SCAMP1 - SCAMP1

SCAMP1
Identifikátory
Aliasy	SCAMP1, SCAMP, SCAMP37, sekreční nosičový membránový protein 1
Externí ID	OMIM: 606911 MGI: 1349480 HomoloGene: 37975 Genové karty: SCAMP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	78,480,739 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	94,285,857 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• membrána; • integrální součást membrány; • endozom; • recyklace endosomové membrány; • trans-Golgiho síť; • Golgiho aparát; • synapse; • synaptická vezikulární membrána; • membrána zymogenové granule; • vezikul potažený klatrinem; • buněčná membrána; • specifická granulovaná membrána; • cytoplazmatická vezikulární membrána; • Golgiho membrána; • trans-Golgiho síťová membrána;
Biologický proces	• transport bílkovin; • transport zprostředkovaný vezikulemi po Golgi; • exocytóza; • degranulace neutrofilů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9522
	107767
	ENSG00000085365
	ENSMUSG00000021687
	O15126
	Q8K021
	NM_001290229; NM_004866; NM_052822
	NM_029153; NM_001346609
	NP_001277158; NP_004857
	NP_001333538; NP_083429
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Membránový protein spojený se sekrečním nosičem 1 je protein že u lidí je kódován SCAMP1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento genový produkt patří do rodiny proteinů SCAMP, které jsou sekrečními nosnými membránovými proteiny. Fungují jako nosiče na povrchu buněk v postgolgiho recyklačních cestách. Různí členové rodiny jsou vysoce příbuzné produkty odlišných genů a obvykle se vyjadřují společně. Tato zjištění naznačují, že SCAMP mohou fungovat na stejném místě během vezikulárního transportu spíše než v samostatných drahách.^[6]

Interakce

SCAMP1 bylo prokázáno komunikovat s ITSN1^[7] a AP1GBP1.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000085365 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021687 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Singleton DR, Wu TT, Castle JD (září 1997). „Tři savčí SCAMP (sekreční nosné membránové proteiny) jsou vysoce příbuzné produkty odlišných genů, které mají podobnou subcelulární distribuci“. Journal of Cell Science. 110. 110 (Pt 17): 2099–107. PMID 9378760.
^ ^A ^b "Entrez Gene: SCAMP1 sekreční nosičový membránový protein 1".
^ ^A ^b Fernández-Chacón R, Achiriloaie M, Janz R, Albanesi JP, Südhof TC (duben 2000). "Funkce SCAMP1 v endocytóze". The Journal of Biological Chemistry. 275 (17): 12752–6. doi:10.1074 / jbc.275.17.12752. PMID 10777571.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Značka SH, Castle JD (říjen 1993). „SCAMP 37, nový marker v obecném systému recyklace povrchu buněk“. Časopis EMBO. 12 (10): 3753–61. doi:10.1002 / j.1460-2075.1993.tb06053.x. PMC 413657. PMID 8404846.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (duben 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Analytická biochemie. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (duben 1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Výzkum genomu. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Wu TT, Castle JD (červenec 1997). "Důkazy pro kolokalizaci a interakci mezi 37 a 39 kDa izoformami sekrečních nosných membránových proteinů (SCAMPs)". Journal of Cell Science. 110. 110 (Pt 13): 1533–41. PMID 9224770.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Mao M, Fu G, Wu JS, Zhang QH, Zhou J, Kan LX, Huang QH, He KL, Gu BW, Han ZG, Shen Y, Gu J, Yu YP, Xu SH, Wang YX, Chen SJ, Chen Z (Červenec 1998). "Identifikace genů exprimovaných v lidských CD34 (+) hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách pomocí exprimovaných sekvenčních značek a účinného klonování cDNA v plné délce". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (14): 8175–80. doi:10.1073 / pnas.95.14.8175. PMC 20949. PMID 9653160.
Wu TT, Castle JD (červenec 1998). „Tyrosinová fosforylace vybraných sekrečních nosných membránových proteinů, SCAMP1 a SCAMP3 a asociace s receptorem EGF“. Molekulární biologie buňky. 9 (7): 1661–74. doi:10,1091 / mbc.9.7.1661. PMC 25404. PMID 9658162.
Fernández-Chacón R, Achiriloaie M, Janz R, Albanesi JP, Südhof TC (duben 2000). "Funkce SCAMP1 v endocytóze". The Journal of Biological Chemistry. 275 (17): 12752–6. doi:10.1074 / jbc.275.17.12752. PMID 10777571.
Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (říjen 2000). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Výzkum genomu. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Bell AW, Ward MA, Blackstock WP, Freeman HN, Choudhary JS, Lewis AP, Chotai D, Fazel A, Gushue JN, Paiement J, Palcy S, Chevet E, Lafrenière-Roula M, Solari R, Thomas DY, Rowley A, Bergeron JJ (únor 2001). "Proteomická charakterizace hojných Golgiho membránových proteinů". The Journal of Biological Chemistry. 276 (7): 5152–65. doi:10,1074 / jbc.M006143200. PMID 11042173.
Fernández-Chacón R, Südhof TC (listopad 2000). „Nové SCAMPy postrádající opakování NPF: všudypřítomné a synaptické formy specifické pro vezikuly implikují SCAMPs ve více funkcích přenosu membrány“. The Journal of Neuroscience. 20 (21): 7941–50. doi:10.1523 / JNEUROSCI.20-21-07941.2000. PMC 6772721. PMID 11050114.
Guo Z, Liu L, Cafiso D, Castle D (září 2002). „Porucha velmi pozdního kroku regulované exocytózy peptidem derivovaným ze sekrečního nosného membránového proteinu (SCAMP2)“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (38): 35357–63. doi:10,1074 / jbc.M202259200. PMID 12124380.
Liu L, Guo Z, Tieu Q, Castle A, Castle D (prosinec 2002). "Role sekrečního nosného membránového proteinu SCAMP2 v exocytóze granulí". Molekulární biologie buňky. 13 (12): 4266–78. doi:10,1091 / mbc.E02-03-0136. PMC 138632. PMID 12475951.
Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). „Nedoceněná role pro dohled nad RNA“. Genome Biology. 5 (2): R8. doi:10.1186 / gb-2004-5-2-r8. PMC 395752. PMID 14759258.
Lin PJ, Williams WP, Luu Y, Molday RS, Orlowski J, Numata M (květen 2005). „Sekreční nosné membránové proteiny interagují a regulují přenos organelárního (Na +, K +) / H + výměníku NHE7“. Journal of Cell Science. 118 (Pt 9): 1885–1897. doi:10.1242 / jcs.02315. PMID 15840657.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000085365 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021687 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9378760-5] Singleton DR, Wu TT, Castle JD (září 1997). „Tři savčí SCAMP (sekreční nosné membránové proteiny) jsou vysoce příbuzné produkty odlišných genů, které mají podobnou subcelulární distribuci“. Journal of Cell Science. 110. 110 (Pt 17): 2099–107. PMID 9378760.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: SCAMP1 sekreční nosičový membránový protein 1".

[pmid10777571-7] A ^b Fernández-Chacón R, Achiriloaie M, Janz R, Albanesi JP, Südhof TC (duben 2000). "Funkce SCAMP1 v endocytóze". The Journal of Biological Chemistry. 275 (17): 12752–6. doi:10.1074 / jbc.275.17.12752. PMID 10777571.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]