DMBT1 - DMBT1

DMBT1
Identifikátory
Aliasy	DMBT1, GP340, muclin, SAG, odstraněn u maligních mozkových nádorů 1, SALSA
Externí ID	OMIM: 601969 MGI: 106210 HomoloGene: 68990 Genové karty: DMBT1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	122,643,740 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	131,121,628 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0008329 aktivita receptoru pro rozpoznávání vzorů; • vazba na bílkoviny závislá na vápníku; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba zymogenu; • vázání lipopolysacharidů; • Vazba DNA; • aktivita zachycovacího receptoru; • vázání kyseliny lipoteichoové; • vazba heparan sulfátu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • membrána fagocytických vezikul; • membrána; • membrána zymogenové granule; • extracelulární oblast; • extracelulární exosom; • vnější složka membrány; • extracelulární; • vnější strana plazmatické membrány; • extracelulární matrix;
Biologický proces	• buněčný proteinový metabolický proces; • diferenciace buněk; • diferenciace epiteliálních buněk; • vývoj mnohobuněčných organismů; • obranná reakce na virus; • transport bílkovin; • vrozený imunitní systém; • GO: virový proces 0022415; • signální dráha pro rozpoznávání receptorů; • receptorem zprostředkovaná endocytóza; • doprava; • indukce bakteriální aglutinace; • obranná odpověď na gramnegativní bakterii; • obranná odpověď na grampozitivní bakterii; • antimikrobiální humorální imunitní odpověď zprostředkovaná antimikrobiálním peptidem; • transport zprostředkovaný vezikuly; • endocytóza;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1755
	12945
	ENSG00000187908
	ENSMUSG00000047517
	Q9UGM3
	Q60997
	NM_004406; NM_007329; NM_017579; NM_001320644; NM_001377530
	NM_007769; NM_001347632
	NP_001307573; NP_004397; NP_015568; NP_060049
	NP_001334561; NP_031795
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Vypuštěno v maligních mozkových nádorech 1 protein je protein že u lidí je kódován DMBT1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Ztráta sekvencí z lidského chromozomu 10q byla spojena s progresí lidských rakovin. Gen DMBT1 byl původně izolován na základě jeho delece v buněčné linii medulloblastomu. DMBT1 je exprimován s transkripty 6,0, 7,5 a 8,0 kb ve fetálních plicích a s jedním transkriptem 8,0 kb v plicích dospělých, ačkoli transkript 7,5 kb nebyl charakterizován. Protein DMBT1 je glykoprotein obsahující více domén scavenger receptoru bohatých na cysteiny (SRCR) oddělených SRCR-rozptýlenými doménami (SID). Ukázalo se, že transkriptová varianta 2 (8,0 kb) váže povrchově aktivní protein D nezávisle na rozpoznávání sacharidů. To naznačuje, že DMBT1 nemusí být klasický tumor supresorový gen, ale spíše hraje roli v interakci nádorových buněk a imunitního systému.^[7]

Rozpoznávání vzorů a potenciální využití DMBT1 v nanomedicíně

Na epiteliálních bariérách fungují mechanismy rozpoznávání molekul jako minolovky proti škodlivým faktorům prostředí a hrají tak zásadní roli v obraně proti napadení bakteriálními a virovými patogeny. Ukázalo se však, že některé z proteinů účastnících se těchto obranných procesů hostitele mohou současně fungovat jako regulátory regenerace tkání v extracelulární matrici, a tak spojovat obranné funkce s regulací kmenových buněk. Ačkoli rozpoznávání molekulárních vzorů má složité fyziologické role a my právě začínáme chápat jeho různé funkce, jednoduchost základních principů pro rozpoznávání specifických tříd molekul může generovat nové výchozí body pro nanomedikální přístupy při podávání léků přes epiteliální bariéry. Protein DMBT1 vykazoval aktivitu rozpoznávání vzorů pro polysulfátované a polyfosforylované ligandy, včetně nukleových kyselin, a schopnost agregovat ligandy. To vyvolává zajímavou otázku, do jaké míry lze tyto vlastnosti využít k sestavení nanokomplexů s peptidy nukleových kyselin a zda je lze využít k modulování farmakologických vlastností nukleových kyselin a / nebo k dodávání nukleových kyselin do cílových buněk. ^[8] Nedávno byly peptidy odvozené od DMBT1 úspěšně využity pro intracelulární dodání siRNA. ^[9]

Interakce

DMBT1 bylo prokázáno komunikovat s Povrchově aktivní protein D.^[10]^[11] Peptidy odvozené od DMBT1 také interagují s nukleovými kyselinami. ^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000187908 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000047517 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Mollenhauer J, Wiemann S, Scheurlen W, Korn B, Hayashi Y, Wilgenbus KK, von Deimling A, Poustka A (říjen 1997). „DMBT1, nový člen superrodiny SRCR, na chromozomu 10q25.3-26.1 je odstraněn u maligních mozkových nádorů“. Nat. Genet. 17 (1): 32–9. doi:10.1038 / ng0997-32. PMID 9288095. S2CID 5274568.
^ Rosenstiel P, Sina C, End C, Renner M, Lyer S, Till A, Hellmig S, Nikolaus S, Fölsch UR, Helmke B, Autschbach F, Schirmacher P, Kioschis P, Hafner M, Poustka A, Mollenhauer J, Schreiber S (Červen 2007). „Regulace DMBT1 prostřednictvím NOD2 a TLR4 ve střevních epiteliálních buňkách moduluje bakteriální rozpoznávání a invazi“. J. Immunol. 178 (12): 8203–11. doi:10,4049 / jimmunol.178.12.8203. PMID 17548659.
^ "Entrez Gene: DMBT1 odstraněn u maligních mozkových nádorů 1".
^ Casella, Cinzia; Tuttolomondo, Martina; Høilund-Carlsen, Poul Flemming; Mollenhauer, Jan (01.01.2014). „Přirozené mechanismy rozpoznávání vzorů na epiteliálních bariérách a potenciální využití v nanomedicíně“. European Journal of Nanomedicine. 6 (3). doi:10.1515 / ejnm-2014-0020. ISSN 1662-596X. S2CID 84103470.
^ ^A ^b Tuttolomondo, Martina; Casella, Cinzia; Hansen, Pernille Lund; Polo, Ester; Herda, Luciana M .; Dawson, Kenneth A .; Ditzel, Henrik J .; Mollenhauer, Jan (2017). "Lidské peptidy prostupující buňky DMBT1 pro intracelulární dodávku siRNA". Molekulární terapie - nukleové kyseliny. 8: 264–276. doi:10.1016 / j.omtn.2017.06.020. ISSN 2162-2531. PMC 5514624. PMID 28918028.
^ Tino MJ, Wright JR (1999). „Glykoprotein-340 váže povrchově aktivní protein-A (SP-A) a stimuluje migraci alveolárních makrofágů způsobem nezávislým na SP-A“. Dopoledne. J. Respir. Cell Mol. Biol. 20 (4): 759–68. doi:10.1165 / ajrcmb.20.4.3439. PMID 10101009.
^ Holmskov U, Lawson P, Teisner B, Tornoe I, Willis AC, Morgan C, Koch C, Reid KB (1997). „Izolace a charakterizace nového člena superrodiny zachycovacího receptoru, glykoproteinu-340 (gp-340), jako molekuly vázající protein plicní surfaktant protein-D“. J. Biol. Chem. 272 (21): 13743–9. doi:10.1074 / jbc.272.21.13743. PMID 9153228.

Další čtení

Kang W, Reid KB (2003). „DMBT1, regulátor slizniční homeostázy prostřednictvím propojení obrany a regenerace sliznic?“. FEBS Lett. 540 (1–3): 21–5. doi:10.1016 / S0014-5793 (03) 00217-5. PMID 12681477. S2CID 36334379.
Robbe C, Paraskeva C, Mollenhauer J, Michalski JC, Sergi C, Corfield A (2005). "Exprese DMBT1 a glykosylace během sekvence adenom-karcinom u kolorektálního karcinomu". Biochem. Soc. Trans. 33 (Pt 4): 730–2. doi:10.1042 / BST0330730. PMID 16042587.
Rasheed BK, McLendon RE, Friedman HS, Friedman AH, Fuchs HE, Bigner DD, Bigner SH (1995). "Mapování delece chromozomu 10 v lidských gliomech: běžná deleční oblast v 10q25". Onkogen. 10 (11): 2243–6. PMID 7784070.
Holmskov U, Lawson P, Teisner B, Tornoe I, Willis AC, Morgan C, Koch C, Reid KB (1997). „Izolace a charakterizace nového člena superrodiny zachycovacího receptoru, glykoproteinu-340 (gp-340), jako molekuly vázající protein plicní surfaktant protein-D“. J. Biol. Chem. 272 (21): 13743–9. doi:10.1074 / jbc.272.21.13743. PMID 9153228.
Mori M, Shiraishi T, Tanaka S, Yamagata M, Mafune K, Tanaka Y, Ueo H, Barnard GF, Sugimachi K (1999). „Nedostatek exprese DMBT1 u rakoviny jícnu, žaludku a tlustého střeva“. Br. J. Cancer. 79 (2): 211–3. doi:10.1038 / sj.bjc.6690035. PMC 2362205. PMID 9888459.
Tino MJ, Wright JR (1999). „Glykoprotein-340 váže povrchově aktivní protein-A (SP-A) a stimuluje migraci alveolárních makrofágů způsobem nezávislým na SP-A“. Dopoledne. J. Respir. Cell Mol. Biol. 20 (4): 759–68. doi:10.1165 / ajrcmb.20.4.3439. PMID 10101009.
Holmskov U, Mollenhauer J, Madsen J, Vitved L, Gronlund J, Tornoe I, Kliem A, Reid KB, Poustka A, Skjodt K (1999). „Klonování gp-340, domnělého opsoninového receptoru pro protein D plicního surfaktantu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 96 (19): 10794–9. Bibcode:1999PNAS ... 9610794H. doi:10.1073 / pnas.96.19.10794. PMC 17962. PMID 10485905.
Takeshita H, Sato M, Shiwaku HO, Semba S, Sakurada A, Hoshi M, Hayashi Y, Tagawa Y, Ayabe H, Horii A (1999). „Exprese genu DMBT1 je často potlačována u lidské rakoviny plic“. Jpn. J. Cancer Res. 90 (9): 903–8. doi:10.1111 / j.1349-7006.1999.tb00833.x. PMC 5926167. PMID 10551316.
Mollenhauer J, Holmskov U, Wiemann S, Krebs I, Herbertz S, Madsen J, Kioschis P, Coy JF, Poustka A (1999). "Genomická struktura genu DMBT1: důkazy pro oblast s náchylností k genomové nestabilitě". Onkogen. 18 (46): 6233–40. doi:10.1038 / sj.onc.1203071. PMID 10597221. S2CID 12085482.
Prakobphol A, Xu F, Hoang VM, Larsson T, Bergstrom J, Johansson I, Frängsmyr L, Holmskov U, Leffler H, Nilsson C, Borén T, Wright JR, Strömberg N, Fisher SJ (2000). „Slinný aglutinin, který váže Streptococcus mutans a Helicobacter pylori, je protein vychytávající plíce na cysteiny gp-340“. J. Biol. Chem. 275 (51): 39860–6. doi:10,1074 / jbc.M006928200. PMID 11007786.
Ma JF, Takito J, Vijayakumar S, Peehl DM, Olsson CA, Al-Awqati Q (2001). „Prostatická exprese hensinu, proteinu podílejícího se na terminální diferenciaci epitelu“. Prostata. 49 (1): 9–18. doi:10,1002 / výhody 1113. PMID 11550206. S2CID 33550624.
Ligtenberg TJ, Bikker FJ, Groenink J, Tornoe I, Leth-Larsen R, Veerman EC, Nieuw Amerongen AV, Holmskov U (2001). „Lidský slinný aglutinin se váže na plicní povrchově aktivní protein-D a je totožný s proteinem receptoru mrchožroutů gp-340“. Biochem. J. 359 (Pt 1): 243–8. doi:10.1042/0264-6021:3590243. PMC 1222141. PMID 11563989.
Mollenhauer J, Herbertz S, Helmke B, Kollender G, Krebs I, Madsen J, Holmskov U, Sorger K, Schmitt L, Wiemann S, Otto HF, Gröne HJ, Poustka A (2001). „Deleted in Malignant Brain Tumors 1 je všestranná molekula podobná mucinu, která pravděpodobně bude hrát při rakovině trávicího traktu rozdílnou roli“. Cancer Res. 61 (24): 8880–6. PMID 11751412.
Bikker FJ, Ligtenberg AJ, van der Wal JE, van den Keijbus PA, Holmskov U, Veerman EC, Nieuw Amerongen AV (2002). "Imunohistochemická detekce slinného aglutininu / gp-340 v lidských příušních, submandibulárních a labiálních slinných žlázách". J. Dent. Res. 81 (2): 134–9. doi:10.1177/154405910208100210. PMID 11829014.
Sasaki H, Betensky RA, Cairncross JG, Louis DN (2002). "DMBT1 polymorfismy: vztah k malignímu gliomu tumorigenesis". Cancer Res. 62 (6): 1790–6. PMID 11912156.CS1 maint: používá parametr autoři (odkaz)
Schulz BL, Oxley D, Packer NH, Karlsson NG (2002). "Identifikace dvou vysoce sialylovaných lidských slzných tekutin DMBT1 izoforem: hlavních vysokomolekulárních glykoproteinů v lidských slzách". Biochem. J. 366 (Pt 2): 511–20. doi:10.1042 / BJ20011876. PMC 1222789. PMID 12015815.
Bikker FJ, Ligtenberg AJ, Nazmi K, Veerman EC, van't Hof W, Bolscher JG, Poustka A, Nieuw Amerongen AV, Mollenhauer J (2002). „Identifikace peptidové domény vázající bakterie na slinném aglutininu (gp-340 / DMBT1), člen superrodiny bohaté na cysteinové receptory“.. J. Biol. Chem. 277 (35): 32109–15. doi:10,1074 / jbc.M203788200. PMID 12050164.
Fan X, Muñoz J, Sanko SG, Castresana JS (2002). „Změny PTEN, DMBT1 a p16 v difúzně infiltrujících astrocytomech“. Int. J. Oncol. 21 (3): 667–74. doi:10,3892 / ijo.21.3.667. PMID 12168116.
Mueller W, Mollenhauer J, Stockhammer F, Poustka A, von Deimling A (2002). „Vzácné mutace genu DMBT1 v lidských astrocytárních gliomech“. Onkogen. 21 (38): 5956–9. doi:10.1038 / sj.onc.1205733. PMID 12185598.

Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000187908 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000047517 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9288095-5] Mollenhauer J, Wiemann S, Scheurlen W, Korn B, Hayashi Y, Wilgenbus KK, von Deimling A, Poustka A (říjen 1997). „DMBT1, nový člen superrodiny SRCR, na chromozomu 10q25.3-26.1 je odstraněn u maligních mozkových nádorů“. Nat. Genet. 17 (1): 32–9. doi:10.1038 / ng0997-32. PMID 9288095. S2CID 5274568.

[pmid17548659-6] Rosenstiel P, Sina C, End C, Renner M, Lyer S, Till A, Hellmig S, Nikolaus S, Fölsch UR, Helmke B, Autschbach F, Schirmacher P, Kioschis P, Hafner M, Poustka A, Mollenhauer J, Schreiber S (Červen 2007). „Regulace DMBT1 prostřednictvím NOD2 a TLR4 ve střevních epiteliálních buňkách moduluje bakteriální rozpoznávání a invazi“. J. Immunol. 178 (12): 8203–11. doi:10,4049 / jimmunol.178.12.8203. PMID 17548659.

[entrez-7] "Entrez Gene: DMBT1 odstraněn u maligních mozkových nádorů 1".

[8] Casella, Cinzia; Tuttolomondo, Martina; Høilund-Carlsen, Poul Flemming; Mollenhauer, Jan (01.01.2014). „Přirozené mechanismy rozpoznávání vzorů na epiteliálních bariérách a potenciální využití v nanomedicíně“. European Journal of Nanomedicine. 6 (3). doi:10.1515 / ejnm-2014-0020. ISSN 1662-596X. S2CID 84103470.

[:0-9] A ^b Tuttolomondo, Martina; Casella, Cinzia; Hansen, Pernille Lund; Polo, Ester; Herda, Luciana M .; Dawson, Kenneth A .; Ditzel, Henrik J .; Mollenhauer, Jan (2017). "Lidské peptidy prostupující buňky DMBT1 pro intracelulární dodávku siRNA". Molekulární terapie - nukleové kyseliny. 8: 264–276. doi:10.1016 / j.omtn.2017.06.020. ISSN 2162-2531. PMC 5514624. PMID 28918028.

[pmid10101009-10] Tino MJ, Wright JR (1999). „Glykoprotein-340 váže povrchově aktivní protein-A (SP-A) a stimuluje migraci alveolárních makrofágů způsobem nezávislým na SP-A“. Dopoledne. J. Respir. Cell Mol. Biol. 20 (4): 759–68. doi:10.1165 / ajrcmb.20.4.3439. PMID 10101009.

[pmid9153228-11] Holmskov U, Lawson P, Teisner B, Tornoe I, Willis AC, Morgan C, Koch C, Reid KB (1997). „Izolace a charakterizace nového člena superrodiny zachycovacího receptoru, glykoproteinu-340 (gp-340), jako molekuly vázající protein plicní surfaktant protein-D“. J. Biol. Chem. 272 (21): 13743–9. doi:10.1074 / jbc.272.21.13743. PMID 9153228.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]