Syndecan-2 - Syndecan-2

SDC2
Identifikátory
Aliasy	SDC2, CD362, HSPG, HSPG1, SYND2, syndecan 2
Externí ID	OMIM: 142460 MGI: 1349165 HomoloGene: 2253 Genové karty: SDC2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	96,611,790 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	33,034,935 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba domény PDZ; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • membrána; • buněčná membrána; • lysozomální lumen; • Golgiho lumen; • lumen endoplazmatického retikula; • povrch buňky; • extracelulární matrix; • extracelulární matrix obsahující kolagen;
Biologický proces	• metabolický proces glykosaminoglykanu; • diferenciace buněk; • signální dráha receptoru efrinu; • vývoj nervového systému; • metabolický proces retinoidů; • regulace morfogeneze dendritů; • bioluminiscence; • glykosaminoglykan katabolický proces; • proces biosyntézy glykosaminoglykanu; • migrace leukocytů; • posttranslační modifikace; • buněčný proteinový metabolický proces; • migrace buněk; • dendritická morfogeneze; • biologický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6383
	15529
	ENSG00000169439
	ENSMUSG00000022261
	P34741
	P43407
	NM_002998
	NM_008304
	NP_002989
	NP_032330
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Syndecan-2 je protein že u lidí je kódován SDC2 gen.^[5]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem je transmembránový (typ I) heparan sulfát proteoglykan a je členem rodiny syndekanových proteoglykanů. Syndekany zprostředkovávají buněčnou vazbu, buněčnou signalizaci a cytoskeletální organizaci a syndekanové receptory jsou nutné pro internalizaci proteinu HIV-1 tat. Syndekan-2 protein funguje jako integrální membránový protein a prostřednictvím svého receptoru pro proteiny extracelulární matrix se účastní buněčné proliferace, buněčné migrace a interakcí buněčné matrice. Změněná exprese syndekanu-2 byla detekována u několika různých typů nádorů.^[6]

Interakce

SDC2 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169439 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022261 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ David G, Bai XM, Van der Schueren B, Marynen P, Cassiman JJ, Van den Berghe H (červen 1994). „Prostorové a časové změny v expresi fibroglykanu (syndekan-2) během embryonálního vývoje myší“. Rozvoj. 119 (3): 841–54. PMID 8187643.
^ „Entrez Gene: SDC2 syndecan 2“.
^ Maximov A, Tang TS, Bezprozvanny I (únor 2003). „Sdružení inositol (1,4,5) -trisfosfátového receptoru typu 1 s 4,1 N proteinem v neuronech“. Mol. Buňka. Neurosci. 22 (2): 271–83. doi:10.1016 / s1044-7431 (02) 00027-1. PMID 12676536. S2CID 2317354.
^ Cohen AR, Woods DF, Marfatia SM, Walther Z, Chishti AH, Anderson JM, Wood DF (červenec 1998). "Lidský CASK / LIN-2 váže syndekan-2 a protein 4.1 a lokalizuje se na bazolaterální membránu epiteliálních buněk". J. Cell Biol. 142 (1): 129–38. doi:10.1083 / jcb.142.1.129. PMC 2133028. PMID 9660868.
^ Utani A, Nomizu M, Matsuura H, Kato K, Kobayashi T, Takeda U, Aota S, Nielsen PK, Shinkai H (srpen 2001). „Unikátní sekvence lamininové alfa 3 G domény se váže na heparin a podporuje adhezi buněk prostřednictvím syndekanu-2 a -4“. J. Biol. Chem. 276 (31): 28779–88. doi:10,1074 / jbc.M101420200. PMID 11373281.
^ Granés F, Urena JM, Rocamora N, Vilaró S (duben 2000). "Ezrin spojuje syndekan-2 s cytoskeletem". J. Cell Sci. 113 (Pt 7): 1267–76. PMID 10704377.

Další čtení

Mahley RW, Ji ZS (1999). „Zbytkový metabolismus lipoproteinů: klíčové cesty zahrnující proteoglykany heparansulfátu na buněčném povrchu a apolipoprotein E.“. J. Lipid Res. 40 (1): 1–16. PMID 9869645.
Labarrere CA, Pitts D, Halbrook H, Faulk WP (1992). "Přírodní antikoagulační cesty v normálních a transplantovaných lidských srdcích". J. Transplantace plic srdce. 11 (2 Pt 1): 342–7. PMID 1315572.
Marynen P, Zhang J, Cassiman JJ, Van den Berghe H, David G (1989). „Částečná primární struktura 48- a 90kilových proteinů jádra proteinů heparansulfátu asociovaných s buněčným povrchem plicních fibroblastů. Predikce integrální membránové domény a důkazy pro více odlišných základních proteinů na buněčném povrchu lidských plicních fibroblastů“. J. Biol. Chem. 264 (12): 7017–24. PMID 2523388.
Sage H, Vernon RB, Funk SE, Everitt EA, Angello J (1989). „SPARC, vylučovaný protein spojený s buněčnou proliferací, inhibuje šíření buněk in vitro a vykazuje vazbu Ca + 2 závislou na extracelulární matrici“. J. Cell Biol. 109 (1): 341–56. doi:10.1083 / jcb.109.1.341. PMC 2115491. PMID 2745554.
Lories V, De Boeck H, David G, Cassiman JJ, Van den Berghe H (1987). „Heparan sulfátové proteoglykany lidských plicních fibroblastů. Strukturální heterogenita základních proteinů forem asociovaných s hydrofobními buňkami“. J. Biol. Chem. 262 (2): 854–9. PMID 2948951.
Brown KJ, Parish CR (1994). „Glykoprotein bohatý na histidiny a destičkový faktor 4 maskují heparansulfátové proteoglykany rozpoznávané kyselým a bazickým fibroblastovým růstovým faktorem“. Biochemie. 33 (46): 13918–27. doi:10.1021 / bi00250a047. PMID 7524669.
Bolton P, Powell J, Rutter M, Buckle V, Yates JR, Ishikawa-Brush Y, Monaco AP (1995). „Autismus, mentální retardace, mnohočetné exostózy a nízký vzrůst u žen s 46, X, t (X; 8) (p22.13; q22.1)“. Psychiatr. Genet. 5 (2): 51–5. doi:10.1097/00041444-199522000-00001. PMID 7551962. S2CID 45132642.
Barillari G, Gendelman R, Gallo RC, Ensoli B (1993). „Tat protein viru lidské imunodeficience typu 1, růstový faktor pro AIDS Kaposiho sarkom a vaskulární buňky aktivované cytokiny, indukuje adhezi stejných typů buněk pomocí integrinových receptorů rozpoznávajících aminokyselinovou sekvenci RGD.“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 90 (17): 7941–5. doi:10.1073 / pnas.90.17.7941. PMC 47263. PMID 7690138.
Lyon M, Deakin JA, Mizuno K, Nakamura T, Gallagher JT (1994). "Interakce růstového faktoru hepatocytů s heparan sulfátem. Elucidace hlavních strukturních determinantů heparan sulfátu". J. Biol. Chem. 269 (15): 11216–23. PMID 8157651.
Albini A, Benelli R, Presta M, Rusnati M, Ziche M, Rubartelli A, Paglialunga G, Bussolino F, Noonan D (1996). „HIV-tat protein je heparin vázající angiogenní růstový faktor“. Onkogen. 12 (2): 289–97. PMID 8570206.
Soussi-Yanicostas N, Hardelin JP, Arroyo-Jimenez MM, Ardouin O, Legouis R, Levilliers J, Traincard F, Betton JM, Cabanié L, Petit C (1997). „Počáteční charakterizace anosminu-1, domnělého proteinu extracelulární matrice syntetizovaného definitivními populacemi neuronových buněk v centrálním nervovém systému“. J. Cell Sci. 109 (7): 1749–57. PMID 8832397.
Christa L, Carnot F, Simon MT, Levavasseur F, Stinnakre MG, Lasserre C, Thepot D, Clement B, Devinoy E, Brechot C (1997). „HIP / PAP je adhezivní protein exprimovaný v hepatokarcinomu, normálních Panethových a pankreatických buňkách“. Dopoledne. J. Physiol. 271 (6 Pt 1): G993–1002. doi:10.1152 / ajpgi.1996.271.6.G993. PMID 8997243.
Rusnati M, Coltrini D, Oreste P, Zoppetti G, Albini A, Noonan D, d'Adda di Fagagna F, Giacca M, Presta M (1997). "Interakce proteinu HIV-1 Tat s heparinem. Role struktury páteře, sulfatace a velikosti". J. Biol. Chem. 272 (17): 11313–20. doi:10.1074 / jbc.272.17.11313. PMID 9111037.
Oh ES, Couchman JR, Woods A (1997). "Serinová fosforylace cytoplazmatické domény proteekan-2 syndekanu-2". Oblouk. Biochem. Biophys. 344 (1): 67–74. doi:10.1006 / abbi.1997.0180. PMID 9244383.
Ishikawa-Brush Y, Powell JF, Bolton P, Miller AP, Francis F, Willard HF, Lehrach H, Monaco AP (1997). „Autismus a mnohočetné exostózy spojené s X; 8 translokací vyskytující se v genu GRPR a 3 'na gen SDC2“. Hučení. Mol. Genet. 6 (8): 1241–50. doi:10,1093 / hmg / 6.8.1241. PMID 9259269.
Chang HC, Samaniego F, Nair BC, Buonaguro L, Ensoli B (1997). „HIV-1 Tat protein vystupuje z buněk sekreční cestou bez vedoucího proteinu a váže se na svou bazální oblast na proteoglykany heparansulfátu spojené s extracelulární matricí“. AIDS. 11 (12): 1421–31. doi:10.1097/00002030-199712000-00006. PMID 9342064. S2CID 7648619.
Grootjans JJ, Zimmermann P, Reekmans G, Smets A, Degeest G, Dürr J, David G (1998). „Syntenin, protein PDZ, který váže cytoplazmatické domény syndekanu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94 (25): 13683–8. doi:10.1073 / pnas.94.25.13683. PMC 28366. PMID 9391086.
Cohen AR, Woods DF, Marfatia SM, Walther Z, Chishti AH, Anderson JM, Wood DF (1998). "Lidský CASK / LIN-2 váže syndekan-2 a protein 4.1 a lokalizuje se na bazolaterální membránu epiteliálních buněk". J. Cell Biol. 142 (1): 129–38. doi:10.1083 / jcb.142.1.129. PMC 2133028. PMID 9660868.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169439 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022261 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8187643-5] David G, Bai XM, Van der Schueren B, Marynen P, Cassiman JJ, Van den Berghe H (červen 1994). „Prostorové a časové změny v expresi fibroglykanu (syndekan-2) během embryonálního vývoje myší“. Rozvoj. 119 (3): 841–54. PMID 8187643.

[entrez-6] „Entrez Gene: SDC2 syndecan 2“.

[pmid12676536-7] Maximov A, Tang TS, Bezprozvanny I (únor 2003). „Sdružení inositol (1,4,5) -trisfosfátového receptoru typu 1 s 4,1 N proteinem v neuronech“. Mol. Buňka. Neurosci. 22 (2): 271–83. doi:10.1016 / s1044-7431 (02) 00027-1. PMID 12676536. S2CID 2317354.

[pmid9660868-8] Cohen AR, Woods DF, Marfatia SM, Walther Z, Chishti AH, Anderson JM, Wood DF (červenec 1998). "Lidský CASK / LIN-2 váže syndekan-2 a protein 4.1 a lokalizuje se na bazolaterální membránu epiteliálních buněk". J. Cell Biol. 142 (1): 129–38. doi:10.1083 / jcb.142.1.129. PMC 2133028. PMID 9660868.

[pmid11373281-9] Utani A, Nomizu M, Matsuura H, Kato K, Kobayashi T, Takeda U, Aota S, Nielsen PK, Shinkai H (srpen 2001). „Unikátní sekvence lamininové alfa 3 G domény se váže na heparin a podporuje adhezi buněk prostřednictvím syndekanu-2 a -4“. J. Biol. Chem. 276 (31): 28779–88. doi:10,1074 / jbc.M101420200. PMID 11373281.

[pmid10704377-10] Granés F, Urena JM, Rocamora N, Vilaró S (duben 2000). "Ezrin spojuje syndekan-2 s cytoskeletem". J. Cell Sci. 113 (Pt 7): 1267–76. PMID 10704377.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]