TAF7l - TAF7l
S faktorem 7 podobný asociovaný protein TATA-box také známý jako CT40 je a protein že u lidí je kódován TAF7l gen.[5] Je to blízký homolog k TAF7 gen, i když jeho funkce se může lišit. V současné době je o tomto genu známo jen málo. Původně bylo prokázáno, že jde o gen specifický pro varlata na základě experimentů RT-PCR na tkáňových extraktech,[5] nyní však byl nalezen v bílé a hnědé tukové tkáni,[6] stejně jako u některých typů rakoviny.[7]
Funkce
Funkce při tvorbě tukové tkáně
Studie provedené na knockoutovaných zvířatech odhalily, že Taf7l významně přispívá ke stanovení osudu mezenchymálních kmenových buněk. Důležité je, že Zhou a kol.[6] zjistil, že v Taf7L−/− (Taf7L knockout) zvířata mají snížené tukové polštářky, které jsou infiltrovány tkáněmi kosterního svalstva. Použitím RNA-seq a Gene Ontology Enrichment (GO) tato stejná skupina zjistila, že došlo ke zvýšení GO pojmů (a tedy kategorií genů), které se podílely na vývoji kostry a svalů. Zkombinováno s in vitro Důkazy ukazují, že Taf7l je schopen zahájit produkci hnědého tuku (tzv. zdravého tuku). Dále zjistili, že společně s PPARgamma může Taf7l pravděpodobně regulovat vazbu komplexu TFIID / RNA Polymeráza II (RNAP II). Konkrétně přítomnost Taf7l může změnit smyčky chromatinu, a tedy asociaci distálních zesilovacích sekvencí s promotory specifických genů BAT, jako jsou Cidea a Scd1.
Funkce v rakovině
Nedávno, mutace posunu snímků bylo zjištěno, že je přítomen u 3 pacientů s kolorektální karcinom.[7] Konkrétně bylo zjištěno, že poly-A mononukleotidové repetiční oblasti v Exonu 6 Taf7l chybí jeden nukleotid (deleční mutace), což má za následek mutaci posunu snímků. Dále bylo zjištěno, že se snížil u 58% Akutní myelogenní leukemai (AML).
Funkce v spermatogenezi: Reciprocita s TAF7
Velká část počáteční práce pochází od Pointud et al.[5] Zjistili, že Taf7l má během spermatogeneze dvojí funkčnost. V raných stádiích spermatocytů, například v primárních spermatocytech (v tomto bodě stále diploidních), je TAF7l umístěn v cytoplazmě, zatímco komplex TATA-vázající protein (TBP) je umístěn v jádře. Poté TAF7l pomalu přechází do jádra během pachytenové buňky ve střední fázi, kde také dochází k dramatickému zvýšení exprese proteinu TBP také v jádře. Navíc existuje vzájemný vztah k TAF7 výraz: Na rozdíl od TAF7l, TAF7 v raných stádiích je exprimován v jádru, a tak oddělen od TAF7l. Pak, v pozdějších fázích, kdy TAF7l přechází do jádra, což se děje v době, kdy dochází k přechodu somatické (diploidní) do zárodečné buňky (haploidní), TAF7 dramaticky klesá. To může naznačovat, že TAF7l hraje důležitou roli v regulaci TFIID během vývoje spermií. Pointud a kol. (2003) spekulují, že TAF7l může „označit“ určité geny pro expresi nebo represi v haploidním spermatocytu.
Funkce během přepisu
Definitivní role TAF7l během transkripce stále zůstává nepolapitelná. Screening s kvasinkami-2-hybrid identifikoval, že TAF7l silně interaguje s TAF1 v přesně stejné oblasti (aminokyseliny 1170-1226 z TAF1), na kterou se TAF7 váže, a inaktivuje funkci acetyltransferázy (AT) TAF1.[5] Je tedy pravděpodobné, že TAF7l sdílí podobnou roli jako TAF7 při inhibici TAF1, a tím i aktivity komplexu TFIID. TAF7l se během časné spermatogeneze lokalizuje v jiném kompartmentu vzhledem k TBP, což naznačuje funkci nezávislou na TBP, která čeká na další studium. Dodatečně, Zachycení konformace chromozomu, identifikoval roli TAF7 v přímém zprostředkování vazby zesilovacích prvků na promotorové sekvence, na které se váže TFIID.[6] To dále naznačuje, že TAF7l nahrazuje funkci TAF7, protože bylo také prokázáno, že TAF7 se váže a reguluje expresi genu (například vitamin D3 nebo hormon štítné žlázy) způsobem specifickým pro promotor. [5]
- G. S. Gupta (2. července 2006). Proteomika spermatogeneze. Springer Science & Business Media. str. 327. ISBN 9780387276557.
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000102387 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000009596 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b C d E Pointud JC, Mengus G, Brancorsini S, Monako L, Parvinen M, Sassone-Corsi P, Davidson I (květen 2003). „Intracelulární lokalizace TAF7L, paralog transkripčního faktoru TFIID podjednotky TAF7, je vývojově regulována během diferenciace zárodečných buněk u mužů“. Journal of Cell Science. 1 (116): 1847–58. doi:10.1242 / jcs.00391. PMID 12665565.
- ^ A b C https://elifesciences.org/content/3/e02811
- ^ A b Oh HR, An CH, Yoo NJ, Lee SH (červenec 2015). „Frameshift mutations of TAF7L gen, a core component for trancription by RNA polymerase II, in colorectal cancer“. Patologie onkologického výzkumu. 21 (3): 849–50. doi:10.1007 / s12253-014-9832-4. PMID 25098277.