Synergin gama - Synergin gamma

SYNRG
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2MX7
Identifikátory
Aliasy	SYNRG, AP1GBP1, SYNG, synergin, gama, synergin gama
Externí ID	OMIM: 607291 MGI: 1354742 HomoloGene: 105680 Genové karty: SYNRG
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	37,609,472 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	84,044,578 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Komplex adaptéru AP-1; • Golgiho aparát; • membrána;
Biologický proces	• transport bílkovin; • transport intracelulárních proteinů; • endocytóza;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	11276
	217030
	ENSG00000275066; ENSG00000274047
	ENSMUSG00000034940
	Q9UMZ2
	Q5SV85
NM_001163544; NM_001163545; NM_001163546; NM_001163547; NM_007247;
	NM_080550; NM_198882
	NM_001115009; NM_194341
NP_001157016; NP_001157017; NP_001157018; NP_001157019; NP_009178;
	NP_542117; NP_942583
	NP_919322
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Synergin gama také známý jako AP1 podjednotka gama vázající protein 1 (AP1GBP1) je protein že u lidí je kódován SYNRG gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje protein, který interaguje s gama podjednotkou AP1 komplex clathrin-adaptér. Komplex AP1 se nachází na trans-Golgiho síť a spojuje specifické proteiny s veztriny potaženými klatrinem. Tento kódovaný protein může působit k připojení komplexu AP1 k jiným proteinům. Alternativně byly pro tento gen popsány sestřihové varianty transkriptu, které kódují různé izoformy.^[6]

Interakce

AP1GBP1 bylo prokázáno komunikovat s AP1G1^[7]^[8] a SCAMP1.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000274047 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000275066, ENSG00000274047 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034940 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Strana LJ, Sowerby PJ, Lui WW, Robinson MS (říjen 1999). „Gama-synergin: protein obsahující doménu EH, který interaguje s gama-adapinem“. J. Cell Biol. 146 (5): 993–1004. doi:10.1083 / jcb.146.5.993. PMC 2169493. PMID 10477754.
^ ^A ^b „Entrez Gene: AP1GBP1 AP1 gama podjednotka vázající protein 1“.
^ Nogi T, Shiba Y, Kawasaki M, Shiba T, Matsugaki N, Igarashi N, Suzuki M, Kato R, Takatsu H, Nakayama K, Wakatsuki S (červenec 2002). "Strukturální základ pro nábor doplňkového proteinu ušní doménou gama-adapinu". Nat. Struct. Biol. 9 (7): 527–31. doi:10.1038 / nsb808. PMID 12042876. S2CID 42630285.
^ Takatsu H, Yoshino K, Nakayama K (květen 2000). „Adaptační doména gama ušní homologie konzervovaná v gama-adapinových a GGA proteinech, které interagují s gama-synerginem“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 271 (3): 719–25. doi:10,1006 / bbrc.2000.2700. PMID 10814529.
^ Fernández-Chacón R, Achiriloaie M, Janz R, Albanesi JP, Südhof TC (duben 2000). "Funkce SCAMP1 v endocytóze". J. Biol. Chem. 275 (17): 12752–6. doi:10.1074 / jbc.275.17.12752. PMID 10777571.

Další čtení

Peyrard M, Parveneh S, Lagercrantz S, Ekman M, Fransson I, Sahlén S, Dumanski JP (1998). "Klonování, expresní vzorec a přiřazení chromozomů 16q23 lidského genu pro gama-adapin (ADTG)". Genomika. 50 (2): 275–80. doi:10.1006 / geno.1998.5289. PMID 9653655.
Hirst J, Lui WW, Bright NA, Totty N, Seaman MN, Robinson MS (2000). „Rodina proteinů s gama-adapinovými a VHS doménami, které usnadňují obchodování mezi trans-Golgiho sítí a vakuolem / lysozomem“. J. Cell Biol. 149 (1): 67–80. doi:10.1083 / jcb.149.1.67. PMC 2175106. PMID 10747088.
Fernández-Chacón R, Achiriloaie M, Janz R, Albanesi JP, Südhof TC (2000). "Funkce SCAMP1 v endocytóze". J. Biol. Chem. 275 (17): 12752–6. doi:10.1074 / jbc.275.17.12752. PMID 10777571.
Takatsu H, Yoshino K, Nakayama K (2000). „Adaptační doména gama ušní homologie konzervovaná v gama-adapinových a GGA proteinech, které interagují s gama-synerginem“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 271 (3): 719–25. doi:10,1006 / bbrc.2000.2700. PMID 10814529.
Nogi T, Shiba Y, Kawasaki M, Shiba T, Matsugaki N, Igarashi N, Suzuki M, Kato R, Takatsu H, Nakayama K, Wakatsuki S (2002). "Strukturální základ pro nábor doplňkového proteinu ušní doménou gama-adapinu". Nat. Struct. Biol. 9 (7): 527–31. doi:10.1038 / nsb808. PMID 12042876. S2CID 42630285.
Kent HM, McMahon HT, Evans PR, Benmerah A, Owen DJ (2002). „Doména přílohy gama-adapinu: struktura a vazebné místo pro Eps15 a gama-synergin“. Struktura. 10 (8): 1139–48. doi:10.1016 / S0969-2126 (02) 00801-8. PMID 12176391.
Mills IG, Praefcke GJ, Vallis Y, Peter BJ, Olesen LE, Gallop JL, Butler PJ, Evans PR, McMahon HT (2003). „EpsinR: AP1 / klatrin interagující protein podílející se na obchodování vezikul“. J. Cell Biol. 160 (2): 213–22. doi:10.1083 / jcb.200208023. PMC 2172650. PMID 12538641.
Lui WW, Collins BM, Hirst J, Motley A, Millar C, Schu P, Owen DJ, Robinson MS (2003). „Vazební partneři pro koncové přídatné domény COOH GGA a gamma-adapinu“. Mol. Biol. Buňka. 14 (6): 2385–98. doi:10,1091 / mbc.E02-11-0735. PMC 194887. PMID 12808037.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Hirst J, Borner GH, Harbor M, Robinson MS (2005). „Komplex aftifilin / p200 / gama-synergin“. Mol. Biol. Buňka. 16 (5): 2554–65. doi:10,1091 / mbc.E04-12-1077. PMC 1087257. PMID 15758025.
Theos AC, Tenza D, Martina JA, Hurbain I, Peden AA, Sviderskaya EV, Stewart A, Robinson MS, Bennett DC, Cutler DF, Bonifacino JS, Marks MS, Raposo G (2005). „Funkce adaptačního proteinu (AP) -3 a AP-1 při třídění tyrosinázy od endosomů po melanosomy“. Mol. Biol. Buňka. 16 (11): 5356–72. doi:10,1091 / mbc.E05-07-0626. PMC 1266432. PMID 16162817.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000274047 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000275066, ENSG00000274047 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034940 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10477754-5] Strana LJ, Sowerby PJ, Lui WW, Robinson MS (říjen 1999). „Gama-synergin: protein obsahující doménu EH, který interaguje s gama-adapinem“. J. Cell Biol. 146 (5): 993–1004. doi:10.1083 / jcb.146.5.993. PMC 2169493. PMID 10477754.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: AP1GBP1 AP1 gama podjednotka vázající protein 1“.

[pmid12042876-7] Nogi T, Shiba Y, Kawasaki M, Shiba T, Matsugaki N, Igarashi N, Suzuki M, Kato R, Takatsu H, Nakayama K, Wakatsuki S (červenec 2002). "Strukturální základ pro nábor doplňkového proteinu ušní doménou gama-adapinu". Nat. Struct. Biol. 9 (7): 527–31. doi:10.1038 / nsb808. PMID 12042876. S2CID 42630285.

[pmid10814529-8] Takatsu H, Yoshino K, Nakayama K (květen 2000). „Adaptační doména gama ušní homologie konzervovaná v gama-adapinových a GGA proteinech, které interagují s gama-synerginem“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 271 (3): 719–25. doi:10,1006 / bbrc.2000.2700. PMID 10814529.

[pmid10777571-9] Fernández-Chacón R, Achiriloaie M, Janz R, Albanesi JP, Südhof TC (duben 2000). "Funkce SCAMP1 v endocytóze". J. Biol. Chem. 275 (17): 12752–6. doi:10.1074 / jbc.275.17.12752. PMID 10777571.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]