Povrchově aktivní protein D - Surfactant protein D

SFTPD
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1B08, 1M7L, 1PW9, 1PWB, 2GGU, 2GGX, 2ORJ, 2ORK, 2OS9, 2RIA, 2RIB, 2RIC, 2RID, 2RIE, 3DBZ, 3G81, 3G83, 3G84, 3IKN, 3IKP, 3IKQ, 3IKR, 4E52, 4M17, 4M18
Identifikátory
Aliasy	SFTPDCOLEC7, PSP-D, SFTP4, SP-D, povrchově aktivní protein D
Externí ID	OMIM: 178635 MGI: 109515 HomoloGene: 2272 Genové karty: SFTPD
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	79,982,614 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 14 (myš)
Konec	41,185,149 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vázání sacharidů; • identická vazba na protein; • vázání lipopolysacharidů; • vazba monosacharidů;
Buněčná složka	• cytoplazma; • kolagen; • membrána endoplazmatického retikula; • klatrinem potažený endocytický váček; • endocytický váček; • extracelulární oblast; • lysozom; • extracelulární; • multivezikulární tělo; • hrubé endoplazmatické retikulum;
Biologický proces	• homeostáza povrchově aktivní látky; • buněčný proteinový metabolický proces; • pozitivní regulace fagocytózy; • proces imunitního systému; • receptorem zprostředkovaná endocytóza; • respirační plynná výměna; • metabolický proces reaktivních forem kyslíku; • regulace produkce cytokinů; • negativní regulace proliferace T buněk; • makrofágová chemotaxe; • obranná reakce na bakterii; • regulace imunitní odpovědi; • vývoj plicních alveol; • vrozený imunitní systém; • signální dráha podobná mýtnému receptoru; • indukce bakteriální aglutinace; • negativní regulace hostitelem molekulární funkce symbiontu; • regulace adheze symbiontu k hostitelské epiteliální buňce; • vývojový proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	6441
	20390
	ENSG00000133661
	ENSMUSG00000021795
	P35247
	P50404
	NM_003019
	NM_009160
	NP_003010
	NP_033186
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Povrchově aktivní protein D, také známý jako SFTPD nebo SP-D, je protein který je u lidí kódován SFTPD gen.^[5]^[6]

SFTPD je vrozený imunitní systém sbírat.^[7]^[8]

Interakce

Bylo prokázáno, že povrchově aktivní protein D komunikovat s DMBT1,^[9]^[10] a hemaglutinin z virus chřipky A..^[11] Posttranslační modifikace SP-D, tj. S-nitrosylace, přepíná jeho funkci.^[12]^[13]^[14]

Viz také

plicní povrchově aktivní látka

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000133661 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021795 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Rust K, Grosso L, Zhang V, Chang D, Persson A, Longmore W a kol. (Říjen 1991). „Lidský povrchově aktivní protein D: SP-D obsahuje rozpoznávací doménu sacharidů pro lektin typu C“. Archivy biochemie a biofyziky. 290 (1): 116–26. doi:10.1016 / 0003-9861 (91) 90597-C. PMID 1898081.
^ Lu J, Willis AC, Reid KB (červen 1992). "Čištění, charakterizace a klonování cDNA proteinu lidského plicního surfaktantu D". The Biochemical Journal. 284. 284 (Pt 3) (3): 795–802. doi:10.1042 / bj2840795. PMC 1132609. PMID 1339284.
^ „Entrez Gene: povrchově aktivní látka SFTPD, protein D spojený s plicemi“.
^ Brandt EB, Mingler MK, Stevenson MD, Wang N, Khurana Hershey GK, Whitsett JA, Rothenberg ME (květen 2008). „Povrchově aktivní protein D mění alergické plicní reakce u myší a lidských subjektů“. The Journal of Allergy and Clinical Immunology. 121 (5): 1140–1147.e2. doi:10.1016 / j.jaci.2008.02.011. PMC 4145593. PMID 18355911.
^ Tino MJ, Wright JR (duben 1999). „Glykoprotein-340 váže povrchově aktivní protein-A (SP-A) a stimuluje migraci alveolárních makrofágů způsobem nezávislým na SP-A“. American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 20 (4): 759–68. doi:10.1165 / ajrcmb.20.4.3439. PMID 10101009. S2CID 29437779.
^ Holmskov U, Lawson P, Teisner B, Tornoe I, Willis AC, Morgan C a kol. (Květen 1997). „Izolace a charakterizace nového člena superrodiny zachycovacího receptoru, glykoproteinu-340 (gp-340), jako molekuly vázající protein plicní surfaktant protein-D“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (21): 13743–9. doi:10.1074 / jbc.272.21.13743. PMID 9153228.
^ Goh BC, Rynkiewicz MJ, Cafarella TR, White MR, Hartshorn KL, Allen K a kol. (Listopad 2013). „Molekulární mechanismy inhibice chřipky povrchově aktivním proteinem D odhalené rozsáhlou simulací molekulární dynamiky“. Biochemie. 52 (47): 8527–38. doi:10.1021 / bi4010683. PMC 3927399. PMID 24224757.
^ Guo CJ, Atochina-Vasserman EN, Abramova E, Foley JP, Zaman A, Crouch E a kol. (Listopad 2008). "S-nitrosylace surfaktantu protein-D řídí zánětlivou funkci". PLOS Biology. 6 (11): e266. doi:10.1371 / journal.pbio.0060266. PMC 2581630. PMID 19007302.
^ Atochina-Vasserman EN, Guo CJ, Abramova E, Golden TN, Sims M, James ML a kol. (Červenec 2015). "Dysfunkce povrchově aktivní látky a zánět plic u modelu myší samice lymfangioleiomyomatózy". American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 53 (1): 96–104. doi:10.1165 / rcmb.2014-0224OC. PMC 4566108. PMID 25474372.
^ Atochina-Vasserman EN, Winkler C, Abramova H, Schaumann F, Krug N, Gow AJ a kol. (Duben 2011). „Segmentální alergenová výzva mění multimerní strukturu a funkci povrchově aktivního proteinu D u lidí“. American Journal of Respiratory and Critical Care Medicine. 183 (7): 856–64. doi:10,1164 / rccm.201004-0654OC. PMC 3086753. PMID 21131470.

Další čtení

Atochina-Vasserman EN, Beers MF, Kadire H, Tomer Y, Inch A, Scott P a kol. (Prosinec 2007). „Selektivní inhibice indukovatelné aktivity NO syntázy in vivo zvrací zánětlivé abnormality u myší s deficitem D povrchově aktivního proteinu“. Journal of Immunology. 179 (12): 8090–7. doi:10,4049 / jimmunol.179.12.8090. PMC 4009628. PMID 18056350.
Guo CJ, Atochina-Vasserman EN, Abramova E, Foley JP, Zaman A, Crouch E a kol. (Listopad 2008). "S-nitrosylace surfaktantu protein-D řídí zánětlivou funkci". PLOS Biology. 6 (11): e266. doi:10.1371 / journal.pbio.0060266. PMC 2581630. PMID 19007302.
Hansen S, Holmskov U (srpen 1998). "Strukturální aspekty collectinů a receptorů pro collectiny". Imunobiologie. 199 (2): 165–89. doi:10.1016 / s0171-2985 (98) 80025-9. PMID 9777404.
Lu J, Willis AC, Reid KB (červen 1992). "Čištění, charakterizace a klonování cDNA proteinu lidského plicního surfaktantu D". The Biochemical Journal. 284. 284 (Pt 3) (3): 795–802. doi:10.1042 / bj2840795. PMC 1132609. PMID 1339284.
Persson AV, Gibbons BJ, Shoemaker JD, Moxley MA, Longmore WJ (prosinec 1992). „Hlavním glykolipidem rozpoznávaným SP-D v povrchově aktivní látce je fosfatidylinositol“. Biochemie. 31 (48): 12183–9. doi:10.1021 / bi00163a030. PMID 1457414.
Ogasawara Y, Kuroki Y, Akino T (říjen 1992). „Plicní surfaktantový protein D se specificky váže na fosfatidylinositol“. The Journal of Biological Chemistry. 267 (29): 21244–9. PMID 1400434.
Rust K, Grosso L, Zhang V, Chang D, Persson A, Longmore W a kol. (Říjen 1991). „Lidský surfaktantový protein D: SP-D obsahuje doménu rozpoznávání sacharidů lektinu typu lektinu“. Archivy biochemie a biofyziky. 290 (1): 116–26. doi:10.1016 / 0003-9861 (91) 90597-C. PMID 1898081.
Kuroki Y, Shiratori M, Ogasawara Y, Tsuzuki A, Akino T (listopad 1991). "Charakterizace plicního surfaktantového proteinu D: jeho kopurifikace lipidy". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - lipidy a metabolismus lipidů. 1086 (2): 185–90. doi:10.1016/0005-2760(91)90006-4. PMID 1932100.
Crouch E, Persson A, Chang D, Heuser J (červen 1994). "Molekulární struktura plicního surfaktantového proteinu D (SP-D)". The Journal of Biological Chemistry. 269 (25): 17311–9. PMID 8006040.
Schaeffer E, Guillou F, část D, Zakin MM (listopad 1993). „Jiná kombinace transkripčních faktorů moduluje expresi promotoru lidského transferinu v játrech a Sertoliho buňkách.“ The Journal of Biological Chemistry. 268 (31): 23399–408. PMID 8226864.
Kölble K, Lu J, Mole SE, Kaluz S, Reid KB (srpen 1993). "Přiřazení genu lidského plicního surfaktantového proteinu D (SFTP4) k 10q22-q23 v blízkosti klastru genu surfaktantového proteinu A". Genomika. 17 (2): 294–8. doi:10.1006 / geno.1993.1324. PMID 8406480.
Crouch E, Persson A, Chang D (leden 1993). "Akumulace povrchově aktivního proteinu D v lidské plicní alveolární proteinóze". American Journal of Pathology. 142 (1): 241–8. PMC 1886847. PMID 8424457.
Crouch E, Rust K, Veile R, Donis-Keller H, Grosso L (únor 1993). „Genomická organizace lidského surfaktantového proteinu D (SP-D). SP-D je kódován na chromozomu 10q22.2-23.1.“. The Journal of Biological Chemistry. 268 (4): 2976–83. PMID 8428971.
Rust K, Bingle L, Mariencheck W, Persson A, Crouch EC (únor 1996). "Charakterizace promotoru proteinu lidského surfaktantu D: transkripční regulace exprese genu SP-D glukokortikoidy". American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 14 (2): 121–30. doi:10.1165 / ajrcmb.14.2.8630261. PMID 8630261.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Holmskov U, Lawson P, Teisner B, Tornoe I, Willis AC, Morgan C a kol. (Květen 1997). „Izolace a charakterizace nového člena superrodiny zachycovacího receptoru, glykoproteinu-340 (gp-340), jako molekuly vázající protein plicní surfaktant protein-D“. The Journal of Biological Chemistry. 272 (21): 13743–9. doi:10.1074 / jbc.272.21.13743. PMID 9153228.
Botas C, Poulain F, Akiyama J, Brown C, Allen L, Goerke J a kol. (Září 1998). „Změněná homeostáza surfaktantu a alveolární morfologie buněk typu II u myší bez proteinu surfaktantu D“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 95 (20): 11869–74. Bibcode:1998PNAS ... 9511869B. doi:10.1073 / pnas.95.20.11869. PMC 21732. PMID 9751757.
Håkansson K, Lim NK, Hoppe HJ, Reid KB (březen 1999). "Krystalová struktura trimerní alfa-šroubovité stočené cívky a tří lektinových domén lidského plicního surfaktantového proteinu D". Struktura. 7 (3): 255–64. doi:10.1016 / S0969-2126 (99) 80036-7. PMID 10368295.
Holmskov U, Mollenhauer J, Madsen J, Vitved L, Gronlund J, Tornoe I a kol. (Září 1999). „Klonování gp-340, domnělého opsoninového receptoru pro protein D plicního surfaktantu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (19): 10794–9. Bibcode:1999PNAS ... 9610794H. doi:10.1073 / pnas.96.19.10794. PMC 17962. PMID 10485905.
Lausen M, Lynch N, Schlosser A, Tornoe I, Saekmose SG, Teisner B a kol. (Listopad 1999). „Protein 4 spojený s mikrofibrilemi je přítomen v promývání plic a váže se na kolagenovou oblast proteinu plicního surfaktantu D“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (45): 32234–40. doi:10.1074 / jbc.274.45.32234. PMID 10542261.
Madsen J, Kliem A, Tornoe I, Skjodt K, Koch C, Holmskov U (červen 2000). "Lokalizace plicního povrchově aktivního proteinu D na sliznicích v lidských tkáních". Journal of Immunology. 164 (11): 5866–70. doi:10,4049 / jimmunol.164.11.5866. PMID 10820266.
Zhang L, Ikegami M, Crouch EC, Korfhagen TR, Whitsett JA (červen 2001). „Aktivita plicního surfaktantu protein-D (SP-D) in vivo závisí na oligomerní struktuře“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (22): 19214–9. doi:10,1074 / jbc.M010191200. PMID 11278637.