lett. 488 (3): 116–122. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 02373-5. PMID 11163757. S2CID 11614189.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–16903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Kanamori M, Sandy P, Marzinotto S a kol. (2003). „Protein-1 interagující s daní proteinu PDZ 1 inhibuje transkripční aktivitu beta-kateninu a růst buněk kolorektálního karcinomu“. J. Biol. Chem. 278 (40): 38758–38764. doi:10,1074 / jbc.M306324200. PMID 12874278.
Twizere JC, Kruys V, Lefèbvre L a kol. (2004). „Interakce onkoproteinů retrovirové daně s tristetraprolinem a regulace exprese faktoru alfa-tumorové nekrózy“. J. Natl. Cancer Inst. 95 (24): 1846–1859. doi:10.1093 / jnci / djg118. PMID 14679154.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–45. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Hampson L, Li C, Oliver AW a kol. (2005). „Protein PDZ Tip-1 je zisk funkčního cíle onkoproteinu HPV16 E6.“ Int. J. Oncol. 25 (5): 1249–1256. doi:10,3892 / ijo.25.5.1249. PMID 15492812.
Alewine C, Olsen O, Wade JB, Welling PA (2007). „TIP-1 má aktivitu antagonisty lešení PDZ“. Mol. Biol. Buňka. 17 (10): 4200–4211. doi:10,1091 / mbc.E06-02-0129. PMC 1635354. PMID 16855024.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000213977 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040158 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8619474-5] Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (červen 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anal Biochem. 236 (1): 107–113. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.

[pmid10673275-6] Touchman JW, Anikster Y, Dietrich NL, Maduro VV, McDowell G, Shotelersuk V, Bouffard GG, Beckstrom-Sternberg SM, Gahl WA, Green ED (březen 2000). „Genomová oblast zahrnující gen pro nefropatickou cystinózu (CTNS): kompletní sekvenování 200 kb segmentu a objev nového genu v rámci běžné delece způsobující cystinózu“. Genome Res. 10 (2): 165–173. doi:10.1101 / gr.10.2.165. PMC 310836. PMID 10673275.

[entrez-7] "Entrez Gene: TAX1BP3 Tax1 (virus lidské leukémie typu T-buněk typu I) vázající protein 3".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]